MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	GCC	2	6	9	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020382	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020382	CTA	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020382	AAC	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020382	GTT	2	6	1817	1822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020382	CAG	2	6	1837	1842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020382	ACA	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020382	ATG	3	9	1956	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020382	ACT	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020382	ATG	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020382	GAT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020382	CAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020382	AAC	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020382	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020382	ATC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020382	GTT	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020382	TCA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020382	TTA	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020382	TAT	2	6	2397	2402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020382	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020382	GTT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020382	AGG	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020382	TAA	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020382	ATT	2	6	3345	3350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020382	ACC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020382	TAG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020382	ATA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020382	TAT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020382	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020382	AAT	2	6	5216	5221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020382	TAT	2	6	5916	5921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020382	AAC	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020382	TTC	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020382	TAA	2	6	6148	6153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020382	CAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020382	CAT	2	6	6220	6225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020382	TAA	2	6	6280	6285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020382	AGA	2	6	6628	6633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020382	GCC	2	6	6723	6728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020382	CAA	2	6	6942	6947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020382	ATT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020382	TTC	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020382	GGT	2	6	7383	7388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020382	AAG	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020382	ATA	3	9	9935	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020382	AAG	2	6	12627	12632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020382	CTT	2	6	12650	12655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020382	ATC	2	6	12675	12680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020382	TAA	2	6	12709	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020382	TAT	2	6	13512	13517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020382	TCC	2	6	13937	13942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020382	CTT	2	6	13959	13964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020382	TCC	2	6	15351	15356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020382	ATA	2	6	15774	15779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020382	TAT	2	6	15796	15801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020382	ATA	2	6	15943	15948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020382	TTA	2	6	16175	16180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020382	TAT	2	6	16231	16236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020382	ATT	2	6	16251	16256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020382	CTT	2	6	16423	16428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020382	CTC	2	6	18064	18069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020382	TAC	2	6	18082	18087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020382	TAT	2	6	18117	18122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020382	TAT	2	6	18188	18193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020382	TAA	3	9	18250	18258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020382	CCT	2	6	22065	22070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_020382	TAA	2	6	22111	22116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020382	AAT	2	6	22120	22125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020382	TAT	2	6	22315	22320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020382	ATT	2	6	22377	22382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020382	TTC	2	6	22503	22508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020382	GTA	2	6	22562	22567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020382	TAC	2	6	22584	22589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020382	TAA	2	6	23604	23609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020382	TTC	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020382	TTA	2	6	24791	24796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020382	GAA	2	6	24843	24848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020382	CTT	2	6	27264	27269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020382	CAT	2	6	27290	27295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020382	TAA	2	6	28119	28124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020382	GTT	2	6	28141	28146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020382	TTG	2	6	28151	28156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020382	AAC	2	6	28191	28196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020382	CCT	2	6	28993	28998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020382	ACA	2	6	29832	29837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020382	GAA	2	6	29866	29871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020382	ATA	3	9	30003	30011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020382	ATT	2	6	30459	30464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020382	TAT	2	6	30522	30527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020382	CTT	2	6	30565	30570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020382	TAT	2	6	30608	30613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020382	ATT	2	6	30671	30676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020382	TAA	2	6	30700	30705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020382	TAA	2	6	30776	30781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020382	ATA	2	6	30782	30787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020382	GAT	2	6	30806	30811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020382	GGA	2	6	31106	31111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020382	AAT	2	6	32019	32024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020382	ATT	2	6	33092	33097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020382	ATA	2	6	33114	33119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020382	CCT	2	6	34034	34039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020382	TAA	2	6	34064	34069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020382	ATT	2	6	34099	34104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020382	ATA	2	6	34409	34414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020382	TTA	2	6	34430	34435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020382	TTA	2	6	34438	34443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020382	TCC	2	6	42450	42455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_020382	TGG	2	6	42466	42471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020382	CCT	2	6	43960	43965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020382	ATT	2	6	43976	43981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020382	ACT	2	6	44587	44592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020382	TAA	2	6	44653	44658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020382	AGT	2	6	48170	48175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020382	TAA	2	6	48186	48191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020382	TCA	2	6	52283	52288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020382	TGC	2	6	52321	52326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020382	ATA	2	6	52329	52334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020382	AAT	2	6	52356	52361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020382	TTC	2	6	52413	52418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020382	CTT	2	6	56922	56927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020382	TTG	2	6	57393	57398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020382	TTA	2	6	57459	57464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020382	TTC	2	6	57753	57758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020382	AGA	2	6	58039	58044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020382	TAT	2	6	58057	58062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020382	GTT	2	6	58094	58099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020382	GTT	2	6	58562	58567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020382	AAT	2	6	59236	59241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020382	ATT	2	6	59253	59258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020382	TAA	2	6	59294	59299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020382	CTA	2	6	59577	59582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020382	AGG	2	6	59644	59649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020382	ATT	2	6	63334	63339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020382	GTA	2	6	63631	63636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020382	TAT	2	6	63648	63653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020382	ACT	2	6	64054	64059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020382	AAC	2	6	64680	64685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020382	TAT	2	6	64814	64819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020382	GAA	2	6	65519	65524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020382	TCC	2	6	66823	66828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020382	ATT	2	6	66962	66967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020382	GAA	2	6	66982	66987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020382	TTC	2	6	67004	67009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020382	CTT	2	6	67782	67787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020382	GTA	2	6	67905	67910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020382	TAC	3	9	67940	67948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020382	GAA	2	6	68514	68519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.