MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	ATCAAT	2	12	38817	38828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018693	AAACAT	2	12	63146	63157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018693	ATGTAA	2	12	71003	71014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018693	AAATGT	2	12	115277	115288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018693	GTTTTT	2	12	120888	120899	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018693	GGAAAG	3	18	122300	122317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018693	GTATAT	2	12	130966	130977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018693	TTTTAT	2	12	166608	166619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018693	AGATAA	2	12	166905	166916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018693	TTAATT	2	12	167987	167998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018693	ATCAAA	2	12	223539	223550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018693	TACTTT	2	12	233043	233054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018693	CTTTTT	2	12	243668	243679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018693	CAAGGA	2	12	244469	244480	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018693	GAAATA	2	12	247756	247767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018693	TCTTTT	2	12	252044	252055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018693	AAATTT	2	12	267219	267230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018693	AAAGCA	2	12	293635	293646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018693	TAATAT	2	12	311379	311390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018693	GAAGTA	2	12	342751	342762	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018693	CTTTTT	2	12	372392	372403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018693	AAATAT	2	12	392937	392948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018693	AAGTAT	2	12	422464	422475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018693	CTAATA	2	12	432540	432551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018693	TTATTT	2	12	478457	478468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018693	ATAATT	2	12	481997	482008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018693	GGAGAG	2	12	485002	485013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018693	AAATAA	2	12	487830	487841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018693	AAAGAA	2	12	488642	488653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018693	AAAATT	2	12	493685	493696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018693	CATATC	2	12	523383	523394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018693	AATGAA	2	12	550943	550954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018693	AAAAGT	2	12	551925	551936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018693	AAATGA	2	12	556304	556315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018693	TAAAAA	2	12	557852	557863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018693	ATGGTA	2	12	562115	562126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018693	TCAATT	2	12	580974	580985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018693	TCTTTT	2	12	594314	594325	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018693	GTTTTT	2	12	614720	614731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018693	ATACAA	2	12	620083	620094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018693	ATTTGG	2	12	638519	638530	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018693	ATTTCT	2	12	646942	646953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018693	TTATCA	2	12	656858	656869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018693	AGGTGA	2	12	694793	694804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018693	CTTATA	2	12	727291	727302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018693	AAAAGA	2	12	747808	747819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018693	TTTTTG	2	12	748390	748401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018693	AGTAAC	2	12	751617	751628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018693	TTCGCT	2	12	758348	758359	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018693	TGAATA	3	18	768800	768817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018693	CTTTTT	2	12	787162	787173	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018693	CTTTTT	2	12	870716	870727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018693	TTTATT	2	12	890708	890719	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018693	AATAGA	2	12	901510	901521	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018693	AATCAT	2	12	903508	903519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018693	TAAATG	2	12	909364	909375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018693	GTAATT	2	12	909822	909833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018693	AGAGAT	2	12	910688	910699	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018693	TATTTT	2	12	917171	917182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018693	ATTAAA	2	12	917819	917830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018693	AGCGAA	2	12	968665	968676	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018693	CGATAA	2	12	1036037	1036048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018693	AATATA	2	12	1036185	1036196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018693	CATCAA	2	12	1037005	1037016	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018693	TTCATT	2	12	1037092	1037103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018693	TAAAAA	2	12	1040413	1040424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018693	CAATTA	2	12	1062392	1062403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018693	ATATTT	2	12	1062834	1062845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018693	TATTTT	2	12	1067555	1067566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018693	TAATTT	2	12	1067770	1067781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018693	CTATAG	2	12	1078945	1078956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018693	TTTTTG	2	12	1080084	1080095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018693	AAAATC	2	12	1080170	1080181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018693	ATAAAT	2	12	1098493	1098504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018693	GAGGGA	2	12	1109688	1109699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018693	AAAATG	2	12	1140933	1140944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018693	GAAAGA	2	12	1144022	1144033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018693	AATGAA	2	12	1164635	1164646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018693	TATGAA	2	12	1168767	1168778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018693	TTTTAT	2	12	1187243	1187254	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018693	TAAAAA	2	12	1189837	1189848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018693	ATTCTT	2	12	1228805	1228816	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018693	TACAAA	2	12	1228944	1228955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018693	CATATA	2	12	1240877	1240888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018693	GAGGAA	2	12	1242322	1242333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018693	ATGAGT	2	12	1279385	1279396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018693	TGATTG	2	12	1341240	1341251	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018693	TGTATA	2	12	1346861	1346872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018693	AAATTT	2	12	1372149	1372160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018693	GTTGTA	2	12	1382600	1382611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018693	TTGTAA	2	12	1386966	1386977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018693	AGGAGA	2	12	1392256	1392267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018693	TAGATG	2	12	1394583	1394594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018693	TATAAT	2	12	1401055	1401066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018693	ATTTTC	2	12	1401143	1401154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018693	AGTATA	2	12	1420355	1420366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018693	AACAAG	2	12	1479739	1479750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018693	TAAAAT	2	12	1481687	1481698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018693	AAATAT	2	12	1494857	1494868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018693	ATTTTT	2	12	1515129	1515140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018693	AATTGA	2	12	1538343	1538354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018693	ATGAGG	2	12	1540205	1540216	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018693	TTATAA	2	12	1545525	1545536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018693	ATTACA	2	12	1567783	1567794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018693	TGAAAA	2	12	1571162	1571173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018693	ATATGT	2	12	1574564	1574575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018693	TTAATT	2	12	1574983	1574994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018693	TTTAAA	2	12	1577141	1577152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018693	TTAATT	2	12	1593325	1593336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018693	TTTTAC	2	12	1597729	1597740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018693	GTATTA	2	12	1600298	1600309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018693	ATATAA	2	12	1603563	1603574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018693	TTTGTA	2	12	1611480	1611491	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018693	TATACT	2	12	1627134	1627145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018693	GAAAAC	3	18	1665081	1665098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018693	TTTAAG	2	12	1682713	1682724	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018693	GGAATG	2	12	1683109	1683120	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018693	ATCCAT	2	12	1684756	1684767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018693	TTAGAA	2	12	1688124	1688135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018693	TAAAAT	2	12	1688160	1688171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018693	ATTTTT	2	12	1688194	1688205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018693	TATGTA	2	12	1713340	1713351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018693	TGTTTT	2	12	1783574	1783585	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018693	AAATTA	2	12	1786217	1786228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018693	TAATTT	2	12	1786237	1786248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018693	TAAAAA	2	12	1787557	1787568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018693	TTTTAA	2	12	1793859	1793870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018693	AGTGAG	2	12	1801649	1801660	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018693	TTATAT	2	12	1811391	1811402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_018693	TTAAAA	2	12	5402375	5402386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_018693	ATTTTT	2	12	5409162	5409173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.