MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 11446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018829	GCG	2	6	2051198	2051203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_018829	CAG	2	6	2051208	2051213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_018829	CCGG	2	8	2051217	2051224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_018829	TGGGC	2	10	2051241	2051250	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5005	NC_018829	T	8	8	2051261	2051268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018829	AG	3	6	2053323	2053328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018829	GTC	2	6	2056769	2056774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_018829	GCT	2	6	2056775	2056780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_018829	GCCG	2	8	2059385	2059392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_018829	GCG	2	6	2059400	2059405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_018829	GGC	2	6	2059431	2059436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_018829	CG	3	6	2060640	2060645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_018829	GT	3	6	2060648	2060653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018829	TTCT	2	8	2060689	2060696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_018829	TAA	2	6	2060700	2060705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_018829	TTTG	2	8	2061364	2061371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018829	CGG	2	6	2061373	2061378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_018829	CGGC	2	8	2064128	2064135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_018829	GCCG	2	8	2064142	2064149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_018829	CGCGG	2	10	2065068	2065077	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5021	NC_018829	AGG	2	6	2065082	2065087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018829	CG	3	6	2067628	2067633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_018829	GCG	2	6	2067640	2067645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_018829	AT	3	6	2067649	2067654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018829	AAT	2	6	2067662	2067667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018829	ATC	2	6	2067674	2067679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_018829	CGC	2	6	2067683	2067688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5030	NC_018829	CGG	2	6	2069209	2069214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_018829	G	6	6	2069287	2069292	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018829	GGAGT	2	10	2069351	2069360	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5034	NC_018829	GCAAA	2	10	2076674	2076683	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5035	NC_018829	AAG	3	9	2078011	2078019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018829	GCG	2	6	2078027	2078032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_018829	ACGG	2	8	2078037	2078044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_018829	CG	3	6	2078048	2078053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_018829	GGC	2	6	2078081	2078086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_018829	AAC	2	6	2078527	2078532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_018829	GCG	2	6	2078561	2078566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_018829	CGG	2	6	2078589	2078594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_018829	CG	5	10	2087461	2087470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_018829	GGC	2	6	2087475	2087480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5046	NC_018829	GC	4	8	2087502	2087509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_018829	GC	4	8	2087522	2087529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_018829	GTG	2	6	2088573	2088578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018829	CGG	2	6	2088593	2088598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_018829	GC	3	6	2088637	2088642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_018829	CG	3	6	2088643	2088648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_018829	GCCG	2	8	2091114	2091121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_018829	GGGC	2	8	2092365	2092372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5056	NC_018829	GGA	2	6	2092464	2092469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_018829	T	7	7	2095178	2095184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018829	GC	3	6	2095209	2095214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_018829	GT	3	6	2095250	2095255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018829	GTAC	2	8	2095265	2095272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_018829	CAG	2	6	2095308	2095313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5065	NC_018829	GC	4	8	2099571	2099578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_018829	TCGCC	2	10	2099632	2099641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5067	NC_018829	CG	3	6	2100518	2100523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_018829	GC	4	8	2100529	2100536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_018829	CGG	3	9	2100539	2100547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_018829	A	6	6	2100549	2100554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_018829	GC	5	10	2101022	2101031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5077	NC_018829	GC	3	6	2102210	2102215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5081	NC_018829	AATC	2	8	2106038	2106045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_018829	A	6	6	2106047	2106052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_018829	GCCG	2	8	2114308	2114315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_018829	GGCC	2	8	2114318	2114325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_018829	T	6	6	2114326	2114331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_018829	GCG	3	9	2122845	2122853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_018829	G	7	7	2125843	2125849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018829	CGATG	2	10	2126448	2126457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5103	NC_018829	GCGG	2	8	2126463	2126470	