MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	GAAAAC	2	12	4488	4499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018878	TCAAAA	2	12	20261	20272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018878	TTTATA	2	12	25864	25875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018878	AGAAAA	2	12	31059	31070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018878	AATATA	2	12	35387	35398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018878	ATTTTT	2	12	35900	35911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018878	AAATAA	3	18	75536	75553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018878	AAATTT	2	12	86258	86269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018878	TATTAA	2	12	100538	100549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018878	AAATAT	2	12	106289	106300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018878	AAAAAC	2	12	138787	138798	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018878	ATAAAA	2	12	148361	148372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018878	ATTACA	2	12	185634	185645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018878	TGTAGC	2	12	188570	188581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018878	TAAGAT	2	12	192017	192028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018878	ATAAAA	2	12	201819	201830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018878	TTTTAT	2	12	214423	214434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018878	AAATAA	2	12	220253	220264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018878	AAATAT	2	12	228004	228015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018878	TTAATA	2	12	243211	243222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018878	TAAAAA	2	12	246733	246744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018878	GCTAAT	2	12	246833	246844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018878	AAAAGA	2	12	257937	257948	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018878	CTCTTT	2	12	258601	258612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018878	AATAAA	2	12	275161	275172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018878	ACAGAA	2	12	295461	295472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018878	AACAAA	2	12	296691	296702	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018878	AAATTT	2	12	297742	297753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018878	GAATTA	2	12	297889	297900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018878	ATTTGA	2	12	305918	305929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018878	ACACTT	2	12	319848	319859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018878	ATTCTT	2	12	321731	321742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018878	AACAAT	2	12	333343	333354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018878	CTTTTG	2	12	366078	366089	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018878	GGAGTG	2	12	399622	399633	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018878	CTTTAT	2	12	404238	404249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018878	ATTTTA	2	12	422403	422414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018878	AAAATA	2	12	451044	451055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018878	TTAAAT	2	12	474424	474435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018878	TATCTC	2	12	478823	478834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018878	ATTTTT	2	12	496763	496774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018878	GTAAAA	2	12	501863	501874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.