MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019382	GCC	2	6	611930	611935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_019382	GCCA	2	8	611987	611994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_019382	GGC	3	9	613171	613179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_019382	CGG	2	6	613186	613191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_019382	CG	3	6	614780	614785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_019382	GGC	2	6	614786	614791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_019382	CCG	2	6	615587	615592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_019382	CGA	2	6	617066	617071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_019382	CCGCG	2	10	617107	617116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1510	NC_019382	GCG	2	6	617968	617973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_019382	C	6	6	618003	618008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1512	NC_019382	GCG	2	6	618060	618065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_019382	CCG	2	6	618108	618113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_019382	TGCCG	2	10	618120	618129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1515	NC_019382	CAG	2	6	618209	618214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_019382	CTGGC	2	10	623033	623042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1517	NC_019382	GGCC	2	8	623046	623053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_019382	CG	3	6	629204	629209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_019382	CGC	2	6	629220	629225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_019382	GCC	2	6	629256	629261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_019382	GCC	2	6	629276	629281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_019382	GCC	2	6	629709	629714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_019382	GCT	2	6	629768	629773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019382	CAGC	2	8	630367	630374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_019382	TTC	2	6	631308	631313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_019382	AGG	2	6	633667	633672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019382	GCC	2	6	636734	636739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_019382	TG	3	6	639710	639715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019382	CTC	2	6	642777	642782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_019382	GGC	2	6	642801	642806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_019382	CG	3	6	642817	642822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_019382	GCC	2	6	642869	642874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_019382	CG	3	6	643651	643656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_019382	GCA	2	6	645182	645187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_019382	AGC	2	6	645189	645194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019382	TGC	2	6	645210	645215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_019382	CGG	3	9	652189	652197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_019382	GA	3	6	652267	652272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019382	TG	3	6	652273	652278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_019382	GC	4	8	652321	652328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_019382	AT	3	6	653849	653854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_019382	AT	3	6	653863	653868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019382	CCG	2	6	653872	653877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_019382	AGC	2	6	653889	653894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_019382	GCC	2	6	653906	653911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_019382	CG	3	6	653921	653926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_019382	CGT	2	6	654170	654175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_019382	TGC	3	9	657160	657168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_019382	GC	3	6	659085	659090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_019382	CGC	2	6	659096	659101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_019382	GCC	2	6	659104	659109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_019382	GCG	2	6	659167	659172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_019382	CG	3	6	659171	659176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_019382	GCAA	2	8	660706	660713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_019382	GCGCG	2	10	660720	660729	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_019382	CGC	2	6	660737	660742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_019382	AGC	2	6	661139	661144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_019382	GGCACG	2	12	661477	661488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_019382	AGG	2	6	661516	661521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019382	AGG	2	6	662451	662456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019382	CGG	2	6	664954	664959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_019382	CGC	2	6	664960	664965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_019382	CGG	2	6	666489	666494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_019382	GCGCG	2	10	666519	666528	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1565	NC_019382	TCG	2	6	666542	666547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_019382	GCC	2	6	666548	666553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_019382	GCC	2	6	666566	666571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_019382	CAG	2	6	666586	666591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_019382	GCCA	2	8	666596	666603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_019382	GGC	2	6	666607	666612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_019382	GC	3	6	668020	668025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_019382	CGGC	2	8	669091	669098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_019382	CGG	2	6	670344	670349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_019382	CGC	3	9	670352	670360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_019382	GCG	2	6	670378	670383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_019382	GCC	2	6	670869	670874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_019382	GCCG	2	8	670891	670898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_019382	GCC	2	6	670916	670921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_019382	CTG	2	6	671192	671197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_019382	GAAA	2	8	671204	671211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_019382	CGGC	2	8	671221	671228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_019382	CTGG	2	8	673033	673040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_019382	GCC	2	6	674493	674498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_019382	GCC	2	6	674500	674505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_019382	CAGT	2	8	674514	674521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_019382	TGC	2	6	674542	674547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_019382	TAGCG	2	10	674553	674562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_019382	AAC	2	6	674584	674589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_019382	T	7	7	674606	674612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019382	CCAA	2	8	674703	674710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_019382	