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_018829	GCCGG	2	10	2126488	2126497	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5105	NC_018829	GCAG	2	8	2126506	2126513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_018829	GC	3	6	2126518	2126523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_018829	GCC	2	6	2126544	2126549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5109	NC_018829	C	6	6	2126560	2126565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5110	NC_018829	GCGG	2	8	2126596	2126603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_018829	T	7	7	2126632	2126638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5114	NC_018829	GC	3	6	2127023	2127028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_018829	CG	4	8	2127054	2127061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_018829	CTTT	2	8	2127127	2127134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_018829	AC	3	6	2127150	2127155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_018829	GGC	2	6	2129782	2129787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5128	NC_018829	GCAA	2	8	2136249	2136256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_018829	CG	3	6	2136413	2136418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_018829	GCC	2	6	2136431	2136436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_018829	CGG	2	6	2136439	2136444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5135	NC_018829	GTG	2	6	2139982	2139987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_018829	CGGT	2	8	2190166	2190173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5269	NC_018829	GCG	2	6	2190421	2190426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5270	NC_018829	GC	3	6	2190470	2190475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5271	NC_018829	AGTG	2	8	2190490	2190497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5354	NC_018829	CG	3	6	2214423	2214428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5387	NC_018829	GCCG	2	8	2227044	2227051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5391	NC_018829	CGGGG	2	10	2230584	2230593	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5392	NC_018829	GCGCG	2	10	2232536	2232545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5393	NC_018829	CG	3	6	2232548	2232553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_018829	GCC	2	6	2232570	2232575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5396	NC_018829	ATA	2	6	2233589	2233594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_018829	GGC	2	6	2233616	2233621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_018829	CGA	2	6	2234723	2234728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_018829	CG	4	8	2234739	2234746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5400	NC_018829	CGC	2	6	2235251	2235256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5401	NC_018829	GGGGC	2	10	2235260	2235269	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5402	NC_018829	GC	3	6	2235278	2235283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5403	NC_018829	CGG	2	6	2237060	2237065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5404	NC_018829	GGCGC	2	10	2237104	2237113	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5405	NC_018829	GC	4	8	2237110	2237117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5406	NC_018829	GAT	2	6	2237140	2237145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5408	NC_018829	C	7	7	2238640	2238646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5414	NC_018829	GGCA	2	8	2249899	2249906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5416	NC_018829	G	12	12	2249938	2249949	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5417	NC_018829	CCG	2	6	2250732	2250737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5421	NC_018829	CCG	2	6	2251661	2251666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5422	NC_018829	AAAG	2	8	2251688	2251695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5425	NC_018829	GGAC	2	8	2253284	2253291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5431	NC_018829	GGC	3	9	2255168	2255176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5432	NC_018829	GC	4	8	2255216	2255223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5433	NC_018829	GCG	2	6	2255622	2255627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5434	NC_018829	CCG	2	6	2255692	2255697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5435	NC_018829	CCG	2	6	2255754	2255759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5437	NC_018829	TGG	2	6	2256616	2256621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5439	NC_018829	CGC	2	6	2258723	2258728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5440	NC_018829	GGCG	2	8	2259204	2259211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5441	NC_018829	CG	3	6	2259210	2259215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5442	NC_018829	GGCC	2	8	2259216	2259223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5443	NC_018829	GC	4	8	2259224	2259231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5444	NC_018829	GCCG	2	8	2260133	2260140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5445	NC_018829	GGCC	2	8	2260162	2260169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5450	NC_018829	AAAG	2	8	2263425	2263432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5451	NC_018829	GGA	2	6	2263461	2263466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5453	NC_018829	GCA	2	6	2267733	2267738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5454	NC_018829	GAG	2	6	2267758	2267763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5455	NC_018829	CGT	2	6	2270666	2270671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5456	NC_018829	GGC	2	6	2270732	2270737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5457	NC_018829	GC	3	6	2270736	2270741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5458	NC_018829	CGC	2	6	2270749	2270754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5467	NC_018829	GC	4	8	2273525	2273532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5499	NC_018829	CGCGG	2	10	2300361	2300370	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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