MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 1146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020376	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020376	TCGTG	2	10	10271	10280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020376	ATGGT	2	10	11029	11038	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020376	CTGAA	2	10	12792	12801	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020376	TGGAA	2	10	19819	19828	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020376	TAAAA	2	10	19975	19984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020376	TTTCC	2	10	21352	21361	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_020376	ATATT	2	10	21405	21414	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020376	TTTTA	2	10	21584	21593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020376	TATTT	2	10	28088	28097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020376	TTGTC	2	10	28170	28179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020376	TCGTG	2	10	29790	29799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020376	TTCAA	2	10	30333	30342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020376	ATGGT	2	10	30774	30783	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020376	CTGAA	2	10	32537	32546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020376	TCTAT	2	10	44192	44201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020376	ATAAG	2	10	71271	71280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020376	AATTA	2	10	74100	74109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020376	TCGTG	2	10	83069	83078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020376	ATGGT	2	10	83954	83963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020376	CTGAA	2	10	85717	85726	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020376	TCGTG	2	10	91880	91889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020376	ATGGT	2	10	92842	92851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020376	CTGAA	2	10	94606	94615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020376	TTTTA	2	10	95828	95837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020376	AGTGA	2	10	100777	100786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020376	TATGA	2	10	103303	103312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020376	ATATA	2	10	105278	105287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020376	AAAGA	2	10	116062	116071	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020376	TAAAA	2	10	125714	125723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020376	AATCC	2	10	125724	125733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020376	CATGG	2	10	129471	129480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020376	GGGCT	2	10	150083	150092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020376	TCGTG	2	10	155265	155274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020376	ATGGT	2	10	156023	156032	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020376	CTGAA	2	10	157787	157796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020376	ATTAT	2	10	173435	173444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020376	TGGAA	2	10	173469	173478	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020376	AAAAG	2	10	181284	181293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020376	AAAAG	2	10	198313	198322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020376	ATGGA	2	10	198334	198343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020376	AAAGG	2	10	198369	198378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020376	TTCTT	2	10	201906	201915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020376	GTAAT	2	10	209464	209473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020376	ATTAC	2	10	210165	210174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020376	TGTAA	2	10	210202	210211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020376	ACGTT	2	10	225410	225419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020376	TAAAA	2	10	229801	229810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020376	CATTT	2	10	232722	232731	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020376	TGTTT	2	10	241962	241971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020376	GATAA	2	10	246813	246822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020376	TCGTG	2	10	248251	248260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020376	ATGGT	2	10	249009	249018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020376	CTGAA	2	10	250773	250782	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020376	AAGAA	2	10	252135	252144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020376	ATGAG	2	10	259154	259163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020376	TCGTG	2	10	271368	271377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020376	ATGGT	2	10	272304	272313	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020376	CTGAA	2	10	274067	274076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020376	TATTT	2	10	275377	275386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020376	AAGAT	2	10	275391	275400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020376	TCGTG	2	10	278778	278787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020376	ATGGT	2	10	279712	279721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020376	CTGAA	2	10	281476	281485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020376	TATGC	2	10	287961	287970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020376	GAAAA	2	10	292876	292885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020376	TAAAA	2	10	293052	293061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020376	TCGTG	2	10	294368	294377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020376	ATGGT	2	10	295318	295327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020376	CTGAA	2	10	297082	297091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020376	TCGTG	2	10	301712	301721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020376	TTCAA	2	10	302255	302264	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020376	ATGGT	2	10	302665	302674	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020376	CTGAA	2	10	304429	304438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020376	AAATA	2	10	332574	332583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020376	TTTTA	2	10	333679	333688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020376	GAAAA	2	10	335424	335433	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020376	TTTTA	2	10	344267	344276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020376	AGAAA	2	10	345162	345171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020376	TGGAG	2	10	353512	353521	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020376	GTTTG	2	10	365049	365058	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020376	ATATG	2	10	378188	378197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020376	