MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 8107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019908	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019908	CCT	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019908	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019908	TAT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019908	TTA	3	9	1586	1594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019908	ATA	2	6	1598	1603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019908	TCT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019908	ATT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019908	ATT	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019908	AAT	2	6	1809	1814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019908	TAG	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019908	ATT	2	6	4815	4820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019908	TCA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019908	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019908	ATT	2	6	5971	5976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019908	TTA	2	6	6411	6416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019908	TGA	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019908	GAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019908	TTA	2	6	8073	8078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019908	ATA	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019908	AGA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019908	TGT	2	6	8134	8139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019908	ATA	3	9	8145	8153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019908	TAT	2	6	8238	8243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019908	GAT	2	6	8255	8260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019908	TAT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019908	GAA	2	6	8336	8341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019908	TAA	2	6	8362	8367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019908	ATA	2	6	8394	8399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019908	ATA	2	6	8412	8417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019908	GTA	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019908	CTT	2	6	8912	8917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019908	CGC	2	6	8925	8930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019908	AAG	2	6	8952	8957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019908	GAT	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019908	ATC	2	6	9163	9168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019908	TAA	3	9	9238	9246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019908	TCT	2	6	9261	9266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019908	AAC	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019908	TAT	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019908	AGA	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019908	CAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019908	TAC	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019908	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019908	GAT	2	6	9727	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019908	CAG	2	6	9735	9740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019908	CAG	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019908	CTT	2	6	9870	9875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019908	AGC	2	6	9928	9933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019908	ATA	2	6	10033	10038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019908	ACT	2	6	10061	10066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019908	AGC	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019908	AGC	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019908	GTA	2	6	10435	10440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019908	ATC	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019908	GCC	2	6	10509	10514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019908	GTG	2	6	10548	10553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019908	AGG	2	6	10659	10664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019908	CTA	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019908	CCG	2	6	10735	10740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019908	ATA	2	6	10748	10753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019908	AGC	2	6	10791	10796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019908	TAT	2	6	10812	10817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019908	CCG	2	6	10819	10824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019908	ATA	2	6	10844	10849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019908	CAA	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019908	TAG	3	9	10862	10870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019908	AAT	2	6	10879	10884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019908	CTC	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019908	ATC	2	6	10909	10914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019908	AGC	2	6	10962	10967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019908	ATA	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019908	ATA	2	6	11038	11043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019908	ATA	2	6	11066	11071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019908	TAG	2	6	11129	11134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019908	TAT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019908	TCT	2	6	11368	11373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019908	TAA	2	6	11382	11387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019908	TAT	2	6	11424	11429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019908	AAT	2	6	11444	11449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019908	TAA	2	6	11455	11460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019908	ATT	2	6	13898	13903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019908	CAA	2	6	13980	13985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019908	TAA	2	6	14018	14023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019908	CAT	2	6	14078	14083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019908	ATA	2	6	14093	14098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019908	ATA	2	6	14113	14118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019908	AAT	2	6	14122	14127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019908	AAT	2	6	14159	14164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019908	TAA	2	6	15147	15152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019908	ATT	2	6	15175	15180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019908	AAC	2	6	15276	15281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019908	TTA	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019908	TAT	2	6	15959	15964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019908	AAT	2	6	15975	15980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019908	ATG	2	6	15997	16002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019908	ACA	2	6	16012	16017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019908	TAT	2	6	16041	16046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019908	AAT	2	6	20225	20230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019908	ATT	2	6	20635	20640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019908	AAT	2	6	21102	21107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019908	TAA	2	6	21147	21152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019908	ATA	2	6	21166	21171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019908	AAT	2	6	23693	23698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019908	ATT	2	6	28750	28755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019908	TAA	2	6	29407	29412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019908	TAA	2	6	29957	29962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019908	TAT	2	6	30517	30522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019908	TAT	2	6	30529	30534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019908	ATT	2	6	31775	31780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019908	ACA	2	6	32182	32187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019908	ATT	2	6	32267	32272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019908	ATT	2	6	33867	33872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019908	TAA	2	6	35483	35488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019908	GTT	2	6	35523	35528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019908	TAT	2	6	35843	35848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019908	TTA	2	6	35899	35904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019908	ATT	2	6	35984	35989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019908	CAA	2	6	36001	36006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019908	TTA	2	6	36024	36029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019908	TCA	2	6	36042	36047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019908	TCT	2	6	36136	36141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019908	CTT	2	6	36237	36242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019908	TTA	2	6	36297	36302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019908	ATA	2	6	36338	36343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019908	TAA	2	6	36362	36367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019908	TAG	2	6	36381	36386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019908	GGC	2	6	39336	39341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019908	ATA	2	6	39382	39387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019908	ATT	2	6	39391	39396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019908	TTA	2	6	39435	39440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019908	TAT	3	9	39441	39449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019908	ATG	2	6	39764	39769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019908	ATT	2	6	39773	39778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019908	TAT	2	6	39779	39784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019908	ATT	2	6	39799	39804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019908	TAA	2	6	39840	39845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019908	TAT	2	6	39852	39857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019908	TAA	2	6	39909	39914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019908	ATT	2	6	39917	39922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019908	ATG	2	6	39974	39979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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