MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	TTTCA	2	10	8070	8079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018687	TTTAT	2	10	11797	11806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018687	ATTTC	2	10	13220	13229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018687	AAATG	2	10	17983	17992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018687	TATTT	2	10	18851	18860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018687	TTAAA	2	10	19857	19866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018687	AATTT	2	10	23781	23790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018687	ATATA	2	10	29342	29351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018687	TAACT	2	10	32692	32701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018687	AAAAT	2	10	36816	36825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018687	TTTTG	2	10	39500	39509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018687	CGAAA	2	10	42579	42588	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018687	AAAAG	2	10	43707	43716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018687	ATAAA	2	10	46904	46913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018687	TTCAT	2	10	52423	52432	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018687	TTGTT	2	10	52519	52528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018687	AGTGA	2	10	66394	66403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018687	ATTTG	2	10	73915	73924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018687	TTATG	2	10	74152	74161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018687	ATATG	2	10	78784	78793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018687	TAAAT	2	10	80451	80460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018687	TTTTA	2	10	81789	81798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018687	ACAAT	2	10	82357	82366	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018687	ATTTA	2	10	85837	85846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018687	ATTTT	2	10	90597	90606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018687	GAGAA	2	10	90937	90946	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018687	AAAGT	2	10	97169	97178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018687	TAATT	2	10	100965	100974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018687	TTATG	2	10	101459	101468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018687	TATGT	2	10	107698	107707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018687	TTTAA	2	10	108548	108557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018687	ACAAA	2	10	110678	110687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018687	ACAAA	2	10	110742	110751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018687	AAAGA	2	10	112239	112248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018687	AAAGA	2	10	116392	116401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018687	TATAA	2	10	117075	117084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018687	TTTAT	2	10	117473	117482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018687	GAAAA	2	10	117768	117777	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018687	ACAAA	2	10	120968	120977	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018687	AAATC	2	10	128014	128023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018687	TAGTA	2	10	129414	129423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018687	TTTTC	2	10	131346	131355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018687	CTGTT	2	10	131422	131431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018687	TATCC	2	10	131583	131592	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018687	AAGAT	2	10	132094	132103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018687	TAATA	2	10	132252	132261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018687	TCATT	2	10	133336	133345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018687	CAAAT	2	10	136053	136062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018687	AATTC	2	10	136434	136443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018687	ATAGA	2	10	138740	138749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018687	ATATT	2	10	140044	140053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018687	ATTTA	2	10	140487	140496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018687	AATAT	2	10	140617	140626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018687	CAATT	2	10	145484	145493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018687	ATTAA	2	10	145591	145600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018687	AACCT	2	10	148095	148104	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018687	TAGAG	2	10	154523	154532	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018687	TTACT	2	10	157202	157211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018687	ATGAA	2	10	159962	159971	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018687	CTATA	2	10	160091	160100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018687	AACAA	2	10	160267	160276	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018687	TTTCA	2	10	162918	162927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018687	TTATT	2	10	164273	164282	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018687	AAGAT	2	10	165333	165342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018687	ATCTT	2	10	165354	165363	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018687	TTATA	2	10	165453	165462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018687	TTTAT	2	10	167788	167797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018687	TATTT	2	10	168035	168044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018687	CATTT	2	10	173678	173687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.