MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 11809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019842	ACAAG	2	10	203600	203609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_019842	ATA	2	6	203620	203625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019842	ATG	2	6	203637	203642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019842	A	6	6	203653	203658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019842	CGG	2	6	203820	203825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019842	TTC	2	6	203867	203872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019842	A	7	7	203921	203927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019842	TTC	2	6	203970	203975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019842	AGG	2	6	203994	203999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019842	TTA	2	6	205829	205834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019842	T	6	6	205845	205850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019842	ATAC	2	8	205867	205874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_019842	TA	3	6	205903	205908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019842	ATGC	2	8	205992	205999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_019842	TCA	2	6	206001	206006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_019842	TCA	2	6	206031	206036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_019842	TA	3	6	206048	206053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019842	AATC	2	8	206059	206066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_019842	A	6	6	206090	206095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019842	AAC	2	6	206165	206170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019842	T	6	6	206172	206177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019842	AAT	2	6	206179	206184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019842	A	7	7	206199	206205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019842	ACA	2	6	206212	206217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019842	ACA	2	6	207766	207771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019842	GCAG	2	8	207813	207820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_019842	CCGC	2	8	207821	207828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1028	NC_019842	TTC	2	6	207843	207848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_019842	AATC	2	8	207881	207888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_019842	GT	3	6	207929	207934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019842	ATC	2	6	207972	207977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019842	TG	3	6	208000	208005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019842	TTC	2	6	208041	208046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019842	ATG	2	6	208051	208056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019842	CTTGG	2	10	208073	208082	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_019842	GGT	2	6	208095	208100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019842	AG	3	6	208269	208274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019842	TTTC	2	8	208337	208344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_019842	TTTATT	2	12	208419	208430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019842	CTT	2	6	208462	208467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_019842	GTGAAA	2	12	208507	208518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019842	ATGA	2	8	208601	208608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019842	TGA	2	6	208632	208637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019842	AGGCTG	2	12	208655	208666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1045	NC_019842	ATA	2	6	208688	208693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019842	AT	3	6	208718	208723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019842	TCC	2	6	208741	208746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_019842	CAT	2	6	208757	208762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_019842	ATG	2	6	208777	208782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019842	CAT	2	6	208842	208847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019842	A	6	6	210041	210046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019842	ATG	2	6	210055	210060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019842	CCT	2	6	210939	210944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_019842	ATT	2	6	210961	210966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019842	ATA	2	6	210981	210986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019842	GGAA	2	8	210989	210996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019842	GAT	2	6	211001	211006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019842	A	6	6	211016	211021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019842	AGC	2	6	212133	212138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019842	AT	3	6	212184	212189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019842	AT	3	6	212203	212208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019842	TAT	2	6	212258	212263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019842	TGT	2	6	212278	212283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019842	AG	3	6	212791	212796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019842	ATA	2	6	212826	212831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019842	GCA	2	6	212885	212890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_019842	TAT	2	6	212893	212898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019842	TTG	2	6	212945	212950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019842	A	7	7	212976	212982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019842	TAT	2	6	213006	213011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019842	TA	3	6	213035	213040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019842	ATT	2	6	213119	213124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019842	AT	3	6	213129	213134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019842	AGG	2	6	213148	213153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019842	CT	3	6	214560	214565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_019842	A	7	7	214611	214617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_019842	CTC	2	6	217155	217160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_019842	TC	3	6	217159	217164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_019842	TGC	2	6	217274	217279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019842	GCT	2	6	220562	220567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_019842	AGG	2	6	220838	220843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019842	GCC	2	6	221332	221337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_019842	TC	3	6	221360	221365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_019842	AGGG	2	8	221392	221399	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019842	CGG	2	6	221666	221671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019842	T	6	6	221681	221686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019842	ATC	2	6	221711	221716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019842	GGA	2	6	221756	221761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019842	GCC	2	6	222474	222479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_019842	AGT	2	6	222802	222807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019842	AAT	2	6	222896	222901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019842	AT	3	6	222909	222914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019842	TAA	2	6	224581	224586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019842	T	6	6	224614	224619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019842	A	8	8	224628	224635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019842	CAT	2	6	224645	224650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019842	TTC	2	6	225561	225566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_019842	TGT	2	6	225643	225648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019842	TCC	2	6	226992	226997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_019842	ATG	2	6	227017	227022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019842	TATG	2	8	227023	227030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019842	TCCTT	2	10	227033	227042	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_019842	TCCA	2	8	227108	227115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_019842	T	7	7	227199	227205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019842	AATA	2	8	227207	227214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019842	CGG	2	6	227568	227573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019842	CT	3	6	227606	227611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_019842	CTT	2	6	229075	229080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019842	G	6	6	229165	229170	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019842	ATA	2	6	229183	229188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019842	A	7	7	229188	229194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019842	TCC	2	6	229646	229651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_019842	TTCA	2	8	231917	231924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_019842	AGT	3	9	232121	232129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019842	AGGA	3	12	232241	232252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019842	GCT	2	6	232733	232738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019842	CAT	2	6	232827	232832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_019842	A	6	6	232915	232920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019842	AT	4	8	233477	233484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019842	GA	3	6	233500	233505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019842	ATCT	2	8	234590	234597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_019842	T	6	6	234606	234611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019842	AGGG	2	8	234645	234652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019842	T	6	6	235859	235864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019842	TA	3	6	235877	235882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019842	CAT	2	6	236009	236014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019842	TCAT	2	8	236023	236030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_019842	A	6	6	236125	236130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019842	AGATT	2	10	236142	236151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019842	TAA	2	6	236176	236181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019842	GCT	2	6	238118	238123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_019842	T	6	6	238128	238133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019842	GAA	2	6	238437	238442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019842	CGGA	2	8	238449	238456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_019842	TAG	2	6	238491	238496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019842	ACC	2	6	239515	239520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_019842	GGT	2	6	239526	239531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_019842	T	6	6	239533	239538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_019842	GAA	2	6	313009	313014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_019842	A	6	6	322401	322406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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