MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 5884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019842	ACA	2	6	39	44	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019842	CAA	2	6	81	86	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019842	TTG	2	6	245	250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019842	CTA	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019842	AGG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019842	CTA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019842	TAC	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019842	TAT	2	6	1913	1918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019842	AGG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019842	TGC	2	6	3085	3090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019842	TCA	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019842	CTA	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019842	ATT	2	6	6967	6972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019842	GAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019842	TGT	2	6	9557	9562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019842	ACT	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019842	GGC	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019842	GCG	2	6	9857	9862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019842	CGA	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019842	GCA	2	6	10116	10121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019842	CGC	2	6	10163	10168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019842	TGT	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019842	GAA	2	6	10212	10217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019842	GGC	2	6	10236	10241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019842	CAG	2	6	10285	10290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019842	ATT	2	6	10326	10331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019842	AGA	2	6	10426	10431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019842	GGA	2	6	10476	10481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019842	GAG	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019842	TGC	2	6	10621	10626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019842	GAA	2	6	10740	10745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019842	GGT	2	6	10814	10819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019842	GTC	2	6	10828	10833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019842	GGA	2	6	10940	10945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019842	ATC	2	6	10964	10969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019842	CAC	2	6	11175	11180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019842	GAT	2	6	11229	11234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019842	CCT	2	6	11285	11290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_019842	GGT	2	6	11442	11447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019842	CCA	2	6	11464	11469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019842	AGG	2	6	11524	11529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019842	CCA	2	6	11554	11559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019842	CAC	2	6	11770	11775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019842	GGA	2	6	11855	11860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019842	GCG	2	6	11889	11894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019842	AGG	2	6	12007	12012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019842	CGG	2	6	12063	12068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019842	GGA	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019842	AGT	2	6	12216	12221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019842	AGA	2	6	12297	12302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019842	AGC	2	6	12758	12763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019842	TTC	2	6	12856	12861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019842	ACC	2	6	13084	13089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019842	AGG	2	6	13119	13124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019842	TAG	2	6	13227	13232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019842	GAG	2	6	13314	13319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019842	CGG	2	6	13573	13578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019842	TAC	2	6	13842	13847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019842	CGC	2	6	13872	13877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019842	CCT	2	6	13930	13935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019842	GGT	2	6	14066	14071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019842	CGT	2	6	14261	14266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019842	GAG	2	6	14310	14315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019842	GTT	2	6	14364	14369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019842	GAT	2	6	14488	14493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019842	TGG	2	6	14622	14627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019842	CGC	2	6	14725	14730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019842	TCA	2	6	14757	14762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019842	ATA	2	6	15818	15823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019842	TGT	2	6	17396	17401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019842	TGA	2	6	18819	18824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019842	ATT	2	6	18864	18869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019842	GTG	2	6	20603	20608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019842	GTT	2	6	20804	20809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019842	TAT	2	6	23445	23450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019842	GGA	2	6	23464	23469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019842	TCC	2	6	23547	23552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019842	TCC	2	6	24967	24972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019842	CCT	2	6	26360	26365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019842	CTG	2	6	26979	26984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019842	AAG	2	6	27026	27031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019842	CAT	2	6	27570	27575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019842	GCA	2	6	27778	27783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019842	AGG	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019842	TCT	2	6	30922	30927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019842	ATT	2	6	31235	31240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019842	GGT	2	6	31260	31265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019842	TGA	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019842	GTT	2	6	31322	31327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019842	GCG	2	6	31374	31379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019842	ACT	2	6	31471	31476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019842	GGC	2	6	31514	31519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019842	GCG	2	6	31574	31579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019842	CGA	2	6	31759	31764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019842	GCA	2	6	31833	31838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019842	CGC	2	6	31880	31885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019842	TGT	2	6	31919	31924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019842	GAA	2	6	31929	31934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019842	GGC	2	6	31953	31958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019842	CAG	2	6	32002	32007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019842	ATT	2	6	32043	32048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019842	AGA	2	6	32143	32148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019842	GGA	2	6	32193	32198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019842	GAG	2	6	32241	32246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019842	TGC	2	6	32338	32343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019842	GAA	2	6	32457	32462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019842	GGT	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019842	GTC	2	6	32545	32550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019842	GGA	2	6	32657	32662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019842	ATC	2	6	32681	32686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019842	CAC	2	6	32892	32897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019842	GAT	2	6	32963	32968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019842	TTC	2	6	33014	33019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019842	TGT	2	6	33024	33029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019842	CAC	2	6	33234	33239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019842	GGA	2	6	33319	33324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019842	GCG	2	6	33353	33358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019842	AGG	2	6	33471	33476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019842	CGG	2	6	33527	33532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019842	GGA	2	6	33559	33564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019842	AGT	2	6	33680	33685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019842	AGA	2	6	33761	33766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019842	AGC	2	6	34222	34227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019842	TTC	2	6	34320	34325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019842	ACA	2	6	34527	34532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019842	ACC	2	6	34548	34553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019842	AGG	2	6	34583	34588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019842	TAG	2	6	34691	34696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019842	GAG	2	6	34778	34783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019842	CGG	2	6	35038	35043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019842	TAC	2	6	35291	35296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019842	CGC	2	6	35321	35326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019842	CCT	2	6	35379	35384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019842	GGT	2	6	35515	35520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019842	CGT	2	6	35688	35693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019842	GAG	2	6	35737	35742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019842	GTT	2	6	35791	35796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019842	GAT	2	6	35915	35920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019842	TGG	2	6	36049	36054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019842	CGC	2	6	36152	36157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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