MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 1137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	AAACA	2	10	8951	8960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018877	TCGTG	2	10	10089	10098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018877	TTCAA	2	10	10632	10641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018877	GATAT	2	10	10660	10669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018877	ATGGT	2	10	11072	11081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018877	CTGAA	2	10	12836	12845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018877	TGGAA	2	10	19863	19872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018877	TAAAA	2	10	20019	20028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018877	TTTCC	2	10	21396	21405	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018877	ATATT	2	10	21449	21458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018877	TTTTA	2	10	21628	21637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018877	TATTT	2	10	28132	28141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018877	TTGTC	2	10	28214	28223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018877	TCGTG	2	10	29833	29842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018877	TTCAA	2	10	30376	30385	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018877	GATAT	2	10	30404	30413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018877	ATGGT	2	10	30816	30825	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018877	CTGAA	2	10	32580	32589	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018877	TCTAT	2	10	44237	44246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018877	ATAAG	2	10	71316	71325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018877	AATTA	2	10	74145	74154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018877	TCGTG	2	10	83114	83123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018877	ATGGT	2	10	83872	83881	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018877	CTGAA	2	10	85636	85645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018877	TCGTG	2	10	88824	88833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018877	ATGGT	2	10	89582	89591	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018877	CTGAA	2	10	91346	91355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018877	TTTTA	2	10	92568	92577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018877	AGTGA	2	10	97517	97526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018877	TATGA	2	10	100043	100052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018877	ATATA	2	10	102018	102027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018877	AAAGA	2	10	112802	112811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018877	TAAAA	2	10	122454	122463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018877	AATCC	2	10	122464	122473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018877	CATGG	2	10	126211	126220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018877	GGGCT	2	10	146823	146832	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018877	TCGTG	2	10	152005	152014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018877	ATGGT	2	10	152763	152772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018877	CTGAA	2	10	154527	154536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018877	ATTAT	2	10	170175	170184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018877	TGGAA	2	10	170209	170218	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018877	AAAAG	2	10	178025	178034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018877	AAAAG	2	10	195054	195063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018877	ATGGA	2	10	195075	195084	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018877	AAAGG	2	10	195110	195119	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018877	TTCTT	2	10	198647	198656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018877	GTAAT	2	10	206205	206214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018877	ATTAC	2	10	206906	206915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018877	TGTAA	2	10	206943	206952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018877	ACGTT	2	10	222151	222160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018877	TAAAA	2	10	226542	226551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018877	CATTT	2	10	229463	229472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018877	TGTTT	2	10	238703	238712	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018877	AAGAG	2	10	241717	241726	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018877	AATTT	2	10	241822	241831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018877	GATAA	2	10	243554	243563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018877	TCGTG	2	10	244992	245001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018877	ATGGT	2	10	245749	245758	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018877	CTGAA	2	10	247513	247522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018877	AAGAA	2	10	248875	248884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018877	ATGAG	2	10	255894	255903	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018877	TCGTG	2	10	268109	268118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018877	ATGGT	2	10	268867	268876	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018877	CTGAA	2	10	270631	270640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018877	TATTT	2	10	271942	271951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018877	AAGAT	2	10	271956	271965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018877	TCGTG	2	10	275343	275352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018877	ATGGT	2	10	276100	276109	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018877	CTGAA	2	10	277864	277873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018877	TCGTG	2	10	284028	284037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018877	ATGGT	2	10	284786	284795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018877	CTGAA	2	10	286550	286559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018877	TATGC	2	10	293035	293044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018877	GAAAA	2	10	297950	297959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018877	TAAAA	2	10	298126	298135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018877	TCGTG	2	10	299444	299453	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018877	ATGGT	2	10	300202	300211	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018877	CTGAA	2	10	301966	301975	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018877	TCGTG	2	10	306596	306605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018877	ATGGT	2	10	307354	307363	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018877	CTGAA	2	10	309118	309127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018877	AAATA	2	10	337263	337272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018877	TTTTA	2	10	338368	338377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018877	TTTTA	2	10	348956	348965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018877	AGAAA	2	10	349851	349860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018877	TGGAG	2	10	358201	358210	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018877	GTTTG	2	10	369738	369747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018877	ATATG	2	10	382877	382886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018877	TAAAG	2	10	383467	383476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018877	TGAAT	2	10	385886	385895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018877	ATAGT	2	10	385902	385911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018877	ATGCA	2	10	390143	390152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018877	GTATT	2	10	391557	391566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018877	TATTT	2	10	393745	393754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018877	AATAA	2	10	429134	429143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018877	AGAAT	2	10	432265	432274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018877	GATTT	2	10	448857	448866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018877	TTTAA	2	10	462615	462624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018877	AATCT	2	10	466315	466324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018877	AACTT	2	10	467705	467714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018877	AATTA	2	10	488233	488242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018877	CACCC	2	10	501752	501761	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
103	NC_018877	GAAAA	2	10	504159	504168	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018877	TTAAT	2	10	505590	505599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018877	AGATA	2	10	525066	525075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018877	AGGAG	2	10	525086	525095	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018877	TCGTG	2	10	526466	526475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018877	ATGGT	2	10	527223	527232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018877	CTGAA	2	10	528987	528996	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018877	TTTTA	2	10	531204	531213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018877	TAATT	2	10	531225	531234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018877	TTTTC	2	10	531647	531656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018877	TCTTT	2	10	532091	532100	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018877	ATTAT	2	10	532217	532226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018877	TATAA	2	10	532264	532273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018877	GTTTC	2	10	536088	536097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018877	ATAAA	2	10	538896	538905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018877	ACAAT	2	10	543542	543551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018877	ACTTT	2	10	553988	553997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018877	TATAT	2	10	554011	554020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018877	GAAGA	2	10	571916	571925	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018877	AAGAG	2	10	583297	583306	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018877	TCTCC	2	10	585027	585036	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_018877	TTTAT	2	10	587117	587126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018877	AGCTT	2	10	587150	587159	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018877	GTCAT	2	10	589617	589626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018877	TGTTT	2	10	590877	590886	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018877	AAGTA	2	10	597602	597611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018877	ACAAA	2	10	599069	599078	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018877	AATAA	2	10	603717	603726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018877	TGAAG	2	10	605397	605406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018877	AAAAG	2	10	619829	619838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018877	GAAAA	2	10	620936	620945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018877	AAAAT	2	10	622750	622759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018877	TATAA	2	10	622829	622838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018877	TGAAA	2	10	622884	622893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018877	GAAAA	2	10	636141	636150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018877	GAAAA	2	10	642167	642176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018877	GTTAC	2	10	650097	650106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018877	CTTTT	2	10	662153	662162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018877	AGATG	2	10	662223	662232	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018877	TAAAA	2	10	669994	670003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018877	GGAAA	2	10	689259	689268	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018877	AAAAG	2	10	696069	696078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018877	AAAAT	2	10	696150	696159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018877	AAATA	2	10	709012	709021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018877	AAGAA	2	10	710600	710609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018877	AGGAA	2	10	711761	711770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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