TAAAG	2	10	378778	378787	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020376	TGAAT	2	10	381197	381206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020376	ATAGT	2	10	381213	381222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020376	ATGCA	2	10	385454	385463	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020376	GTATT	2	10	386868	386877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020376	TATTT	2	10	389056	389065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020376	AATAA	2	10	424445	424454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020376	AGAAT	2	10	427576	427585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020376	TTTAA	2	10	457925	457934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020376	AATCT	2	10	461625	461634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020376	AACTT	2	10	463015	463024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020376	TTTTA	2	10	463425	463434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020376	TTCAT	2	10	473589	473598	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020376	AATTA	2	10	483544	483553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020376	CACCC	2	10	497063	497072	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_020376	GAAAA	2	10	499471	499480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020376	TTAAT	2	10	500902	500911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020376	AGATA	2	10	520379	520388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020376	AGGAG	2	10	520399	520408	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020376	TCGTG	2	10	521780	521789	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020376	ATGGT	2	10	522538	522547	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020376	CTGAA	2	10	524301	524310	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020376	TTTTA	2	10	526467	526476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020376	TAATT	2	10	526488	526497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020376	TTTTC	2	10	526910	526919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020376	TCTTT	2	10	527354	527363	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_020376	ATTAT	2	10	527480	527489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020376	TATAA	2	10	527527	527536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020376	GTTTC	2	10	531351	531360	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020376	ATAAA	2	10	534159	534168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020376	ACAAT	2	10	538805	538814	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020376	ACTTT	2	10	549251	549260	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020376	TATAT	2	10	549274	549283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020376	GAAGA	2	10	567179	567188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020376	AAGAG	2	10	578560	578569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020376	TCTCC	2	10	580290	580299	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_020376	TTTAT	2	10	582380	582389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020376	AGCTT	2	10	582413	582422	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020376	GTCAT	2	10	584880	584889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020376	TGTTT	2	10	586140	586149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020376	AAGTA	2	10	592865	592874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020376	ACAAA	2	10	594332	594341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020376	AATAA	2	10	598980	598989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020376	TGAAG	2	10	600660	600669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020376	AAAAG	2	10	615092	615101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020376	GAAAA	2	10	616199	616208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020376	AAAAT	2	10	618013	618022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020376	TATAA	2	10	618092	618101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020376	TGAAA	2	10	618147	618156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020376	GAAAA	2	10	631404	631413	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020376	GAAAA	2	10	637430	637439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020376	GTTAC	2	10	645360	645369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020376	CTTTT	2	10	657416	657425	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020376	AGATG	2	10	657486	657495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020376	TAAAA	2	10	665257	665266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020376	GGAAA	2	10	684522	684531	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020376	AAAAG	2	10	691332	691341	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020376	AAAAT	2	10	691413	691422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020376	AAATA	2	10	704275	704284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020376	AAGAA	2	10	705863	705872	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020376	AGGAA	2	10	707024	707033	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020376	AAAGC	2	10	707299	707308	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020376	TTATA	2	10	727431	727440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020376	ATGGA	2	10	728144	728153	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020376	AAATA	2	10	737252	737261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020376	TGCTT	2	10	749152	749161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_020376	TTTTA	2	10	940341	940350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_020376	AAATT	2	10	958412	958421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_020376	TCTTT	2	10	978962	978971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
195	NC_020376	AACAG	2	10	980892	980901	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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248	NC_020376	TGTAC	2	10	1176852	1176861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_020376	GTAAC	2	10	1224621	1224630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_020376	TAATC	2	10	1274952	1274961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_020376	CCTCA	2	10	1304652	1304661	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
271	NC_020376	AATTT	2	10	1305674	1305683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020376	TAAAA	2	10	1329520	1329529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_020376	AAGGG	2	10	1378443	1378452	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020376	TATTG	2	10	1381650	1381659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020376	GTAAA	2	10	1381698	1381707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020376	GCTAA	2	10	1383939	1383948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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