MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019382	GCG	2	6	1248575	1248580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_019382	CG	3	6	1248593	1248598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_019382	GCC	2	6	1248623	1248628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_019382	GCA	2	6	1248640	1248645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_019382	GCG	2	6	1248683	1248688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_019382	GC	4	8	1248723	1248730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_019382	CAG	2	6	1248731	1248736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_019382	GCA	3	9	1248808	1248816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_019382	GTC	2	6	1248824	1248829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_019382	GGC	2	6	1248874	1248879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_019382	CGG	2	6	1248921	1248926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_019382	CG	3	6	1248964	1248969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_019382	GC	4	8	1249014	1249021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_019382	ATG	2	6	1249052	1249057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_019382	GCG	2	6	1249072	1249077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_019382	ACC	2	6	1249131	1249136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_019382	CG	3	6	1249216	1249221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_019382	CAG	2	6	1249235	1249240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_019382	CAT	2	6	1249247	1249252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_019382	GCCGG	2	10	1249276	1249285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3021	NC_019382	C	7	7	1249424	1249430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3022	NC_019382	CGC	2	6	1249432	1249437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_019382	GCG	2	6	1249464	1249469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_019382	CCG	2	6	1250718	1250723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_019382	CGC	2	6	1250726	1250731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3027	NC_019382	CAT	2	6	1251168	1251173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_019382	GCG	2	6	1251190	1251195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_019382	GCGG	2	8	1251202	1251209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_019382	CG	3	6	1253355	1253360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_019382	CGG	2	6	1253469	1253474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019382	AGC	2	6	1254619	1254624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_019382	AGG	2	6	1254625	1254630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019382	CCGCG	2	10	1254631	1254640	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3035	NC_019382	GAAA	2	8	1254712	1254719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019382	GAA	2	6	1254726	1254731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019382	GCG	2	6	1254861	1254866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_019382	ATT	2	6	1254881	1254886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_019382	CGGC	2	8	1254918	1254925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_019382	GCCG	2	8	1254945	1254952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_019382	CGC	2	6	1256362	1256367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_019382	GTA	2	6	1257592	1257597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019382	CTTGA	2	10	1257608	1257617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_019382	AC	3	6	1257679	1257684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_019382	GGT	2	6	1257750	1257755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_019382	GCC	2	6	1258215	1258220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_019382	GC	4	8	1258438	1258445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3054	NC_019382	GC	3	6	1260488	1260493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_019382	CG	3	6	1260521	1260526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_019382	GC	3	6	1260556	1260561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_019382	CGC	2	6	1260564	1260569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_019382	CCG	2	6	1260574	1260579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_019382	CG	3	6	1260578	1260583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_019382	ACA	2	6	1260626	1260631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_019382	GCG	2	6	1260646	1260651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_019382	GCG	2	6	1260665	1260670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_019382	ATC	2	6	1260683	1260688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_019382	GTT	2	6	1260700	1260705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019382	ACT	2	6	1260744	1260749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3067	NC_019382	AAG	2	6	1260850	1260855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_019382	CGG	2	6	1261253	1261258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_019382	ACA	2	6	1261329	1261334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_019382	CCT	2	6	1263052	1263057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_019382	CCGC	2	8	1263075	1263082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3073	NC_019382	T	6	6	1263110	1263115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019382	GGC	2	6	1267519	1267524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3076	NC_019382	CCG	2	6	1267543	1267548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_019382	GCCC	2	8	1267553	1267560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3078	NC_019382	TCGG	2	8	1267567	1267574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_019382	CATG	2	8	1267588	1267595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_019382	GCC	2	6	1267603	1267608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_019382	ACG	2	6	1269294	1269299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3084	NC_019382	CGT	2	6	1270785	1270790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_019382	GCC	3	9	1270791	1270799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_019382	ACGC	2	8	1270863	1270870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_019382	CGG	2	6	1272130	1272135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_019382	GC	3	6	1272174	1272179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_019382	GCC	2	6	1272219	1272224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_019382	CGG	2	6	1272690	1272695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3094	NC_019382	GCAG	2	8	1272810	1272817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_019382	C	6	6	1272890	1272895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3096	NC_019382	AAAAC	2	10	1272897	1272906	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3097	NC_019382	ATC	2	6	1272984	1272989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_019382	