MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 11446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018829	CG	3	6	1480376	1480381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_018829	GGC	2	6	1480401	1480406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_018829	GC	3	6	1480425	1480430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_018829	ATG	2	6	1480440	1480445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_018829	GGCC	2	8	1482621	1482628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_018829	TTC	2	6	1482819	1482824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_018829	TG	5	10	1482895	1482904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_018829	GTC	2	6	1482911	1482916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_018829	GAC	2	6	1482932	1482937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_018829	CG	3	6	1482955	1482960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_018829	TG	3	6	1483059	1483064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_018829	GCC	2	6	1483068	1483073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_018829	GC	3	6	1486297	1486302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_018829	CGC	2	6	1487565	1487570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_018829	GTT	2	6	1489366	1489371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_018829	TTGCA	2	10	1489377	1489386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3517	NC_018829	CGC	2	6	1490321	1490326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_018829	GCC	2	6	1490352	1490357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_018829	ACC	2	6	1491823	1491828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_018829	GC	5	10	1491836	1491845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_018829	TCG	2	6	1491854	1491859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_018829	GCC	2	6	1492510	1492515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_018829	GCCG	2	8	1492538	1492545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_018829	AGC	2	6	1494013	1494018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_018829	GC	3	6	1494017	1494022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_018829	CGCCAG	2	12	1494027	1494038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_018829	CG	4	8	1494060	1494067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_018829	ATG	2	6	1494082	1494087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_018829	TTG	2	6	1494116	1494121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_018829	A	6	6	1494147	1494152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_018829	CG	3	6	1494272	1494277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_018829	CGGCG	2	10	1494321	1494330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3533	NC_018829	CGG	2	6	1494347	1494352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_018829	GAC	2	6	1494360	1494365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_018829	ACC	2	6	1494471	1494476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_018829	AGG	2	6	1494488	1494493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_018829	CGGG	2	8	1494525	1494532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_018829	TGCGCG	2	12	1494550	1494561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_018829	GCCG	2	8	1494571	1494578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_018829	TGG	2	6	1494597	1494602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_018829	GGCG	2	8	1494657	1494664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_018829	CGC	2	6	1494724	1494729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_018829	TAC	2	6	1494742	1494747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_018829	GAC	2	6	1494759	1494764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_018829	CTGC	2	8	1495996	1496003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_018829	TCCGTT	2	12	1496017	1496028	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_018829	CGC	2	6	1496032	1496037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_018829	GGCT	2	8	1496050	1496057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_018829	CGC	2	6	1496133	1496138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_018829	CG	3	6	1496157	1496162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_018829	GCC	2	6	1498839	1498844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_018829	GGC	2	6	1502292	1502297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_018829	CGG	2	6	1502315	1502320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_018829	GGC	2	6	1502359	1502364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_018829	GCC	2	6	1502428	1502433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_018829	GCA	2	6	1502438	1502443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_018829	GCT	2	6	1502483	1502488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_018829	CACG	2	8	1502518	1502525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_018829	GGC	2	6	1502530	1502535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_018829	GCC	2	6	1502599	1502604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_018829	GCA	2	6	1502609	1502614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_018829	GCT	2	6	1502652	1502657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_018829	CACG	2	8	1502687	1502694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_018829	GGC	2	6	1502699	1502704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_018829	GCC	2	6	1502768	1502773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_018829	AGC	2	6	1502777	1502782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_018829	GCT	2	6	1502823	1502828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_018829	CACG	2	8	1502858	1502865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_018829	GGC	2	6	1502869	1502874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_018829	GCC	2	6	1502938	1502943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_018829	AGC	2	6	1502947	1502952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_018829	CACG	2	8	1503028	1503035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_018829	GGC	2	6	1503039	1503044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_018829	GCC	2	6	1503108	1503113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_018829	AGC	2	6	1503117	1503122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_018829	AC	3	6	1503139	1503144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_018829	CAC	2	6	1503170	1503175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_018829	CCCCTC	2	12	1503176	1503187	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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3580	NC_018829	CGG	2	6	1503323	1503328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3582	NC_018829	GCG	2	6	1505669	1505674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_018829	GGC	2	6	1506051	1506056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_018829	GCC	2	6	1506065	1506070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_018829	GC	3	6	1506073	1506078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_018829	CGC	2	6	1506716	1506721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_018829	GC	3	6	1506725	1506730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_018829	GGC	2	6	1506737	1506742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_018829	CG	3	6	1508040	1508045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_018829	GGC	2	6	1508046	1508051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_018829	GCA	2	6	1508063	1508068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_018829	CCGC	2	8	1508098	1508105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3593	NC_018829	GGC	2	6	1508107	1508112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_018829	CGG	2	6	1510773	1510778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_018829	CATGCC	2	12	1510785	1510796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_018829	CG	3	6	1510797	1510802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_018829	GC	3	6	1511924	1511929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_018829	TGC	2	6	1512003	1512008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_018829	CCT	2	6	1512041	1512046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_018829	GC	3	6	1512096	1512101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_018829	GGC	2	6	1516410	1516415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_018829	CTTT	2	8	1516460	1516467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_018829	CCG	2	6	1516495	1516500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_018829	GAC	2	6	1516550	1516555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3606	NC_018829	G	6	6	1517363	1517368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_018829	GCAGG	2	10	1517379	1517388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3608	NC_018829	GC	4	8	1521837	1521844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_018829	GC	3	6	1521846	1521851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_018829	GGC	3	9	1521862	1521870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_018829	TCC	2	6	1523201	1523206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_018829	T	6	6	1523207	1523212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_018829	GC	3	6	1523270	1523275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_018829	CGGC	2	8	1523287	1523294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_018829	GC	3	6	1523299	1523304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_018829	CAG	2	6	1523338	1523343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_018829	CTG	2	6	1523404	1523409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_018829	CGG	2	6	1523412	1523417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_018829	ATG	2	6	1523453	1523458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_018829	GCC	2	6	1523459	1523464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_018829	GGC	3	9	1523530	1523538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_018829	CGG	2	6	1523577	1523582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_018829	TGG	2	6	1523613	1523618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_018829	GC	3	6	1523659	1523664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_018829	TGC	2	6	1523683	1523688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_018829	GC	3	6	1523687	1523692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_018829	C	6	6	1523699	1523704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3628	NC_018829	GCC	2	6	1523715	1523720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_018829	GC	3	6	1525063	1525068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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