MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019382	TGCG	2	8	157799	157806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_019382	CGTG	2	8	161316	161323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_019382	G	6	6	161329	161334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019382	ACG	2	6	164245	164250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019382	GGC	2	6	167686	167691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_019382	GGA	2	6	167702	167707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019382	GCG	2	6	169074	169079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019382	CGG	2	6	169080	169085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019382	CTGC	2	8	170004	170011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_019382	CGT	2	6	170015	170020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_019382	TGT	2	6	170106	170111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019382	CGG	2	6	170119	170124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_019382	GC	3	6	170158	170163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_019382	GC	3	6	170174	170179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_019382	GGA	2	6	170180	170185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019382	GCC	2	6	172407	172412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_019382	CG	3	6	172420	172425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_019382	GGT	2	6	173442	173447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019382	GGGC	2	8	173460	173467	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
520	NC_019382	GC	3	6	173489	173494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_019382	GC	3	6	173647	173652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_019382	CGG	2	6	173710	173715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_019382	GGA	2	6	173729	173734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019382	GCC	2	6	173735	173740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_019382	GCC	2	6	174761	174766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_019382	CG	3	6	174810	174815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_019382	T	7	7	174834	174840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019382	CAA	2	6	174843	174848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019382	ATCA	2	8	174852	174859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_019382	CGC	2	6	177273	177278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_019382	ATT	2	6	183599	183604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019382	CGC	2	6	183644	183649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_019382	GC	3	6	183714	183719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_019382	CG	3	6	183720	183725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_019382	CG	3	6	184758	184763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_019382	CCG	2	6	184834	184839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_019382	GCC	2	6	184859	184864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_019382	GGCG	2	8	184869	184876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_019382	CG	3	6	184885	184890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_019382	CGGC	2	8	185973	185980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_019382	ATG	2	6	186881	186886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019382	GTG	2	6	186894	186899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019382	TTCGG	2	10	187021	187030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_019382	T	6	6	189588	189593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019382	CGGC	2	8	190872	190879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_019382	GC	3	6	190887	190892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_019382	CGGCC	2	10	191385	191394	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
548	NC_019382	ATG	2	6	191530	191535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019382	CGT	2	6	191584	191589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_019382	GA	3	6	191590	191595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019382	CA	3	6	192872	192877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_019382	GCCG	2	8	195372	195379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_019382	CG	3	6	195384	195389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_019382	G	6	6	197852	197857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019382	CGGG	2	8	197864	197871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
556	NC_019382	GGAC	2	8	199069	199076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_019382	TCG	2	6	199117	199122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_019382	CGC	2	6	199217	199222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_019382	GGC	2	6	199266	199271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_019382	GCG	2	6	199321	199326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_019382	CCA	2	6	199370	199375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_019382	CG	4	8	199376	199383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_019382	GCG	2	6	199388	199393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019382	GTG	2	6	199395	199400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019382	GCA	2	6	199438	199443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_019382	GCC	2	6	199983	199988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_019382	GC	3	6	200004	200009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_019382	GCG	2	6	200023	200028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_019382	GCCG	2	8	200043	200050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_019382	CGG	2	6	200052	200057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_019382	GCCG	2	8	200066	200073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_019382	CCG	3	9	200071	200079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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577	NC_019382	GCG	2	6	200241	200246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_019382	CG	3	6	200254	200259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_019382	GTC	2	6	200263	200268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_019382	GCC	2	6	200278	200283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_019382	GCG	3	9	200335	200343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_019382	CG	3	6	200342	200347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_019382	CGGG	2	8	200349	200356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
584	NC_019382	GTA	2	6	200386	200391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_019382	CG	3	6	201048	201053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_019382	GC	3	6	201055	201060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_019382	GCT	2	6	203087	203092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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592	NC_019382	CCG	2	6	204920	204925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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599	NC_019382	CG	4	8	209953	209960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_019382	CGG	2	6	209964	209969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_019382	GAAG	2	8	210092	210099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019382	CGG	2	6	210586	210591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_019382	GCC	2	6	217937	217942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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612	NC_019382	CGCGA	2	10	222498	222507	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
613	NC_019382	CGC	2	6	222511	222516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_019382	T	6	6	222556	222561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_019382	TCG	2	6	222617	222622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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619	NC_019382	CCG	2	6	224292	224297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_019382	TGGG	2	8	225091	225098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019382	TGAAT	2	10	225170	225179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019382	GC	3	6	225223	225228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_019382	GC	3	6	225230	225235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_019382	GC	3	6	225249	225254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_019382	GCC	3	9	225273	225281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_019382	CCG	2	6	225301	225306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_019382	CG	3	6	225321	225326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_019382	AGC	2	6	225331	225336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_019382	CG	3	6	225367	225372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_019382	TGC	2	6	225376	225381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_019382	GGGC	2	8	225392	225399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
632	NC_019382	GCATG	2	10	225416	225425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
633	NC_019382	CTG	2	6	225426	225431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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635	NC_019382	GCC	2	6	225589	225594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_019382	TGG	2	6	225595	225600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019382	CTG	2	6	225603	225608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_019382	GGC	3	9	225642	225650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_019382	GCC	2	6	225661	225666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_019382	TGC	2	6	225691	225696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_019382	GC	3	6	225718	225723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_019382	CCG	2	6	225724	225729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_019382	GCGCG	2	10	225739	225748	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
644	NC_019382	GCG	3	9	225746	225754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_019382	GGC	2	6	225808	225813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_019382	GGC	2	6	225824	225829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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649	NC_019382	CGCGC	3	15	225849	225863	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
650	NC_019382	GCC	2	6	225894	225899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_019382	GC	3	6	225954	225959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_019382	CTG	2	6	225963	225968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_019382	GC	3	6	226052	226057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
654	NC_019382	CGG	2	6	226095	226100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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656	NC_019382	GC	3	6	227437	227442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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660	NC_019382	CGG	2	6	230814	230819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_019382	GCC	2	6	236153	236158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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677	NC_019382	G	6	6	236192	236197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
678	NC_019382	GC	3	6	236280	236285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
679	NC_019382	CTGC	2	8	236815	236822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
680	NC_019382	GCG	2	6	236823	236828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
681	NC_019382	GC	3	6	238536	238541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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721	NC_019382	GGC	2	6	255995	256000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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732	NC_019382	GGGC	2	8	261234	261241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
733	NC_019382	GCCG	2	8	261268	261275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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749	NC_019382	T	6	6	269212	269217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
750	NC_019382	GC	4	8	271958	271965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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753	NC_019382	GCG	2	6	277439	277444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_019382	CGCTA	2	10	278153	278162	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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760	NC_019382	GGC	2	6	280687	280692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_019382	TA	3	6	280755	280760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_019382	ATCA	2	8	280788	280795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
764	NC_019382	AGCG	2	8	280822	280829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
765	NC_019382	CCA	2	6	280857	280862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_019382	GGA	2	6	280874	280879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_019382	TTG	2	6	289124	289129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_019382	GCAT	2	8	289157	289164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
774	NC_019382	GCG	2	6	290000	290005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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