MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TA	3	6	59	64	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018887	AT	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018887	AC	3	6	705	710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018887	AT	3	6	8341	8346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018887	TC	3	6	39803	39808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018887	AT	3	6	41626	41631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018887	CT	3	6	46901	46906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018887	AT	3	6	47346	47351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018887	TC	3	6	47364	47369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018887	AT	3	6	49283	49288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018887	TA	3	6	49310	49315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018887	AT	3	6	56728	56733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018887	TG	3	6	70312	70317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018887	AT	3	6	86808	86813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018887	AT	3	6	94137	94142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018887	TA	3	6	105750	105755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018887	TA	3	6	112702	112707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018887	AG	3	6	112708	112713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018887	TA	3	6	131005	131010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018887	TA	3	6	131029	131034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	AT	3	6	132301	132306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018887	TA	3	6	133727	133732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018887	TA	3	6	137688	137693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018887	AG	3	6	159776	159781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018887	AT	3	6	159786	159791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018887	AT	3	6	164563	164568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018887	TA	3	6	170836	170841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018887	AT	3	6	182539	182544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018887	TA	3	6	189564	189569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018887	CA	3	6	189687	189692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018887	TA	4	8	193229	193236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018887	AT	3	6	202301	202306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018887	AT	3	6	202502	202507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018887	AT	3	6	205802	205807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018887	AT	3	6	205933	205938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018887	AT	3	6	208294	208299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018887	AG	3	6	208331	208336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018887	TA	3	6	220578	220583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018887	TA	3	6	230225	230230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018887	AT	3	6	236925	236930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018887	AT	3	6	241050	241055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018887	TC	4	8	243000	243007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018887	AT	3	6	243016	243021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018887	TA	3	6	243252	243257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018887	AT	3	6	244087	244092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018887	AT	3	6	244384	244389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018887	AC	5	10	251033	251042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018887	AT	3	6	268115	268120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018887	TA	3	6	272341	272346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018887	AT	3	6	311309	311314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018887	AT	3	6	316683	316688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018887	AT	3	6	325353	325358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018887	AT	3	6	326441	326446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018887	TA	3	6	327102	327107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018887	TA	4	8	339788	339795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018887	TC	3	6	367340	367345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018887	AC	3	6	372797	372802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018887	AT	6	12	382774	382785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018887	AT	3	6	387538	387543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018887	CA	3	6	395726	395731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018887	AT	3	6	397785	397790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018887	AT	3	6	405488	405493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018887	TA	3	6	405889	405894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018887	GT	3	6	408490	408495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018887	TA	3	6	416089	416094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018887	AT	3	6	424709	424714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018887	AT	4	8	427062	427069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018887	AT	3	6	435630	435635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018887	TC	3	6	436788	436793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018887	GC	3	6	436794	436799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018887	CT	3	6	436935	436940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018887	TA	3	6	438158	438163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018887	AT	4	8	438574	438581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018887	AT	5	10	438601	438610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018887	AT	3	6	438866	438871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018887	TC	3	6	440024	440029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018887	GC	3	6	440030	440035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018887	CT	3	6	440171	440176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018887	TA	3	6	441394	441399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018887	AT	4	8	441810	441817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018887	TC	3	6	442809	442814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018887	AT	3	6	442894	442899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018887	TA	3	6	443996	444001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018887	TA	3	6	444879	444884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018887	TA	3	6	445065	445070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018887	TA	3	6	445108	445113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018887	AC	3	6	445232	445237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018887	TA	3	6	445460	445465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018887	TA	3	6	445514	445519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018887	AC	3	6	445538	445543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018887	GT	3	6	446638	446643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018887	GT	3	6	446807	446812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018887	TA	3	6	446994	446999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018887	TA	3	6	447037	447042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018887	TA	3	6	447439	447444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018887	TC	3	6	448107	448112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018887	AT	3	6	449592	449597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018887	AT	3	6	450037	450042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018887	TA	3	6	458483	458488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018887	TA	5	10	460146	460155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018887	AT	3	6	460203	460208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018887	TA	3	6	461791	461796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018887	AT	5	10	470595	470604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018887	AT	3	6	474278	474283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018887	AT	3	6	474432	474437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018887	AT	3	6	476542	476547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018887	TA	3	6	478254	478259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018887	GA	3	6	483099	483104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018887	TC	3	6	483180	483185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018887	GA	3	6	484231	484236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018887	TC	3	6	484309	484314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018887	TA	3	6	484597	484602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018887	AT	3	6	487595	487600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018887	AG	3	6	491817	491822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018887	TG	3	6	492692	492697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018887	TA	3	6	494414	494419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018887	AT	3	6	498061	498066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018887	CT	3	6	498073	498078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018887	GA	3	6	504682	504687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018887	AT	4	8	533567	533574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018887	GT	3	6	533636	533641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018887	GT	3	6	533724	533729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018887	AT	3	6	549620	549625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018887	AT	3	6	553903	553908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018887	AT	4	8	563378	563385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018887	TA	3	6	564816	564821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018887	AT	3	6	571073	571078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018887	AG	4	8	573730	573737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018887	CT	4	8	573745	573752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018887	AT	3	6	579232	579237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018887	TA	3	6	585318	585323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018887	TA	3	6	585914	585919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018887	TA	3	6	586857	586862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018887	TA	3	6	592120	592125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018887	AT	3	6	601255	601260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018887	AT	5	10	601292	601301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018887	AT	3	6	602732	602737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018887	TA	3	6	609781	609786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018887	TA	3	6	620490	620495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018887	AT	3	6	630876	630881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018887	TA	3	6	630882	630887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018887	TA	5	10	630910	630919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018887	TA	3	6	630925	630930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018887	TA	3	6	632605	632610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018887	TA	3	6	632615	632620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018887	TG	3	6	637921	637926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018887	AT	3	6	655709	655714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018887	TA	3	6	660707	660712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018887	TA	3	6	663388	663393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018887	TA	3	6	663395	663400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018887	TA	4	8	663404	663411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018887	AT	3	6	663468	663473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018887	AT	3	6	667813	667818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.