GTC	2	6	1273050	1273055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_019382	GT	3	6	1273160	1273165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019382	TGT	2	6	1273167	1273172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019382	GGCGCT	2	12	1273185	1273196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_019382	TAA	2	6	1273210	1273215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019382	ACG	2	6	1273541	1273546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_019382	GATGA	2	10	1273617	1273626	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_019382	CCG	2	6	1273649	1273654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_019382	ACC	2	6	1273736	1273741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_019382	CTC	2	6	1273855	1273860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_019382	GAG	2	6	1273874	1273879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019382	CAAA	2	8	1273947	1273954	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_019382	GGT	2	6	1273959	1273964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_019382	CAT	2	6	1274102	1274107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_019382	AGG	2	6	1274136	1274141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019382	GCC	2	6	1274229	1274234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_019382	TAA	2	6	1274345	1274350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_019382	GC	3	6	1274392	1274397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_019382	TC	3	6	1274472	1274477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_019382	GCTC	2	8	1274590	1274597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_019382	GCA	2	6	1274650	1274655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_019382	TGA	2	6	1274675	1274680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_019382	C	6	6	1274696	1274701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3123	NC_019382	ACG	2	6	1274712	1274717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_019382	CAG	2	6	1274887	1274892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_019382	GAC	2	6	1275004	1275009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_019382	CTTT	2	8	1275030	1275037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_019382	GCT	2	6	1275046	1275051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_019382	CCT	2	6	1275062	1275067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_019382	GTT	2	6	1275135	1275140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_019382	GA	3	6	1275303	1275308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_019382	TCC	2	6	1275389	1275394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_019382	ATC	2	6	1275433	1275438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_019382	GGA	2	6	1275696	1275701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_019382	C	6	6	1275706	1275711	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3135	NC_019382	TCGC	2	8	1275864	1275871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_019382	ACT	2	6	1275873	1275878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_019382	GC	3	6	1276195	1276200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3140	NC_019382	CCAG	2	8	1276201	1276208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_019382	ACT	2	6	1276273	1276278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3143	NC_019382	AT	3	6	1276323	1276328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_019382	GCA	2	6	1276366	1276371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3145	NC_019382	CT	3	6	1276382	1276387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3146	NC_019382	TGG	2	6	1276438	1276443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3155	NC_019382	ACT	2	6	1276811	1276816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3164	NC_019382	TCC	2	6	1277530	1277535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3170	NC_019382	CTG	2	6	1277888	1277893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3174	NC_019382	CCA	2	6	1278147	1278152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3242	NC_019382	GCC	2	6	1322167	1322172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3243	NC_019382	CGC	2	6	1322181	1322186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3245	NC_019382	TCG	2	6	1322227	1322232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_019382	GGC	2	6	1322284	1322289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_019382	CTG	2	6	1322443	1322448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_019382	CG	3	6	1322467	1322472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_019382	CAT	2	6	1322526	1322531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_019382	CCTGG	2	10	1322535	1322544	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3252	NC_019382	CAA	2	6	1322571	1322576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_019382	GCCG	2	8	1322595	1322602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_019382	CAC	2	6	1322625	1322630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_019382	TGGCC	2	10	1322687	1322696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3256	NC_019382	GCA	2	6	1322715	1322720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_019382	TCA	2	6	1322756	1322761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_019382	GGCCC	2	10	1322818	1322827	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3259	NC_019382	GGC	2	6	1322889	1322894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_019382	GC	3	6	1322919	1322924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3261	NC_019382	ACA	2	6	1322933	1322938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_019382	CGC	2	6	1323000	1323005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3397	NC_019382	CTG	2	6	1390315	1390320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_019382	TGCCA	2	10	1390333	1390342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3399	NC_019382	TCG	2	6	1393696	1393701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3400	NC_019382	CA	3	6	1393726	1393731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3401	NC_019382	T	6	6	1393750	1393755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_019382	GAA	2	6	1393823	1393828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_019382	TGGAC	2	10	1396513	1396522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3404	NC_019382	CAG	2	6	1398227	1398232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3424	NC_019382	AGCC	2	8	1404209	1404216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3432	NC_019382	TTCTG	2	10	1404459	1404468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3436	NC_019382	GCAA	2	8	1404810	1404817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3456	NC_019382	CGAG	2	8	1405802	1405809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3483	NC_019382	GCG	2	6	1406760	1406765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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