MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018747	ATATA	2	10	603	612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018747	AATTT	2	10	8206	8215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018747	TAAAT	2	10	19885	19894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018747	AATTA	2	10	22638	22647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018747	TTATT	2	10	56700	56709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018747	AAAAT	3	15	80838	80852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018747	TACAA	2	10	83820	83829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018747	ATTAA	2	10	86743	86752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018747	TTAAC	2	10	93941	93950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018747	TACAA	2	10	108071	108080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018747	TTAAT	2	10	114604	114613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018747	TAAAA	2	10	131105	131114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018747	TTATA	2	10	131117	131126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018747	TAAAA	2	10	137893	137902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018747	ATTAT	2	10	144025	144034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018747	AAAAT	2	10	150579	150588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018747	TAAAA	2	10	150628	150637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018747	TAAAA	2	10	152761	152770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018747	TAAAA	2	10	152803	152812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018747	ATCAG	2	10	169302	169311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018747	GTCAA	2	10	202606	202615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018747	TCTTT	2	10	206097	206106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018747	TTACA	2	10	228530	228539	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018747	TAAAA	2	10	243954	243963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018747	TAAAA	2	10	244657	244666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018747	ATAAA	2	10	244706	244715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018747	TAAAA	2	10	245788	245797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018747	AGAAA	2	10	247549	247558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018747	TTTAA	2	10	249201	249210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018747	TTCTT	2	10	251294	251303	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018747	AACAA	2	10	262809	262818	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018747	TTTAT	2	10	272716	272725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018747	TATAA	3	15	272773	272787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018747	TTTTA	2	10	272816	272825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018747	TAATT	2	10	326978	326987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018747	AAATT	2	10	339219	339228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018747	ATAAA	2	10	354457	354466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018747	AGCAA	2	10	355948	355957	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018747	TAAAA	2	10	360199	360208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018747	TAAAA	2	10	411542	411551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018747	TTAAT	2	10	411630	411639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018747	TAAAA	2	10	436137	436146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018747	TAGCC	2	10	437541	437550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018747	CTCCC	2	10	438642	438651	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_018747	ATTAA	2	10	441528	441537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018747	TCAAT	2	10	442264	442273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018747	AAAAG	2	10	443864	443873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018747	AAAAC	2	10	448732	448741	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018747	TTTAT	2	10	458844	458853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018747	AATTC	2	10	463318	463327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018747	TAAAA	2	10	463376	463385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018747	ATGTT	2	10	464686	464695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018747	TAATA	2	10	480520	480529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018747	TATTT	2	10	480659	480668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018747	AATGT	2	10	481875	481884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018747	TTTTA	2	10	484842	484851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018747	ATGTT	2	10	484978	484987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018747	TTTAT	2	10	489005	489014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018747	GCTTT	2	10	491728	491737	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018747	TAAGT	2	10	495935	495944	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018747	TTAAT	2	10	526672	526681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018747	GTTAT	2	10	533674	533683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018747	GTTTA	2	10	533702	533711	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018747	TTTTA	2	10	538997	539006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018747	TTAAT	2	10	541859	541868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018747	GATTT	2	10	563742	563751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018747	TATTT	2	10	575400	575409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018747	TGATT	2	10	575475	575484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018747	AAATT	2	10	576805	576814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018747	TATTT	2	10	583440	583449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018747	AAATT	2	10	583522	583531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018747	TTTTA	2	10	587475	587484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018747	ATTTG	2	10	590643	590652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018747	GGATA	2	10	606560	606569	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018747	TCTTT	2	10	607535	607544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018747	GTTTT	2	10	618320	618329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018747	ATGTT	2	10	618348	618357	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018747	TATAT	2	10	634063	634072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018747	TTATT	2	10	645192	645201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018747	GATTT	2	10	662096	662105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018747	TTAAA	2	10	686047	686056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018747	TATAT	2	10	687854	687863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018747	ATTTT	2	10	699518	699527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018747	TAATT	2	10	702496	702505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018747	TTTTA	2	10	714319	714328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018747	TATAA	2	10	723706	723715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018747	ATATT	2	10	733532	733541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018747	ATTAT	2	10	742132	742141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018747	ATTTT	2	10	744396	744405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018747	GGGTG	2	10	774017	774026	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018747	AGCTT	2	10	774073	774082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018747	TTTAT	2	10	775030	775039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018747	TCCTT	2	10	781595	781604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018747	ATTAA	2	10	783008	783017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018747	CTTAA	2	10	798631	798640	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018747	ATTAT	2	10	798643	798652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018747	TGCAA	2	10	809138	809147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018747	AAATT	2	10	812846	812855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018747	CTTTT	2	10	818092	818101	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018747	ATTTA	2	10	820114	820123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018747	ATATA	2	10	859443	859452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018747	TATAT	2	10	859465	859474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018747	TTTTA	2	10	859686	859695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018747	AGTTT	2	10	865804	865813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018747	TTTTG	2	10	880326	880335	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.