MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 24175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020376	CGC	2	6	278104	278109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_020376	GTGA	2	8	278110	278117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020376	TGT	2	6	278143	278148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020376	GAA	2	6	278153	278158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020376	CAG	2	6	278226	278231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020376	ATT	2	6	278267	278272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020376	GC	4	8	278282	278289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_020376	GGT	2	6	278291	278296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020376	AGA	2	6	278367	278372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020376	GGA	2	6	278417	278422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020376	GAA	2	6	278681	278686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020376	GGT	2	6	278755	278760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020376	GTC	2	6	278769	278774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_020376	TCGTG	2	10	278778	278787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_020376	CAT	2	6	278837	278842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020376	GGA	2	6	278881	278886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020376	ATC	2	6	278905	278910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020376	AC	3	6	278932	278937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_020376	AC	3	6	279101	279106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_020376	CAC	2	6	279116	279121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_020376	AGCC	2	8	279164	279171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_020376	GAT	2	6	279187	279192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020376	CCT	2	6	279243	279248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_020376	TGA	2	6	279262	279267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020376	TCA	2	6	279275	279280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_020376	AGCC	2	8	279342	279349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_020376	GAT	2	6	279365	279370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020376	CCT	2	6	279420	279425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_020376	TGA	2	6	279439	279444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020376	TCA	2	6	279452	279457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_020376	GA	3	6	279492	279497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020376	TC	3	6	279502	279507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_020376	AT	3	6	279508	279513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020376	ATGT	2	8	279516	279523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020376	T	6	6	279555	279560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020376	GTAA	2	8	279660	279667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020376	ATGGT	2	10	279712	279721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020376	AGAC	2	8	279750	279757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_020376	GGA	2	6	279785	279790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020376	GCG	2	6	279819	279824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_020376	CGT	2	6	279932	279937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_020376	AAC	2	6	279945	279950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020376	TC	3	6	279970	279975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_020376	CGG	2	6	279994	279999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020376	GGA	2	6	280026	280031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020376	CACG	2	8	280356	280363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_020376	GT	3	6	280629	280634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020376	AGC	2	6	280688	280693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020376	ACC	2	6	280766	280771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_020376	TGG	2	6	280847	280852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020376	ACA	2	6	280997	281002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_020376	ACC	2	6	281018	281023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_020376	AGA	2	6	281061	281066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020376	GAG	2	6	281248	281253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020376	GA	3	6	281271	281276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020376	CT	3	6	281388	281393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_020376	CTGAA	2	10	281476	281485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1558	NC_020376	CGG	2	6	281497	281502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020376	TGG	2	6	281759	281764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020376	CCT	2	6	281855	281860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_020376	GGT	2	6	281991	281996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020376	CGT	2	6	282186	282191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_020376	CGT	2	6	282212	282217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_020376	GAG	2	6	282235	282240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020376	GTT	2	6	282289	282294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020376	C	6	6	282362	282367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1567	NC_020376	GAT	2	6	282413	282418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020376	ATA	2	6	282495	282500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020376	TGA	2	6	282548	282553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020376	AG	3	6	282558	282563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020376	CT	3	6	282600	282605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_020376	AT	3	6	283045	283050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020376	TTAT	2	8	283055	283062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020376	GAA	2	6	283067	283072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020376	AATA	2	8	283247	283254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020376	GGT	2	6	283292	283297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020376	TTG	2	6	285970	285975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020376	TTC	2	6	285984	285989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_020376	TGG	2	6	285993	285998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020376	T	8	8	286037	286044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020376	GTAT	2	8	286048	286055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020376	CTTA	2	8	286073	286080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_020376	AG	3	6	286084	286089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020376	AT	3	6	286104	286109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020376	TA	3	6	287060	287065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020376	CAA	2	6	287847	287852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_020376	AAT	2	6	287917	287922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020376	TATGC	2	10	287961	287970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_020376	T	7	7	288817	288823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020376	TGTA	2	8	288834	288841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020376	T	7	7	288846	288852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020376	AT	3	6	288884	288889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020376	AACA	2	8	288989	288996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_020376	AAG	2	6	289006	289011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020376	AAT	2	6	289015	289020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020376	AG	3	6	289082	289087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020376	ATA	2	6	290875	290880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020376	CCT	2	6	292772	292777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_020376	TTA	2	6	292782	292787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020376	TTG	2	6	292803	292808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020376	AGA	2	6	292820	292825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020376	TA	4	8	292835	292842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020376	G	7	7	292864	292870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020376	GAAAA	2	10	292876	292885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020376	A	6	6	292882	292887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020376	TAT	2	6	292888	292893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020376	AT	4	8	292899	292906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020376	CATT	2	8	292920	292927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_020376	AGTATT	2	12	292937	292948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020376	AG	3	6	292954	292959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020376	ATAC	2	8	292985	292992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_020376	AG	3	6	293026	293031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020376	TAAAA	2	10	293052	293061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020376	A	6	6	293058	293063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020376	AGT	2	6	293214	293219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020376	AAAC	2	8	293237	293244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_020376	ATTTTT	2	12	293259	293270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020376	AACT	2	8	293283	293290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_020376	GGC	2	6	293328	293333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020376	AAG	2	6	293381	293386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020376	GCG	2	6	293390	293395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_020376	ATA	2	6	293468	293473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020376	GGC	2	6	293501	293506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_020376	ATGG	2	8	293521	293528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020376	GCA	2	6	293648	293653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_020376	CGC	2	6	293695	293700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_020376	GTGA	2	8	293701	293708	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020376	TGT	2	6	293734	293739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020376	GAA	2	6	293744	293749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020376	TAA	2	6	293761	293766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020376	CAG	2	6	293816	293821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_020376	ATT	2	6	293857	293862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020376	GC	4	8	293872	293879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_020376	GGT	2	6	293881	293886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020376	AGA	2	6	293957	293962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_020376	GAA	2	6	294271	294276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1768	NC_020376	GGA	2	6	302979	302984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_020376	CACG	2	8	303309	303316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1770	NC_020376	GT	3	6	303582	303587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1771	NC_020376	AGC	2	6	303641	303646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_020376	AT	3	6	366360	366365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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