GCG	2	6	674756	674761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_019382	CCG	2	6	675738	675743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_019382	CGC	2	6	675747	675752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_019382	GA	3	6	675758	675763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019382	GCTG	2	8	675767	675774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_019382	CTC	2	6	675791	675796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_019382	CG	3	6	677250	677255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_019382	CTG	2	6	677725	677730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_019382	GCG	2	6	677731	677736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_019382	GC	3	6	677746	677751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_019382	CGAC	2	8	677752	677759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_019382	CAA	2	6	677782	677787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_019382	GC	4	8	677804	677811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_019382	CCG	2	6	677813	677818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_019382	GCC	2	6	677837	677842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_019382	AAC	2	6	677864	677869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_019382	GCG	2	6	677922	677927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_019382	GGC	2	6	699638	699643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_019382	GCC	2	6	699655	699660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_019382	ACG	2	6	699718	699723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_019382	TA	3	6	701430	701435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019382	CTG	2	6	703328	703333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_019382	AT	3	6	703360	703365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019382	CGCCC	2	10	704425	704434	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1617	NC_019382	CCG	2	6	705699	705704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_019382	GGC	2	6	705720	705725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_019382	GC	3	6	705745	705750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_019382	GCG	2	6	705771	705776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_019382	CCGG	2	8	705811	705818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_019382	GCC	2	6	705835	705840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_019382	GGC	2	6	705850	705855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_019382	CGC	2	6	705897	705902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_019382	CAG	2	6	705961	705966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_019382	TCG	2	6	705971	705976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_019382	AGCGC	2	10	706002	706011	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1628	NC_019382	GC	4	8	706008	706015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_019382	GCCCC	2	10	706036	706045	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1630	NC_019382	GC	3	6	706068	706073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_019382	TGC	2	6	706086	706091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_019382	CGAAC	2	10	706100	706109	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1633	NC_019382	GCC	2	6	706160	706165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_019382	CGA	2	6	706201	706206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_019382	CGTCGC	3	18	706237	706254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1912	NC_019382	TTG	2	6	802201	802206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_019382	C	6	6	803122	803127	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1914	NC_019382	CAT	2	6	803221	803226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1916	NC_019382	GGAC	2	8	804688	804695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1917	NC_019382	CGG	2	6	804712	804717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1919	NC_019382	GGA	2	6	804782	804787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1921	NC_019382	CGG	2	6	805670	805675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_019382	CCG	2	6	807560	807565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1932	NC_019382	GCCG	2	8	807583	807590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1933	NC_019382	GCCG	2	8	809153	809160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1939	NC_019382	TCG	2	6	810749	810754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1940	NC_019382	GCT	2	6	810759	810764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_019382	TTA	2	6	810872	810877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_019382	GCC	2	6	812613	812618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1945	NC_019382	GGCC	2	8	812635	812642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1946	NC_019382	GC	3	6	812650	812655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1947	NC_019382	TTC	2	6	812670	812675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1948	NC_019382	TACC	2	8	813582	813589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1950	NC_019382	CGC	2	6	815892	815897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1951	NC_019382	CTC	2	6	818110	818115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1952	NC_019382	TGT	2	6	818143	818148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_019382	ATC	2	6	818205	818210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1954	NC_019382	CGC	2	6	818228	818233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1955	NC_019382	C	6	6	818237	818242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1956	NC_019382	CGCCC	2	10	823000	823009	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1967	NC_019382	GC	3	6	824661	824666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1975	NC_019382	GCC	2	6	828311	828316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1976	NC_019382	GCC	2	6	828319	828324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1979	NC_019382	GCG	2	6	828407	828412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1980	NC_019382	CGG	2	6	834191	834196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1984	NC_019382	C	6	6	837833	837838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1988	NC_019382	CAATT	2	10	838651	838660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1989	NC_019382	CAA	2	6	838678	838683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1990	NC_019382	GGC	2	6	838723	838728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1991	NC_019382	GCCGG	2	10	838779	838788	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1992	NC_019382	CGG	3	9	838786	838794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1993	NC_019382	AGG	2	6	849812	849817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1994	NC_019382	GCTC	2	8	849836	849843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1995	NC_019382	GAAGT	2	10	849915	849924	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_019382	AGT	2	6	849978	849983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_019382	GTCA	2	8	850005	850012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1998	NC_019382	CATC	2	8	850023	850030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1999	NC_019382	ACCA	2	8	850069	850076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_019382	CGC	2	6	850130	850135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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