MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 2236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018887	AT	3	6	243016	243021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018887	T	6	6	243059	243064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018887	AAC	2	6	243111	243116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_018887	TA	3	6	243252	243257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018887	ATA	2	6	243273	243278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018887	A	6	6	243278	243283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018887	AAG	2	6	243311	243316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018887	CAAA	2	8	243329	243336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_018887	A	7	7	243340	243346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018887	A	6	6	243358	243363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018887	AGA	2	6	243367	243372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018887	AAT	2	6	243373	243378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018887	TAAAA	2	10	243413	243422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018887	CTA	2	6	243438	243443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018887	AT	3	6	244087	244092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018887	A	8	8	244097	244104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018887	TAA	2	6	244126	244131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018887	ATAAA	2	10	244161	244170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018887	A	6	6	244168	244173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018887	GAAA	2	8	244192	244199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018887	AAT	2	6	244202	244207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018887	ATT	2	6	244228	244233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018887	TTAA	2	8	244244	244251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018887	ATA	2	6	244254	244259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018887	TAAATA	2	12	244263	244274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018887	ATTA	2	8	244297	244304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018887	GAAA	2	8	244310	244317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018887	TATAA	2	10	244323	244332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018887	A	6	6	244331	244336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018887	A	6	6	244374	244379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018887	AT	3	6	244384	244389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018887	AAAAT	2	10	244426	244435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018887	TAAAA	2	10	245243	245252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018887	AAT	2	6	246817	246822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018887	ATTT	2	8	246831	246838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018887	T	6	6	246841	246846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018887	ATA	2	6	246863	246868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018887	GCAA	2	8	246879	246886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_018887	TTAA	2	8	246911	246918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018887	T	6	6	246920	246925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018887	A	6	6	246983	246988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018887	ATTC	2	8	246996	247003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_018887	TAA	2	6	247024	247029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018887	GAAA	2	8	247040	247047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018887	A	6	6	247054	247059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018887	AGAAA	2	10	247157	247166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018887	GGA	2	6	247178	247183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018887	CAA	2	6	248782	248787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_018887	TTTAA	2	10	248809	248818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018887	AGA	2	6	249046	249051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018887	CAAA	2	8	250946	250953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_018887	A	7	7	250951	250957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018887	ATTT	2	8	250964	250971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018887	TAA	2	6	251027	251032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018887	AC	5	10	251033	251042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_018887	ATA	2	6	251054	251059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018887	TAT	3	9	251102	251110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018887	TAAAA	2	10	251760	251769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018887	TAT	2	6	251796	251801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018887	A	7	7	251817	251823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018887	TGG	3	9	254966	254974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018887	TTA	2	6	255064	255069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018887	TAA	2	6	255073	255078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018887	GTT	2	6	255095	255100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018887	AATT	2	8	255116	255123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018887	ATA	2	6	257915	257920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018887	AACAA	2	10	262416	262425	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_018887	TAA	2	6	262446	262451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018887	T	9	9	262454	262462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018887	ATA	2	6	262471	262476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018887	TAA	3	9	262558	262566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018887	ACT	2	6	262575	262580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018887	A	6	6	262636	262641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018887	AGG	2	6	265719	265724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018887	T	6	6	265728	265733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018887	AT	3	6	268115	268120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018887	T	6	6	268122	268127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018887	ATT	2	6	268156	268161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018887	A	6	6	268181	268186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018887	TTTAT	2	10	272319	272328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018887	TA	3	6	272341	272346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018887	TTA	3	9	272357	272365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018887	TAA	2	6	272366	272371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018887	TATAA	3	15	272373	272387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018887	TTTTA	2	10	272416	272425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018887	TTA	2	6	272438	272443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018887	ATG	3	9	272453	272461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018887	CTT	2	6	279965	279970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018887	A	6	6	280242	280247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018887	GATA	2	8	280253	280260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018887	TCT	3	9	286177	286185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_018887	A	6	6	286187	286192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018887	AAGC	2	8	286211	286218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_018887	AGAAA	2	10	286230	286239	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018887	A	6	6	286278	286283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018887	ATA	2	6	286537	286542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018887	TAA	2	6	288580	288585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018887	TAA	2	6	288594	288599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018887	A	6	6	288598	288603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_018887	TCT	2	6	290248	290253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018887	ATA	2	6	295053	295058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018887	TAC	2	6	299404	299409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_018887	TAA	2	6	304963	304968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018887	AGG	2	6	304977	304982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018887	TTA	2	6	305002	305007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018887	CTA	2	6	305075	305080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018887	TAA	2	6	305156	305161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018887	ATT	2	6	305178	305183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018887	TCA	2	6	305243	305248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018887	ACT	2	6	309172	309177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018887	AT	3	6	311309	311314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018887	GCAAAC	2	12	311319	311330	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_018887	ACT	2	6	315853	315858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_018887	AT	3	6	316683	316688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018887	CAA	2	6	316698	316703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_018887	A	6	6	316738	316743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018887	TAA	2	6	316793	316798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018887	TAAA	2	8	316880	316887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018887	AAC	2	6	316899	316904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_018887	TAA	2	6	316905	316910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018887	TTAA	2	8	318344	318351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018887	AGT	2	6	318596	318601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018887	TAT	2	6	318955	318960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018887	AAAT	2	8	324891	324898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018887	A	6	6	324936	324941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018887	ATT	3	9	324980	324988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018887	A	7	7	325019	325025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018887	AT	3	6	325353	325358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018887	AT	3	6	326441	326446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018887	TTA	2	6	326515	326520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018887	A	6	6	326537	326542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018887	TAATT	2	10	326549	326558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018887	TTA	2	6	326582	326587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018887	TAA	2	6	326605	326610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018887	A	8	8	326618	326625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018887	GAA	2	6	326626	326631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018887	TTA	2	6	326677	326682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018887	TGC	2	6	326724	326729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018887	TA	3	6	327102	327107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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