MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019382	GAT	2	6	1409273	1409278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_019382	GAC	2	6	1409294	1409299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019382	CGAT	2	8	1409421	1409428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_019382	CTT	2	6	1409479	1409484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_019382	AAG	2	6	1409505	1409510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019382	GGC	2	6	1409520	1409525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_019382	TTG	2	6	1409529	1409534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019382	CATTC	2	10	1409588	1409597	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3509	NC_019382	CCT	2	6	1409603	1409608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_019382	CCG	2	6	1409654	1409659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_019382	CGC	2	6	1409850	1409855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_019382	CTG	2	6	1409859	1409864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_019382	CAGC	2	8	1409867	1409874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_019382	GCC	2	6	1409875	1409880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_019382	CGC	2	6	1409887	1409892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_019382	CCCCTT	2	12	1409925	1409936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_019382	GCT	2	6	1409943	1409948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_019382	GGA	2	6	1409985	1409990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_019382	TGG	2	6	1410041	1410046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019382	CCT	2	6	1410951	1410956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_019382	CGG	2	6	1410975	1410980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019382	CTT	2	6	1411020	1411025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_019382	GGTT	2	8	1411098	1411105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_019382	GCC	2	6	1411147	1411152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_019382	AC	3	6	1411192	1411197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_019382	CGC	2	6	1411235	1411240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_019382	GCC	2	6	1411658	1411663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_019382	AAT	2	6	1411682	1411687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_019382	CTTT	2	8	1412170	1412177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_019382	CA	3	6	1412196	1412201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_019382	GT	3	6	1412206	1412211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019382	TTCT	2	8	1412212	1412219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_019382	CA	3	6	1412231	1412236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_019382	GT	3	6	1412239	1412244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019382	TCC	2	6	1412248	1412253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_019382	CAC	2	6	1412262	1412267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_019382	GCA	2	6	1412270	1412275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_019382	GC	3	6	1412324	1412329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_019382	GAT	2	6	1412352	1412357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_019382	TGC	2	6	1412377	1412382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_019382	GCC	2	6	1412422	1412427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_019382	TTG	2	6	1412451	1412456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019382	CAA	2	6	1412485	1412490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_019382	TGA	2	6	1412562	1412567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_019382	CG	3	6	1412635	1412640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_019382	CG	3	6	1412680	1412685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_019382	CG	3	6	1412785	1412790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_019382	CG	3	6	1412800	1412805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_019382	CG	3	6	1412845	1412850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_019382	CG	3	6	1412890	1412895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_019382	CG	3	6	1412905	1412910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_019382	CG	3	6	1413025	1413030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_019382	CG	3	6	1413130	1413135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_019382	CG	3	6	1413145	1413150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_019382	CG	3	6	1413190	1413195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_019382	GC	4	8	1413295	1413302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_019382	CG	3	6	1413303	1413308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_019382	GGC	2	6	1413388	1413393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_019382	GCTG	2	8	1413439	1413446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_019382	GGCG	2	8	1413459	1413466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_019382	GCCG	2	8	1413508	1413515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_019382	GAT	2	6	1413516	1413521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_019382	CTT	2	6	1413552	1413557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_019382	GCA	2	6	1413603	1413608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_019382	GCG	2	6	1416697	1416702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_019382	CCA	2	6	1416706	1416711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_019382	GGA	2	6	1416714	1416719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019382	GCC	2	6	1416730	1416735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_019382	CAC	2	6	1416755	1416760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_019382	CAAC	2	8	1416787	1416794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_019382	AAGA	2	8	1416827	1416834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019382	CCG	2	6	1416925	1416930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_019382	GAC	2	6	1416980	1416985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_019382	GGA	2	6	1417108	1417113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_019382	GGT	3	9	1417159	1417167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_019382	CCA	2	6	1417191	1417196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_019382	TGG	2	6	1417239	1417244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_019382	CGC	2	6	1417254	1417259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_019382	CCGACG	2	12	1417260	1417271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_019382	GGCC	2	8	1417301	1417308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_019382	CGG	3	9	1417309	1417317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_019382	CTCC	2	8	1417319	1417326	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3587	NC_019382	AGA	2	6	1417370	1417375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_019382	CG	5	10	1417411	1417420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3591	NC_019382	ATCGC	2	10	1417765	1417774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3592	NC_019382	TGG	2	6	1417858	1417863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_019382	CGGCG	2	10	1417916	1417925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3595	NC_019382	TGCGC	2	10	1417967	1417976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3596	NC_019382	CGA	2	6	1418018	1418023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_019382	CG	3	6	1418045	1418050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_019382	TCA	2	6	1418056	1418061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_019382	CGGG	2	8	1418088	1418095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_019382	ACC	2	6	1418289	1418294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_019382	AAC	2	6	1418298	1418303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_019382	GCC	2	6	1418304	1418309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_019382	GGC	2	6	1418312	1418317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3605	NC_019382	CG	4	8	1418375	1418382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_019382	GCT	3	9	1418405	1418413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3609	NC_019382	ACCA	2	8	1418496	1418503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3611	NC_019382	CCG	2	6	1418521	1418526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_019382	GC	3	6	1418534	1418539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_019382	CGA	2	6	1418687	1418692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_019382	CCA	2	6	1418971	1418976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_019382	GAA	2	6	1419029	1419034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3625	NC_019382	GGC	2	6	1419092	1419097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_019382	GCCAC	2	10	1419126	1419135	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3627	NC_019382	CGG	2	6	1419184	1419189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3629	NC_019382	CGC	2	6	1419293	1419298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_019382	GCG	2	6	1419317	1419322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_019382	GAC	2	6	1419345	1419350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3752	NC_019382	CAAGG	2	10	1478013	1478022	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3760	NC_019382	CCGG	2	8	1480375	1480382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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