MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 11446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018829	TTG	2	6	457067	457072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018829	GT	3	6	457092	457097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018829	TGG	2	6	457169	457174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018829	TGG	2	6	457184	457189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018829	CTAT	2	8	457191	457198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_018829	GC	3	6	457201	457206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_018829	CGC	2	6	457212	457217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_018829	GA	3	6	457254	457259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018829	CCG	2	6	458155	458160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_018829	CGG	2	6	458195	458200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_018829	TGG	2	6	458552	458557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018829	CGG	2	6	458619	458624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_018829	CG	3	6	458625	458630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_018829	GCG	2	6	458649	458654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_018829	GGCG	2	8	458663	458670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_018829	GGAT	2	8	459832	459839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1021	NC_018829	GC	3	6	462160	462165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_018829	GC	3	6	462168	462173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_018829	T	6	6	462229	462234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018829	TAC	2	6	462246	462251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018829	TGA	2	6	462282	462287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1031	NC_018829	TGCG	2	8	470344	470351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_018829	GTA	2	6	470389	470394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018829	TAA	2	6	470421	470426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_018829	CGGC	2	8	479449	479456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_018829	GC	3	6	479455	479460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_018829	AAT	2	6	479479	479484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018829	ATA	2	6	479501	479506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018829	CCT	2	6	479519	479524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_018829	ATG	2	6	479525	479530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_018829	CGGG	2	8	482314	482321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_018829	CGGC	2	8	482326	482333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_018829	CGTC	2	8	482360	482367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_018829	CGCGC	2	10	482423	482432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1053	NC_018829	CCG	2	6	482547	482552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_018829	GGCG	2	8	482614	482621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_018829	CCCG	2	8	482628	482635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1057	NC_018829	GCC	2	6	487597	487602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1059	NC_018829	CCGC	2	8	487646	487653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1060	NC_018829	GCG	2	6	487662	487667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_018829	ACA	2	6	487708	487713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_018829	GCGGG	2	10	488388	488397	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_018829	GGAT	2	8	488911	488918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018829	ATC	2	6	488981	488986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1066	NC_018829	GCT	2	6	489043	489048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_018829	GCG	2	6	489056	489061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_018829	GC	3	6	489096	489101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_018829	TTC	2	6	489114	489119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1073	NC_018829	CGT	2	6	489352	489357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_018829	CGG	2	6	489742	489747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1102	NC_018829	CT	3	6	490358	490363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1105	NC_018829	GC	3	6	490699	490704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1108	NC_018829	CG	3	6	495382	495387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_018829	GCG	2	6	495395	495400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018829	GCGA	2	8	495419	495426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_018829	GCC	2	6	495454	495459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_018829	C	6	6	495463	495468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1113	NC_018829	GCG	3	9	495472	495480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018829	AG	3	6	497415	497420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018829	GCG	2	6	497438	497443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_018829	G	6	6	497481	497486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018829	TTG	2	6	497547	497552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018829	CAT	2	6	497594	497599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_018829	GCG	2	6	497710	497715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_018829	AAGTG	2	10	497825	497834	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018829	CTGTAC	2	12	497849	497860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_018829	TC	3	6	498009	498014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_018829	CCT	2	6	498077	498082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_018829	GAT	2	6	498119	498124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_018829	CCATG	2	10	498196	498205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1131	NC_018829	GTG	2	6	501477	501482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_018829	CGG	2	6	501997	502002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_018829	AGCGC	2	10	502216	502225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1138	NC_018829	ATGA	2	8	502411	502418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_018829	CTG	2	6	530550	530555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1385	NC_018829	GC	3	6	588326	588331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1411	NC_018829	ACG	2	6	599980	599985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_018829	GCT	2	6	599990	599995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_018829	GCT	2	6	600011	600016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_018829	TTC	2	6	600084	600089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_018829	CTG	3	9	600156	600164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_018829	GGC	2	6	600203	600208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_018829	CG	3	6	600329	600334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1418	NC_018829	GTG	2	6	600357	600362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_018829	ACG	2	6	600385	600390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_018829	CGGC	2	8	600493	600500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1422	NC_018829	GTG	2	6	600504	600509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_018829	GCC	2	6	600531	600536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1425	NC_018829	GGC	3	9	600575	600583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_018829	CCG	2	6	600734	600739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1430	NC_018829	GC	3	6	600907	600912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1431	NC_018829	CG	3	6	600913	600918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_018829	CGA	2	6	600923	600928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_018829	CGG	2	6	600974	600979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_018829	GC	3	6	601015	601020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1435	NC_018829	GCT	2	6	601037	601042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1437	NC_018829	GC	3	6	601085	601090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1446	NC_018829	GC	3	6	601342	601347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_018829	TCG	2	6	601352	601357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_018829	TGT	2	6	601372	601377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_018829	C	6	6	602348	602353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1452	NC_018829	GCG	2	6	604020	604025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_018829	GCG	2	6	604051	604056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_018829	GAG	2	6	604100	604105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1458	NC_018829	AAC	2	6	609513	609518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1474	NC_018829	GCC	2	6	622722	622727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1475	NC_018829	TGG	2	6	626242	626247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_018829	CATG	2	8	639571	639578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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