MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	TAT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018879	TTC	2	6	283	288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018879	TAA	2	6	412	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018879	CAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018879	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018879	TAA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018879	ATA	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018879	AGA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018879	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018879	CAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018879	ATT	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018879	TTC	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018879	GGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018879	AAG	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018879	ATA	3	9	4199	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018879	GAA	3	9	6711	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018879	AAG	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018879	CTT	2	6	6914	6919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018879	ATC	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018879	TAA	2	6	6973	6978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018879	TAT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018879	TCC	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018879	CTT	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018879	TCC	2	6	9615	9620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018879	ATA	2	6	10038	10043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018879	TAT	2	6	10060	10065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018879	ATA	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018879	TTA	2	6	10439	10444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	TAT	2	6	10495	10500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018879	ATT	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018879	CTT	2	6	10687	10692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018879	CTC	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018879	TAC	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018879	TAT	2	6	12381	12386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018879	TAT	2	6	12452	12457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018879	TAA	3	9	12514	12522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018879	CCT	2	6	16329	16334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018879	TAA	2	6	16375	16380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018879	AAT	2	6	16384	16389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018879	TAT	2	6	16579	16584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018879	ATT	2	6	16641	16646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018879	TTC	2	6	16767	16772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018879	GTA	2	6	16826	16831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018879	TAC	2	6	16848	16853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018879	TAA	2	6	17868	17873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018879	TTC	2	6	19031	19036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018879	TTA	2	6	19055	19060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018879	GAA	2	6	19107	19112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018879	ATT	3	9	21112	21120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018879	CAT	2	6	21136	21141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018879	CTT	2	6	21529	21534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018879	CAT	2	6	21555	21560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018879	TAA	2	6	22384	22389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018879	GTT	2	6	22406	22411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018879	TTG	2	6	22416	22421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018879	AAC	2	6	22456	22461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018879	CCT	2	6	23258	23263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018879	ACA	2	6	24097	24102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018879	ATT	2	6	24724	24729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018879	TAT	2	6	24787	24792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018879	CTT	2	6	24830	24835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018879	TAT	2	6	24873	24878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018879	ATT	2	6	24936	24941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018879	TAA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018879	TAA	2	6	25041	25046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018879	ATA	2	6	25047	25052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018879	GAT	2	6	25071	25076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018879	GGA	2	6	25371	25376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018879	AAT	2	6	26284	26289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018879	TTC	2	6	27132	27137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018879	TCT	2	6	27231	27236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018879	ATT	2	6	27357	27362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018879	ATA	2	6	27379	27384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018879	CCT	2	6	28299	28304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018879	TAA	2	6	28329	28334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018879	ATT	2	6	28364	28369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018879	ATA	2	6	28674	28679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018879	TTA	2	6	28695	28700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018879	TTA	2	6	28703	28708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018879	TCC	2	6	36714	36719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018879	TGG	2	6	36730	36735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018879	CCT	2	6	38260	38265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018879	ATT	2	6	38276	38281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018879	ACT	2	6	38887	38892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018879	TAA	2	6	38953	38958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018879	AGT	2	6	42470	42475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018879	TAA	2	6	42486	42491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018879	TTC	2	6	48079	48084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018879	TGC	2	6	48100	48105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018879	ATG	2	6	48114	48119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018879	CCA	2	6	50202	50207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018879	ACC	2	6	50567	50572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018879	CTT	2	6	50717	50722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018879	CTT	2	6	53903	53908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018879	TTG	2	6	54374	54379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018879	TTA	2	6	54440	54445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018879	TTC	2	6	54734	54739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018879	CAT	2	6	54751	54756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018879	TAA	3	9	54758	54766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018879	ATA	2	6	54881	54886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018879	ATA	2	6	54904	54909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018879	AGA	2	6	55020	55025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018879	TAT	2	6	55038	55043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018879	TAT	2	6	55214	55219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018879	TTA	2	6	55229	55234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018879	AAT	2	6	55346	55351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018879	TAG	2	6	55476	55481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018879	ATG	2	6	55496	55501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018879	GTT	2	6	55544	55549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018879	AAT	2	6	56218	56223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018879	ATT	2	6	56235	56240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018879	TAA	2	6	56276	56281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018879	CTA	2	6	56559	56564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018879	AGG	2	6	56626	56631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018879	ATT	2	6	60315	60320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018879	CAC	2	6	60521	60526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018879	GCA	2	6	60563	60568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018879	GTA	2	6	60612	60617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018879	TAT	2	6	60629	60634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018879	ACT	2	6	61035	61040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018879	AAC	2	6	61661	61666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018879	TAT	2	6	61795	61800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018879	GAA	2	6	62499	62504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018879	TCC	2	6	63803	63808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018879	ATT	2	6	63942	63947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018879	GAA	2	6	63962	63967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018879	TTC	2	6	63984	63989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018879	CTT	2	6	64762	64767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018879	GTA	2	6	64885	64890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018879	TAC	3	9	64920	64928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018879	GCC	2	6	66348	66353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018879	CAA	2	6	66434	66439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018879	CTA	2	6	66512	66517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018879	AAC	2	6	68142	68147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018879	GTT	2	6	68156	68161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018879	CAG	2	6	68176	68181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018879	ACA	2	6	68185	68190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018879	ATG	3	9	68295	68303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018879	ACT	2	6	68348	68353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018879	ATG	2	6	68354	68359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018879	GAT	2	6	68360	68365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.