MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_019382	AT	3	6	1907137	1907142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019382	AT	3	6	1907163	1907168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019382	CAG	2	6	1907177	1907182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5007	NC_019382	CGC	2	6	1907219	1907224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5010	NC_019382	CGC	2	6	1914151	1914156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_019382	A	6	6	1914190	1914195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019382	TCT	2	6	1914210	1914215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019382	GC	3	6	1914282	1914287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_019382	CCGGG	2	10	1919970	1919979	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5015	NC_019382	AT	3	6	1919988	1919993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5019	NC_019382	TGACA	2	10	1928735	1928744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_019382	GC	5	10	1928830	1928839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5059	NC_019382	CG	4	8	1951165	1951172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5104	NC_019382	A	8	8	1957230	1957237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_019382	GC	3	6	1961697	1961702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_019382	CGGC	2	8	1963142	1963149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_019382	CG	3	6	1963153	1963158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5129	NC_019382	TC	4	8	1964496	1964503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5133	NC_019382	A	6	6	1964713	1964718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_019382	TCCTTG	2	12	1964762	1964773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_019382	GT	3	6	1964889	1964894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_019382	CCG	2	6	1964951	1964956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_019382	C	6	6	1964961	1964966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5138	NC_019382	CAA	2	6	1965019	1965024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_019382	GCG	2	6	1965037	1965042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_019382	GCAA	2	8	1965044	1965051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5141	NC_019382	CTG	2	6	1965100	1965105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_019382	GCT	2	6	1965115	1965120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_019382	CCCG	2	8	1965139	1965146	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5144	NC_019382	CAAAT	2	10	1965174	1965183	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5145	NC_019382	TTC	2	6	1965229	1965234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5148	NC_019382	GC	4	8	1965335	1965342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5149	NC_019382	TCA	2	6	1965512	1965517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_019382	CAGC	2	8	1965583	1965590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5151	NC_019382	GA	3	6	1965608	1965613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_019382	GCT	2	6	1965622	1965627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_019382	CCA	2	6	1965636	1965641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5154	NC_019382	GCC	2	6	1965661	1965666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5155	NC_019382	GCAG	3	12	1965681	1965692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5156	NC_019382	GCG	2	6	1965724	1965729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5157	NC_019382	GC	3	6	1965772	1965777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5158	NC_019382	CGG	2	6	1965803	1965808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5161	NC_019382	CTG	2	6	1965919	1965924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5162	NC_019382	GCGTG	2	10	1965973	1965982	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5164	NC_019382	GCC	2	6	1966063	1966068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5165	NC_019382	GCC	2	6	1966094	1966099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5166	NC_019382	CA	3	6	1966148	1966153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5167	NC_019382	GAC	2	6	1966155	1966160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5169	NC_019382	GC	3	6	1966188	1966193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5170	NC_019382	GCC	2	6	1966223	1966228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5172	NC_019382	CGG	2	6	1966357	1966362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5176	NC_019382	G	6	6	1966582	1966587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_019382	GACT	2	8	1966616	1966623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5178	NC_019382	CCGG	2	8	1966632	1966639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5221	NC_019382	GTCG	2	8	1988553	1988560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5233	NC_019382	ATA	2	6	2003192	2003197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_019382	GC	3	6	2005913	2005918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5243	NC_019382	GC	3	6	2005941	2005946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5249	NC_019382	CATAA	2	10	2009794	2009803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5250	NC_019382	GCA	2	6	2009871	2009876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_019382	CGGCC	2	10	2009890	2009899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5252	NC_019382	CG	3	6	2009903	2009908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5253	NC_019382	CGC	2	6	2009912	2009917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5257	NC_019382	CCCG	2	8	2016652	2016659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5258	NC_019382	TCC	2	6	2017909	2017914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5259	NC_019382	TGC	2	6	2017952	2017957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_019382	TC	3	6	2019748	2019753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5261	NC_019382	C	6	6	2020891	2020896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5262	NC_019382	GGT	2	6	2021909	2021914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_019382	GCC	2	6	2022806	2022811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5399	NC_019382	TGC	2	6	2077547	2077552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5400	NC_019382	GC	3	6	2077556	2077561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5401	NC_019382	GCCGC	2	10	2077567	2077576	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5402	NC_019382	CGCCC	2	10	2077603	2077612	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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5421	NC_019382	CG	3	6	2078275	2078280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5422	NC_019382	CG	3	6	2078888	2078893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5423	NC_019382	GC	3	6	2078908	2078913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5432	NC_019382	A	7	7	2081005	2081011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5463	NC_019382	CGC	2	6	2096723	2096728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5470	NC_019382	CGGC	2	8	2097359	2097366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5474	NC_019382	GCCTT	2	10	2098165	2098174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5480	NC_019382	GA	3	6	2102497	2102502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5481	NC_019382	GAC	2	6	2104100	2104105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5500	NC_019382	CATCG	2	10	2115024	2115033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

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