MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 2236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018887	TAA	2	6	443615	443620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018887	TAA	2	6	443651	443656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018887	A	6	6	443676	443681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018887	TTA	2	6	443683	443688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018887	TCAA	2	8	443695	443702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_018887	A	6	6	443704	443709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018887	A	7	7	443735	443741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018887	GAT	2	6	443774	443779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018887	CAAAA	2	10	443792	443801	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_018887	ATT	2	6	443807	443812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018887	AAT	2	6	443849	443854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018887	TAC	2	6	443906	443911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018887	TAA	2	6	443944	443949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018887	AAAAT	2	10	443965	443974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018887	TA	3	6	443996	444001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018887	ACAA	2	8	444035	444042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_018887	AGA	2	6	444094	444099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018887	TAAA	2	8	444102	444109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018887	GGT	2	6	444149	444154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018887	TGA	2	6	444257	444262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018887	AATAAA	2	12	444265	444276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018887	TGCAAT	2	12	444313	444324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_018887	AATTGC	2	12	444331	444342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1024	NC_018887	AAC	2	6	444419	444424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018887	TTTAA	2	10	444426	444435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018887	ATTT	2	8	444470	444477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018887	T	6	6	444475	444480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018887	TTAAA	2	10	444488	444497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018887	TCA	2	6	444524	444529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1031	NC_018887	GAT	2	6	444592	444597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_018887	CTT	2	6	444667	444672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_018887	GGC	2	6	444713	444718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_018887	TA	3	6	444879	444884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018887	ACC	2	6	444940	444945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_018887	CCA	2	6	444965	444970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_018887	ATA	2	6	444988	444993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018887	GAC	2	6	445043	445048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018887	TA	3	6	445065	445070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018887	AATA	2	8	445085	445092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018887	TA	3	6	445108	445113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018887	ATC	2	6	445142	445147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_018887	TTC	2	6	445393	445398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_018887	TA	3	6	445460	445465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018887	TA	3	6	445514	445519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018887	CTAC	2	8	445521	445528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_018887	AC	3	6	445538	445543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_018887	AAT	2	6	445544	445549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018887	CGC	2	6	445563	445568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_018887	AGTA	2	8	445595	445602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018887	CAT	2	6	445629	445634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1055	NC_018887	GCA	2	6	445710	445715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_018887	ATT	2	6	445748	445753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_018887	GCT	2	6	445935	445940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_018887	ATT	2	6	445950	445955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_018887	ATTA	2	8	445979	445986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018887	ATT	2	6	446035	446040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018887	AACAG	2	10	446052	446061	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_018887	CAA	2	6	446110	446115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018887	TTA	2	6	446148	446153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018887	ATT	2	6	446177	446182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018887	CAA	2	6	446205	446210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_018887	TAA	2	6	446331	446336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018887	ATA	2	6	446354	446359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018887	TAA	3	9	446361	446369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018887	A	6	6	446368	446373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018887	AAAAG	2	10	446436	446445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_018887	GT	3	6	446807	446812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018887	ATG	2	6	446832	446837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_018887	AAT	2	6	447014	447019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018887	TA	3	6	447037	447042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018887	ATC	2	6	447071	447076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1111	NC_018887	TC	3	6	448107	448112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_018887	AGA	2	6	448153	448158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018887	ATT	2	6	448181	448186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018887	TTA	2	6	448187	448192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018887	A	7	7	448204	448210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018887	TTA	2	6	448217	448222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018887	TAA	3	9	448846	448854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018887	AT	3	6	449592	449597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018887	TTTA	2	8	449636	449643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018887	ATA	2	6	449648	449653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_018887	AAAG	2	8	449753	449760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018887	ATTA	2	8	449778	449785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018887	ATTT	2	8	449800	449807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018887	CAAAA	2	10	449887	449896	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_018887	TAATT	2	10	449919	449928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_018887	T	6	6	450518	450523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018887	TAA	2	6	450536	450541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018887	TAA	3	9	450543	450551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_018887	TAA	2	6	450565	450570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018887	AATA	2	8	450582	450589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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