MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 2236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018887	CTT	2	6	801175	801180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_018887	T	6	6	801191	801196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_018887	A	7	7	801247	801253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_018887	A	7	7	801320	801326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_018887	TTAT	2	8	801876	801883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_018887	T	6	6	801896	801901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_018887	TTAA	2	8	801916	801923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_018887	TTA	2	6	801928	801933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_018887	AT	3	6	802016	802021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_018887	T	7	7	802654	802660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_018887	ATT	4	12	803391	803402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_018887	TAT	2	6	803403	803408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_018887	ATT	2	6	803409	803414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_018887	GTG	2	6	803425	803430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_018887	AC	3	6	803441	803446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_018887	GAG	2	6	803462	803467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_018887	GA	3	6	804737	804742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_018887	TTA	2	6	804747	804752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_018887	TTA	2	6	804760	804765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_018887	ATTT	2	8	804784	804791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_018887	T	8	8	804789	804796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_018887	T	6	6	804800	804805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_018887	TGAT	2	8	804814	804821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_018887	CAGT	2	8	805744	805751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2025	NC_018887	ATA	2	6	805757	805762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2035	NC_018887	ATT	2	6	805933	805938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2038	NC_018887	AAG	2	6	810879	810884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_018887	GAAAA	2	10	810898	810907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2041	NC_018887	ATT	2	6	810950	810955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_018887	TTA	2	6	810964	810969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_018887	TCT	2	6	810975	810980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_018887	T	9	9	810986	810994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_018887	A	7	7	811003	811009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_018887	TAT	2	6	811043	811048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_018887	C	7	7	811080	811086	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2048	NC_018887	A	6	6	811090	811095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_018887	TAT	2	6	811096	811101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_018887	T	7	7	811101	811107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_018887	TTTA	2	8	811120	811127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_018887	T	7	7	811149	811155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_018887	ATA	2	6	811156	811161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_018887	T	6	6	811164	811169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_018887	ATTTT	2	10	811174	811183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_018887	AAT	2	6	811184	811189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_018887	AT	3	6	811188	811193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_018887	ATT	2	6	811204	811209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_018887	TAA	2	6	811211	811216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_018887	A	6	6	811248	811253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_018887	T	6	6	814853	814858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_018887	TAAAT	2	10	814931	814940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_018887	TTC	2	6	816314	816319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_018887	CTA	2	6	816325	816330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_018887	ATT	2	6	816341	816346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_018887	T	6	6	816362	816367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_018887	ATT	2	6	816373	816378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_018887	TTA	2	6	816393	816398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_018887	ATT	2	6	816402	816407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_018887	AAGA	2	8	816446	816453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_018887	ATAAA	2	10	817068	817077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_018887	T	10	10	817086	817095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_018887	TTA	2	6	818784	818789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_018887	AATT	2	8	818817	818824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_018887	T	6	6	818834	818839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2079	NC_018887	A	10	10	818958	818967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_018887	ATT	2	6	818983	818988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2100	NC_018887	TAAT	2	8	832525	832532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_018887	ATTA	2	8	832539	832546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_018887	GTTCAA	2	12	833336	833347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2106	NC_018887	A	6	6	840848	840853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_018887	A	6	6	840862	840867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_018887	ATAG	2	8	840977	840984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_018887	ATT	2	6	841007	841012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_018887	T	6	6	841021	841026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_018887	TATT	2	8	841058	841065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_018887	ATT	2	6	841090	841095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_018887	ATT	2	6	844321	844326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_018887	T	6	6	844325	844330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_018887	TA	3	6	844361	844366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2121	NC_018887	TAT	2	6	850168	850173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_018887	A	9	9	850215	850223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_018887	TAT	2	6	850224	850229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_018887	TAG	2	6	850239	850244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_018887	ATG	2	6	850285	850290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2127	NC_018887	T	6	6	854335	854340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_018887	TTTTTC	2	12	854354	854365	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2130	NC_018887	T	6	6	855606	855611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_018887	TA	5	10	856633	856642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_018887	ATT	2	6	856646	856651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2134	NC_018887	TATAT	2	10	861911	861920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_018887	GTT	2	6	861967	861972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_018887	TAT	2	6	862002	862007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_018887	TTG	2	6	862175	862180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_018887	T	7	7	862185	862191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_018887	T	7	7	862201	862207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.