MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	ATTTC	2	10	2211	2220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018878	CTTTC	2	10	2223	2232	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018878	TAAGA	2	10	4563	4572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018878	ATACA	2	10	12282	12291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018878	CTTTT	2	10	12863	12872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018878	ATAAA	2	10	24424	24433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018878	TAATA	2	10	29353	29362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018878	GAAGG	2	10	30243	30252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018878	GAACG	2	10	35450	35459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018878	AAAGT	2	10	35750	35759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018878	TGTAT	2	10	38920	38929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018878	TATAT	2	10	39305	39314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018878	ATAAA	2	10	40952	40961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018878	TAAAC	2	10	43011	43020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018878	TTATA	2	10	46887	46896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018878	ATATT	2	10	53501	53510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018878	CGAGG	2	10	53556	53565	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018878	AATTT	2	10	58471	58480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018878	AAAAT	2	10	69369	69378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018878	AGAAA	2	10	74547	74556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018878	TATAA	2	10	81584	81593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018878	AAATC	2	10	82466	82475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018878	ATAAA	2	10	88805	88814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018878	AATAA	2	10	94427	94436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018878	TGTTA	2	10	101448	101457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018878	AGTTA	2	10	103028	103037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018878	AGTTT	2	10	103459	103468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018878	TAATT	2	10	105229	105238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018878	TTTAT	2	10	105988	105997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018878	AAATG	2	10	108915	108924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018878	AATAA	2	10	109454	109463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018878	TATAG	2	10	109464	109473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018878	ATTAT	2	10	129812	129821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018878	ATATT	2	10	137003	137012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018878	ATAAA	2	10	139138	139147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018878	TATAT	2	10	139162	139171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018878	TTATG	2	10	142445	142454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018878	TAAAA	2	10	143116	143125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018878	AATCT	2	10	146535	146544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018878	TAAAA	2	10	149022	149031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018878	TTAAT	2	10	154741	154750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018878	AGTAT	2	10	156821	156830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018878	TATAT	2	10	159512	159521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018878	TTTTA	2	10	164199	164208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018878	TTTTA	2	10	167254	167263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018878	CTTTT	2	10	167746	167755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018878	TAAAA	2	10	169368	169377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018878	TTTTA	2	10	186883	186892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018878	TTTTA	2	10	191051	191060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018878	TTATA	2	10	191946	191955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018878	TTTGA	2	10	192078	192087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018878	TTAAT	2	10	192151	192160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018878	ATTTT	2	10	193722	193731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018878	ATTTT	2	10	194339	194348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018878	GTATA	2	10	194436	194445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018878	CATCA	2	10	194490	194499	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018878	TTACA	2	10	194713	194722	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018878	AGAGA	2	10	195692	195701	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018878	AGAGA	2	10	197159	197168	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018878	TTTAA	2	10	207985	207994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018878	ATACG	2	10	208338	208347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018878	TAAAA	2	10	212425	212434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018878	AAGAC	2	10	213155	213164	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018878	TATAT	2	10	215375	215384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018878	TTTTA	2	10	215387	215396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018878	TTCTT	2	10	220308	220317	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018878	AGATA	2	10	230010	230019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018878	TATTT	2	10	232097	232106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018878	ATAAA	2	10	232156	232165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018878	TTTTA	2	10	240464	240473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018878	TATTT	2	10	240489	240498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018878	ATTTA	2	10	248842	248851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018878	ATTTA	2	10	251262	251271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018878	CTTAT	2	10	254878	254887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018878	TAAAA	2	10	257057	257066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018878	ATTTA	2	10	257627	257636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018878	TTTTC	2	10	262301	262310	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018878	TATCT	2	10	262711	262720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018878	TAAAA	2	10	262732	262741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018878	TTTTG	2	10	267838	267847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018878	ATTAT	2	10	267894	267903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018878	CAAAA	2	10	273716	273725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018878	TCTTT	2	10	290160	290169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018878	AAATT	2	10	294792	294801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018878	ACAAA	2	10	296535	296544	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018878	TATAT	2	10	297722	297731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018878	TTATT	2	10	301040	301049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018878	TTATA	2	10	307743	307752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018878	ATTTT	2	10	317762	317771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018878	ATATA	2	10	317808	317817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018878	CATTC	2	10	328306	328315	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018878	TTTCA	2	10	335215	335224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018878	TGTAT	2	10	337339	337348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018878	TGTTT	2	10	337356	337365	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018878	ATTTC	2	10	337410	337419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018878	TAAAA	2	10	346807	346816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018878	ATTAT	2	10	350929	350938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018878	TTTGA	2	10	356333	356342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018878	ATTAG	2	10	356991	357000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018878	AAGAA	2	10	360802	360811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018878	TTCTT	2	10	360824	360833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018878	ATATT	2	10	361286	361295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018878	TATTT	2	10	362376	362385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018878	ATTTT	2	10	363951	363960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018878	ACTTC	2	10	366215	366224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018878	TATTT	2	10	367269	367278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018878	GTTTT	2	10	367305	367314	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018878	AAATA	2	10	367355	367364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018878	AATAA	2	10	369492	369501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018878	AAAAG	2	10	370493	370502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018878	CTCTC	2	10	383658	383667	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_018878	AAACA	2	10	400780	400789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018878	ATTAT	2	10	404705	404714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018878	AATGA	2	10	404769	404778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018878	CTACT	2	10	412821	412830	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018878	TAATA	2	10	418344	418353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018878	CTTTT	2	10	419921	419930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018878	AACAA	2	10	425607	425616	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018878	ATTTT	2	10	425852	425861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018878	TATTT	2	10	430882	430891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018878	CTCTT	2	10	432736	432745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018878	ATGAA	2	10	440270	440279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018878	TAAAT	2	10	445066	445075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018878	TGTTT	2	10	445242	445251	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018878	ATTTT	2	10	449524	449533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018878	ATTCA	2	10	449768	449777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018878	AGGAT	2	10	449945	449954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018878	GTTTT	2	10	456978	456987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018878	AAAAT	2	10	457143	457152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018878	ATATA	2	10	461613	461622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018878	ATATT	2	10	462511	462520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018878	AATAT	2	10	471322	471331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018878	TAAAA	2	10	473117	473126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018878	TAAAA	2	10	474548	474557	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018878	TAAAA	2	10	478777	478786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018878	TATTG	2	10	479424	479433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018878	TAAAA	2	10	496153	496162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018878	TATGA	2	10	497190	497199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018878	ATATA	2	10	499242	499251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018878	TAAAT	2	10	500583	500592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.