MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	TAA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018694	GAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018694	TGA	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018694	GAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018694	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018694	AGG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018694	AGG	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018694	TTA	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018694	AGA	2	6	16118	16123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018694	GCA	3	9	20654	20662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018694	AGG	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018694	TCA	2	6	20723	20728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018694	TAA	2	6	22456	22461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018694	AGG	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018694	TTC	2	6	22548	22553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018694	TAC	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018694	GAA	2	6	22594	22599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018694	ACA	2	6	22774	22779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018694	ATG	2	6	22833	22838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018694	CTT	2	6	24271	24276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018694	AAT	2	6	24317	24322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018694	ATT	2	6	24396	24401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018694	TTA	2	6	24423	24428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018694	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018694	GTG	2	6	27813	27818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018694	ACT	2	6	27826	27831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018694	ACT	2	6	27888	27893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018694	AGT	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018694	AGG	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018694	ACA	2	6	28542	28547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018694	TAT	2	6	28556	28561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018694	TTC	2	6	28578	28583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018694	AAT	2	6	28597	28602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018694	AAT	2	6	28978	28983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018694	AGT	2	6	29013	29018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018694	TCT	2	6	29049	29054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018694	GGT	2	6	29113	29118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018694	AGG	2	6	29153	29158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018694	ATG	2	6	29167	29172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018694	TTG	2	6	29200	29205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018694	TCT	2	6	29311	29316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018694	AGA	2	6	29369	29374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018694	TCT	2	6	29389	29394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018694	TAA	2	6	29410	29415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018694	GAT	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018694	AGT	2	6	29673	29678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018694	TCC	2	6	29796	29801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018694	CGC	2	6	29819	29824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018694	ACC	2	6	29829	29834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018694	CCT	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018694	AAG	2	6	29866	29871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018694	AGG	2	6	29880	29885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018694	GTT	2	6	29998	30003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018694	ATC	2	6	30021	30026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018694	TAT	2	6	30049	30054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018694	ATG	2	6	30102	30107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018694	AAT	2	6	30244	30249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018694	ATT	2	6	30286	30291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018694	AGG	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018694	ATA	2	6	30329	30334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018694	GCC	2	6	30342	30347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018694	TAT	2	6	30350	30355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018694	TAA	2	6	30368	30373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018694	TCT	2	6	30406	30411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018694	TAA	2	6	30417	30422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018694	ATT	2	6	30424	30429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018694	TTA	2	6	30465	30470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018694	ATT	2	6	30472	30477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018694	CCT	2	6	30499	30504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018694	GGC	2	6	33388	33393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018694	CTT	2	6	33495	33500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018694	CGT	2	6	33547	33552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018694	TAA	2	6	33684	33689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018694	TCT	2	6	33736	33741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018694	TTC	2	6	33832	33837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018694	CTT	2	6	33925	33930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018694	ATA	2	6	34011	34016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018694	TAA	3	9	34593	34601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018694	CTT	2	6	34656	34661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018694	CAA	2	6	34722	34727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018694	CAA	2	6	34740	34745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018694	ATA	2	6	35404	35409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018694	AGA	2	6	35505	35510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018694	TTG	2	6	35515	35520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018694	AGT	2	6	35651	35656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018694	TAG	2	6	35742	35747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018694	GGA	2	6	35806	35811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018694	ATA	3	9	37177	37185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018694	ACT	2	6	37514	37519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018694	CAA	2	6	37929	37934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018694	TAT	2	6	37940	37945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018694	TAA	2	6	37972	37977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018694	ATG	2	6	38038	38043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018694	AAT	2	6	38328	38333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018694	CAT	2	6	39809	39814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018694	TAA	2	6	39943	39948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018694	GAT	2	6	39962	39967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018694	AGG	2	6	42862	42867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018694	AGG	2	6	43723	43728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018694	GAA	2	6	44189	44194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018694	ATC	2	6	44320	44325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018694	GGA	2	6	44351	44356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018694	AGA	2	6	44427	44432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018694	ATT	2	6	44461	44466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018694	GAA	2	6	44532	44537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018694	TAT	2	6	44905	44910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018694	TAA	2	6	44942	44947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018694	ATC	2	6	45216	45221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018694	AGG	2	6	45301	45306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018694	ATA	2	6	45319	45324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018694	TTA	2	6	45403	45408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018694	AGC	2	6	45424	45429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018694	ATA	2	6	46349	46354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018694	TTC	2	6	46395	46400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018694	AGG	2	6	46435	46440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018694	TAA	2	6	47090	47095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018694	TCA	2	6	47106	47111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018694	GTT	2	6	47805	47810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018694	GAA	2	6	47817	47822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018694	CAT	2	6	47831	47836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018694	ACT	2	6	47850	47855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018694	ATT	2	6	47981	47986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018694	ATG	2	6	48101	48106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018694	ATA	2	6	48114	48119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018694	GTC	2	6	48148	48153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018694	TGA	2	6	48202	48207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018694	GGA	2	6	48357	48362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018694	TTC	2	6	48469	48474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018694	GTT	2	6	48838	48843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018694	CCA	2	6	48902	48907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018694	TAA	2	6	48999	49004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018694	GGA	2	6	49026	49031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018694	TTA	2	6	49260	49265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018694	CAT	2	6	49729	49734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018694	ACC	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018694	TAA	2	6	49833	49838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018694	ACA	2	6	50429	50434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018694	GCT	2	6	50449	50454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018694	GGT	2	6	50626	50631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018694	GAA	3	9	50639	50647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.