MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_8p

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018881	T	7	7	4	10	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018881	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018881	AGG	2	6	60	65	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018881	AGG	2	6	366	371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018881	GAT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018881	AGAAA	2	10	469	478	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018881	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018881	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018881	ACA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018881	AAAG	2	8	663	670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018881	TAA	2	6	1078	1083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018881	AG	3	6	1135	1140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018881	GTT	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018881	TAT	2	6	1164	1169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018881	TTA	2	6	1177	1182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018881	T	6	6	1232	1237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018881	TAA	2	6	1259	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018881	T	6	6	1294	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018881	TAAAG	2	10	1382	1391	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018881	TAA	3	9	1432	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018881	GTT	2	6	1481	1486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018881	T	6	6	1485	1490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018881	TTC	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018881	GAA	2	6	3897	3902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018881	TAT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018881	AT	3	6	3943	3948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018881	ATTTA	2	10	3968	3977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018881	TGT	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018881	TATG	2	8	4001	4008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018881	AGA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018881	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018881	TGA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018881	ACA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018881	T	7	7	4084	4090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018881	AG	3	6	4093	4098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018881	GT	3	6	4120	4125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018881	AT	3	6	4168	4173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018881	ATC	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018881	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018881	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018881	TAT	2	6	5034	5039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018881	T	7	7	5048	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018881	ATTT	2	8	5055	5062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018881	TTG	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018881	TAG	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018881	TCT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018881	T	7	7	5137	5143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018881	ATTG	2	8	5147	5154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018881	CTTT	2	8	5174	5181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018881	T	6	6	5179	5184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018881	ATT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018881	CTT	2	6	5205	5210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018881	A	6	6	5251	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018881	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018881	TAT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018881	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018881	A	6	6	5337	5342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018881	TGA	3	9	5372	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018881	ATT	2	6	5382	5387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018881	GAA	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018881	GTTT	2	8	5425	5432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018881	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018881	ATA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018881	TA	3	6	5559	5564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018881	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018881	AGA	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018881	T	7	7	5606	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018881	TA	3	6	5718	5723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018881	TTA	2	6	5729	5734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018881	T	7	7	5743	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018881	TGT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018881	AAG	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018881	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018881	AGC	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018881	ATT	2	6	5877	5882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018881	A	8	8	5895	5902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018881	T	8	8	5945	5952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018881	CTA	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018881	T	6	6	5986	5991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018881	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018881	TGT	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018881	A	7	7	6066	6072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018881	TTTTA	2	10	6089	6098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018881	T	6	6	6111	6116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018881	CAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018881	A	6	6	6176	6181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018881	ACC	2	6	6184	6189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018881	ACC	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018881	TAA	2	6	6204	6209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018881	T	7	7	6277	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018881	A	7	7	6338	6344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018881	A	7	7	6366	6372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018881	TCA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018881	T	7	7	6524	6530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018881	CTT	2	6	6559	6564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018881	A	7	7	6566	6572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018881	A	7	7	6612	6618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018881	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018881	TAAT	2	8	6814	6821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018881	T	6	6	6865	6870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018881	A	7	7	6920	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018881	GCA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018881	AAG	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018881	TA	3	6	7013	7018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018881	A	6	6	7035	7040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018881	GC	3	6	7099	7104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018881	GC	3	6	7123	7128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018881	AT	3	6	7194	7199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018881	AGA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018881	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018881	TA	3	6	7284	7289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018881	TCA	2	6	7291	7296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018881	ATGGAA	2	12	7343	7354	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018881	AAG	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018881	TTTA	2	8	7388	7395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018881	T	6	6	7402	7407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018881	T	6	6	7421	7426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018881	A	6	6	7551	7556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018881	T	7	7	7569	7575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018881	AAT	2	6	7600	7605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018881	TAT	2	6	7622	7627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018881	TA	3	6	7641	7646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.