MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	AAATC	2	10	4994	5003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018689	AATAA	2	10	8860	8869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018689	GAAAA	2	10	9051	9060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018689	TTTAG	2	10	18142	18151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	ATAAA	2	10	18217	18226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018689	TAAAG	2	10	22270	22279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018689	ATTTA	2	10	25777	25786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018689	AACAA	2	10	28444	28453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018689	GAAAA	2	10	30928	30937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	AATGA	2	10	31035	31044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018689	TGAAT	2	10	31098	31107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018689	AAGGA	2	10	31304	31313	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018689	AATGA	2	10	32957	32966	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018689	AAGTG	2	10	42906	42915	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018689	TTAAA	2	10	53200	53209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018689	AGATT	2	10	53261	53270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018689	TCGTT	2	10	54016	54025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018689	TTATT	2	10	57714	57723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018689	TATTT	2	10	57951	57960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018689	GAAAA	2	10	58026	58035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018689	AAAAT	2	10	61734	61743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018689	AGAGA	2	10	66970	66979	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018689	AAGTA	2	10	66988	66997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018689	TCCTT	2	10	73963	73972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018689	TCAAT	2	10	81055	81064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018689	TCATT	2	10	82081	82090	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018689	CTTTT	2	10	84304	84313	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018689	TTAGA	2	10	85065	85074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018689	TTTTA	2	10	85441	85450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018689	TAATT	2	10	85579	85588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018689	TTAAT	2	10	92033	92042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018689	TTAAT	2	10	92134	92143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018689	TTTTA	2	10	93544	93553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018689	CTTTT	2	10	93893	93902	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018689	TCCCT	2	10	94206	94215	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_018689	CCCTT	2	10	101051	101060	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_018689	TTTTC	2	10	105006	105015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018689	AAGAT	2	10	107146	107155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018689	TACTG	2	10	108983	108992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018689	AAATA	2	10	110972	110981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018689	CTTTT	2	10	112627	112636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018689	TGAAG	2	10	112704	112713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018689	ATTAT	2	10	114498	114507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018689	AAACA	2	10	122090	122099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018689	TGATA	2	10	124288	124297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018689	GCATG	2	10	124441	124450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018689	TTTTA	2	10	128482	128491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018689	TGATA	2	10	128761	128770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018689	ATAGA	2	10	130136	130145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018689	AACAA	2	10	131375	131384	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018689	ATAGA	2	10	131495	131504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018689	AAAGA	2	10	131967	131976	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018689	AAAAT	2	10	133496	133505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018689	GTATA	2	10	135859	135868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018689	TTACT	2	10	137171	137180	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018689	TAGTA	2	10	138669	138678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	TGTGA	2	10	140674	140683	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	AAGAT	2	10	146642	146651	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018689	ATCTT	2	10	146663	146672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018689	AATCC	2	10	152042	152051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018689	CATTA	2	10	152265	152274	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018689	TATTT	2	10	162364	162373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018689	ATAAA	2	10	163860	163869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018689	CTTCT	2	10	171944	171953	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018689	ATTTT	2	10	172189	172198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018689	TTGTT	2	10	172284	172293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018689	ATTTA	2	10	173339	173348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018689	GAAAA	2	10	176012	176021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018689	AGATG	2	10	176924	176933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018689	AAGAT	2	10	178976	178985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018689	ATTTT	2	10	181537	181546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018689	TATTT	2	10	181799	181808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018689	TAATA	2	10	185960	185969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018689	TAAGC	2	10	187769	187778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018689	AACAG	2	10	190945	190954	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018689	TCTTT	2	10	194589	194598	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018689	TTTTA	2	10	198379	198388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018689	TTTTG	2	10	199102	199111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018689	CTTAA	2	10	205011	205020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018689	TAATA	2	10	205130	205139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018689	ATTTT	2	10	211456	211465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018689	TTGTT	2	10	211551	211560	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018689	ATTTT	2	10	222134	222143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018689	TTTCA	2	10	225457	225466	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018689	AATTT	2	10	225467	225476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018689	ATCGC	2	10	227337	227346	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018689	AATAA	2	10	227998	228007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018689	TCCCA	2	10	228631	228640	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_018689	AAAAC	2	10	