MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	CTTT	2	8	6277	6284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018887	TTAT	2	8	8335	8342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018887	CAAC	2	8	11460	11467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018887	AAGT	2	8	15795	15802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018887	TAAT	2	8	20000	20007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018887	ATTT	2	8	25722	25729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018887	TATT	2	8	38139	38146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018887	ATTT	2	8	40728	40735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018887	ATAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018887	AATT	2	8	46425	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018887	AAAT	2	8	46676	46683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018887	AAGC	2	8	46843	46850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018887	ATAA	2	8	47838	47845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018887	TAAT	2	8	47862	47869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018887	ACAT	2	8	56743	56750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018887	AATC	2	8	57959	57966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018887	ATTT	2	8	59004	59011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018887	CAAA	2	8	60496	60503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018887	GAAA	2	8	70084	70091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018887	AAAT	2	8	70092	70099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	GAAA	2	8	70178	70185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018887	ATTC	2	8	70449	70456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018887	TCTT	2	8	80764	80771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018887	TTTA	2	8	80859	80866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018887	TACA	2	8	83892	83899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018887	TCCT	2	8	85794	85801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018887	AATT	2	8	98715	98722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018887	ATAA	2	8	98750	98757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018887	CGAA	2	8	100149	100156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018887	TTTA	2	8	101316	101323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018887	ATTT	2	8	101332	101339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018887	TAAT	3	12	102852	102863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018887	TTAA	2	8	108123	108130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018887	TTTA	2	8	112739	112746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018887	TATT	2	8	114510	114517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018887	AATA	2	8	116630	116637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018887	CCAA	2	8	120551	120558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018887	AAAC	2	8	120575	120582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018887	TTTC	2	8	120690	120697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018887	AAAT	2	8	120743	120750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018887	TATT	2	8	131093	131100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018887	AATA	2	8	137947	137954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018887	TTAA	2	8	143917	143924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018887	TAAT	2	8	147313	147320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018887	AAAT	2	8	150619	150626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018887	TAAA	2	8	152038	152045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018887	CATT	2	8	152130	152137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018887	GGTA	2	8	156070	156077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018887	AATC	2	8	162515	162522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018887	AAAT	2	8	162742	162749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018887	ATTA	2	8	169106	169113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018887	AAAC	2	8	170860	170867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018887	AGCA	2	8	173779	173786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018887	TTTA	2	8	188244	188251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018887	ATCT	2	8	188752	188759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018887	GATT	2	8	189708	189715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018887	GCAA	2	8	191173	191180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018887	ATAA	2	8	193205	193212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018887	CATT	2	8	193280	193287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018887	TATT	2	8	193339	193346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018887	TTTA	2	8	205788	205795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018887	TTAA	2	8	205827	205834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018887	ATTT	2	8	206137	206144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018887	ATTA	2	8	210921	210928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018887	TAAA	2	8	213361	213368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018887	AACA	2	8	213369	213376	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018887	ACAT	2	8	227454	227461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018887	TAAA	2	8	230161	230168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018887	AATA	2	8	230251	230258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018887	TCTT	2	8	236835	236842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018887	AAAT	2	8	242919	242926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018887	CAAA	2	8	243329	243336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018887	GAAA	2	8	244192	244199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018887	TTAA	2	8	244244	244251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018887	ATTA	2	8	244297	244304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018887	GAAA	2	8	244310	244317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018887	ATTT	2	8	246831	246838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018887	GCAA	2	8	246879	246886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018887	TTAA	2	8	246911	246918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018887	ATTC	2	8	246996	247003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018887	GAAA	2	8	247040	247047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018887	CAAA	2	8	250946	250953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018887	ATTT	2	8	250964	250971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018887	AATT	2	8	255116	255123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018887	GATA	2	8	280253	280260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018887	AAGC	2	8	286211	286218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018887	TAAA	2	8	316880	316887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018887	TTAA	2	8	318344	318351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018887	AAAT	2	8	324891	324898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018887	TATT	2	8	333240	333247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018887	AATA	2	8	333275	333282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018887	TTAT	2	8	333335	333342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018887	AATA	2	8	333546	333553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018887	TAAA	2	8	336851	336858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018887	TAAA	4	16	336934	336949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018887	TAAA	2	8	338678	338685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018887	ATTA	2	8	338770	338777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018887	AATA	2	8	338832	338839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018887	AATA	2	8	343484	343491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018887	ACAT	2	8	343583	343590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018887	TAAA	2	8	344952	344959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018887	TATT	2	8	353907	353914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018887	ATTT	2	8	357480	357487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018887	ATTC	2	8	366950	366957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018887	AATT	2	8	367124	367131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018887	ATTT	2	8	367167	367174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018887	AATA	2	8	372778	372785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018887	ATTT	2	8	372786	372793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018887	ATAG	2	8	382804	382811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018887	TAAA	2	8	387544	387551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018887	TATT	2	8	390429	390436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018887	AATA	2	8	390444	390451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018887	CATT	2	8	392953	392960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018887	AATC	2	8	393202	393209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018887	CAAA	2	8	393242	393249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018887	ATTT	2	8	395447	395454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018887	CCAA	2	8	408255	408262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018887	TCCT	2	8	409668	409675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018887	TATT	2	8	413323	413330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018887	CAAA	2	8	414575	414582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018887	TAAT	2	8	416829	416836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018887	CTTA	2	8	416842	416849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018887	ATTC	2	8	424733	424740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018887	AAAT	2	8	424776	424783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018887	GTAA	2	8	427032	427039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018887	TTAA	2	8	436280	436287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018887	TACG	2	8	436753	436760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018887	ACCT	2	8	436817	436824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018887	CTAC	2	8	436887	436894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018887	GTTT	2	8	437648	437655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018887	CTAA	2	8	437783	437790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018887	TCGC	2	8	438273	438280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018887	TAGC	2	8	438372	438379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018887	TTAA	2	8	439516	439523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018887	TACG	2	8	439989	439996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018887	ACCT	2	8	440053	440060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018887	CTAC	2	8	440123	440130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018887	GTTT	2	8	440884	440891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018887	CTAA	2	8	441019	441026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018887	TCGC	2	8	441509	441516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018887	TAGC	2	8	441608	441615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018887	AAAT	2	8	441873	441880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018887	TCAA	2	8	443695	443702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018887	ACAA	2	8	444035	444042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018887	TAAA	2	8	444102	444109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018887	ATTT	2	8	444470	444477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018887	TAAA	2	8	444551	444558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018887	AATA	2	8	445085	445092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018887	CTAC	2	8	445521	445528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018887	AGTA	2	8	445595	445602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018887	ATTC	2	8	445700	445707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018887	CAAC	2	8	445861	445868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.