MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	GTTT	2	8	3220	3227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020385	ATTT	2	8	3234	3241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020385	TATG	2	8	4735	4742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020385	GTAA	2	8	4761	4768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020385	ATAA	2	8	4798	4805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020385	TTTA	2	8	6375	6382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020385	TCAA	2	8	6596	6603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020385	AAAT	2	8	7323	7330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020385	GTCT	2	8	9145	9152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020385	AAAG	2	8	9830	9837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020385	GATA	2	8	9852	9859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020385	GTAA	2	8	9912	9919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020385	ATTT	2	8	10970	10977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020385	TTAT	2	8	11488	11495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020385	GAAT	2	8	11725	11732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020385	TTTA	2	8	11767	11774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020385	ATGT	2	8	12015	12022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020385	TGAA	2	8	12062	12069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020385	TTCA	2	8	13699	13706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020385	ATTT	2	8	13937	13944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020385	AAGG	2	8	14346	14353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020385	AATA	2	8	15215	15222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020385	AATT	2	8	16422	16429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020385	CATA	2	8	16572	16579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020385	TAGA	2	8	17162	17169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020385	TTAC	2	8	17794	17801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020385	CAAA	2	8	18400	18407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020385	ATTG	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020385	AGTA	2	8	20407	20414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020385	ATAA	2	8	23236	23243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020385	TCAT	2	8	23261	23268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020385	AATT	2	8	23271	23278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020385	TAAA	2	8	23382	23389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020385	TATT	2	8	23639	23646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020385	TATT	2	8	24397	24404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020385	AATT	2	8	24447	24454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020385	CTTT	2	8	24494	24501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020385	CAAC	2	8	24732	24739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020385	AGGA	2	8	24860	24867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020385	CTTA	2	8	24923	24930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020385	TATT	2	8	25034	25041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020385	TCTT	2	8	27207	27214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020385	TATT	2	8	27279	27286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020385	GAAT	2	8	27435	27442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020385	CGAT	3	12	27754	27765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020385	TTAT	2	8	35734	35741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020385	TCCT	2	8	35760	35767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020385	CAAA	2	8	36416	36423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020385	CTTA	2	8	37507	37514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020385	TACT	2	8	38659	38666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020385	CAAC	2	8	39083	39090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020385	AGGA	2	8	39211	39218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020385	TCCT	2	8	40709	40716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020385	AAGG	2	8	40863	40870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020385	AATT	2	8	41409	41416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020385	ACAA	2	8	47868	47875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020385	CAAC	2	8	48109	48116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020385	TTTG	2	8	48391	48398	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020385	ATAA	2	8	48739	48746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020385	TCTG	2	8	50755	50762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020385	GGAG	2	8	51711	51718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020385	ATCT	2	8	53122	53129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020385	TAAT	2	8	53827	53834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020385	AAAT	2	8	53985	53992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020385	GAAA	2	8	54050	54057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020385	AATA	2	8	54150	54157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020385	ATTG	2	8	54890	54897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020385	GTTT	2	8	55033	55040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020385	TATT	2	8	55592	55599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020385	TTAG	2	8	56065	56072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020385	TACT	2	8	58490	58497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020385	GTTT	2	8	58547	58554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020385	ATTT	2	8	58563	58570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020385	TAAA	2	8	59215	59222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020385	TGCC	2	8	59471	59478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020385	TTTG	2	8	59608	59615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020385	AAAG	2	8	59694	59701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020385	GACT	2	8	59721	59728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020385	TACA	2	8	60779	60786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020385	AAAT	2	8	60984	60991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020385	ATTT	2	8	61347	61354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020385	AAAC	2	8	65422	65429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020385	CTTA	2	8	65459	65466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020385	ATTA	2	8	66810	66817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020385	GTTT	2	8	66879	66886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020385	TTTC	2	8	66946	66953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020385	CTTT	2	8	68415	68422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020385	ATTT	2	8	77974	77981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020385	CAAT	2	8	78003	78010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020385	TATT	2	8	78051	78058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020385	GGAT	2	8	78292	78299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020385	CTAC	2	8	78468	78475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020385	CAAC	2	8	78553	78560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020385	AGGA	2	8	78681	78688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020385	TGTA	2	8	79592	79599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020385	GAAA	2	8	79605	79612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020385	ATTC	2	8	80675	80682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020385	TTGG	2	8	80706	80713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020385	TTAT	2	8	80859	80866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020385	CATT	2	8	82375	82382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020385	TGAG	2	8	82853	82860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020385	TAAA	2	8	83234	83241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020385	CGTA	2	8	86560	86567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020385	TAAT	2	8	86746	86753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020385	AATG	2	8	86890	86897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020385	AATA	2	8	87315	87322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020385	TAAT	2	8	89545	89552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020385	GAAA	2	8	89602	89609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020385	AGGG	2	8	92797	92804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020385	TTGT	2	8	94591	94598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020385	TGTA	2	8	95021	95028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020385	TAAA	2	8	96364	96371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020385	TTTG	2	8	98416	98423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020385	GGTA	2	8	98537	98544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020385	AGGA	2	8	98731	98738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020385	TATT	2	8	98946	98953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020385	ATAA	2	8	106028	106035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020385	TTGA	2	8	107562	107569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020385	CTAA	2	8	107602	107609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020385	CGAA	2	8	107682	107689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020385	TTTG	2	8	108029	108036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020385	AGTA	2	8	108183	108190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020385	ATAA	2	8	108826	108833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020385	TTGT	2	8	108889	108896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020385	TAAG	2	8	109220	109227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020385	TCTT	2	8	109536	109543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020385	ATGT	2	8	109615	109622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020385	AGAA	2	8	109642	109649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020385	CATT	2	8	111031	111038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020385	AGAA	2	8	114676	114683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020385	GAAA	2	8	115683	115690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020385	ATTC	2	8	117860	117867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020385	TCCT	2	8	119116	119123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020385	AATC	2	8	119804	119811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020385	AGAT	2	8	119897	119904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020385	TAAT	2	8	119923	119930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020385	ATAA	2	8	121767	121774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020385	GTAT	2	8	122713	122720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020385	TTTG	2	8	124334	124341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020385	ATGA	2	8	124346	124353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020385	ATGT	2	8	124398	124405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020385	AATG	2	8	124547	124554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020385	TTCC	2	8	125755	125762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020385	GGTT	2	8	125802	125809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020385	ATTT	2	8	127058	127065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020385	ATTT	2	8	128551	128558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020385	TAAA	2	8	128567	128574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020385	TCAT	2	8	128664	128671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020385	TAAA	2	8	128778	128785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020385	AAAT	2	8	129564	129571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020385	TACT	2	8	130946	130953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020385	AATT	2	8	134536	134543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020385	AGGC	2	8	135548	135555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020385	CATT	2	8	137004	137011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020385	CAAT	2	8	138581	138588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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370	NC_020385	AATT	2	8	323233	323240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.