228704	228713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018689	TAAAA	2	10	229004	229013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018689	AAAGA	2	10	233158	233167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018689	TAATG	2	10	234225	234234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	ATTAA	2	10	234356	234365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018689	ATAAA	2	10	235396	235405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018689	TTCAG	2	10	235568	235577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018689	AAAAG	2	10	235845	235854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018689	TTTTA	2	10	239553	239562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018689	AAAGA	2	10	239779	239788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018689	TATAA	2	10	240042	240051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018689	AAAGA	2	10	241158	241167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018689	AAAGA	2	10	242246	242255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018689	ATATA	2	10	242363	242372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018689	TTGTT	2	10	243899	243908	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018689	TCTTT	2	10	245341	245350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018689	ATTAT	2	10	249103	249112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018689	TTTCT	2	10	249920	249929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018689	CATTT	2	10	250858	250867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018689	ATTAA	2	10	250984	250993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018689	ACTAT	2	10	251745	251754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018689	AATGA	2	10	253846	253855	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	TTCTT	2	10	254435	254444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018689	TCTTT	2	10	256585	256594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018689	TCTTT	2	10	257409	257418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018689	AATTA	2	10	264931	264940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018689	TTTTA	2	10	265066	265075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	TTATA	2	10	265088	265097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018689	TACTT	2	10	266749	266758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018689	TATTT	2	10	275452	275461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018689	GTAAA	2	10	280597	280606	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018689	TACAA	2	10	282671	282680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018689	TGAAA	2	10	286895	286904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018689	TACAA	2	10	288678	288687	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018689	ATTTC	2	10	293133	293142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018689	GGACA	2	10	304065	304074	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018689	GAAGA	2	10	304176	304185	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018689	CTAAA	2	10	305840	305849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018689	ATTAT	2	10	306662	306671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018689	AAAAG	2	10	310476	310485	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018689	AAAGA	2	10	310619	310628	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018689	AAAAG	2	10	311846	311855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018689	AAAAT	2	10	312628	312637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018689	AAATA	2	10	316530	316539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018689	TATCT	2	10	321543	321552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018689	TTATC	2	10	321553	321562	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018689	TAAAA	2	10	322525	322534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018689	CATTC	2	10	327002	327011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018689	AAATC	2	10	329704	329713	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018689	AAGAA	2	10	330534	330543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018689	TAACA	2	10	333995	334004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018689	ATAAA	2	10	334293	334302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018689	TACTT	2	10	337601	337610	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018689	CGAAA	2	10	338175	338184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018689	ACTTC	2	10	349278	349287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018689	CAAAG	2	10	350473	350482	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018689	TTAAC	2	10	352469	352478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018689	CATAA	2	10	355020	355029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018689	TAAAA	2	10	356989	356998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018689	AGCTG	2	10	357252	357261	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018689	TACAT	2	10	359495	359504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018689	AAGAA	2	10	362082	362091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018689	AAGTG	2	10	364145	364154	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018689	TAAAT	2	10	366434	366443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018689	AATGA	2	10	396231	396240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018689	GAAGA	2	10	397882	397891	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018689	AAAAG	2	10	400226	400235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018689	ATACT	2	10	400389	400398	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_018689	TAAAT	2	10	404170	404179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018689	TTTAA	2	10	405278	405287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018689	TTTTA	2	10	405306	405315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018689	ATAAA	2	10	405471	405480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018689	CACTA	2	10	406430	406439	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_018689	AAATT	2	10	407955	407964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018689	TAAAG	2	10	408258	408267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018689	TTAGT	2	10	410896	410905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018689	TAATT	2	10	411287	411296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018689	TATAG	2	10	415785	415794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018689	TATAA	2	10	415831	415840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018689	TAAAG	2	10	418083	418092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018689	CAAAA	2	10	418567	418576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_018689	GAAAT	2	10	419905	419914	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018689	ACTGC	2	10	420048	420057	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_018689	GGAAA	2	10	420459	420468	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018689	AAAGA	2	10	420878	420887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018689	AATTT	2	10	424258	424267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018689	TATAA	2	10	424345	424354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018689	TCTAT	2	10	426765	426774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.