MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	TCCC	2	8	7	14	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_018687	TAAA	2	8	237	244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018687	TTTA	2	8	16247	16254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018687	TTTA	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018687	AACA	2	8	17242	17249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018687	ACTT	2	8	18187	18194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018687	CTTG	2	8	18595	18602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018687	CATA	2	8	18610	18617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018687	CTTT	2	8	18653	18660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018687	CCCT	2	8	18746	18753	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018687	TATT	2	8	18867	18874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018687	ATTT	2	8	19059	19066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018687	ATTT	2	8	19900	19907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018687	AAAT	2	8	19967	19974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018687	CTTA	2	8	21725	21732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018687	ATAC	2	8	21783	21790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018687	TATT	2	8	21881	21888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018687	GTAG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018687	ATTT	2	8	22331	22338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018687	TCCT	2	8	25124	25131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018687	TAGA	2	8	25349	25356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018687	ACAA	2	8	25571	25578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018687	ACAA	2	8	29355	29362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018687	TTGT	2	8	30596	30603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018687	ATGG	2	8	30709	30716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018687	GAAG	2	8	31857	31864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018687	TAAA	2	8	32220	32227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018687	AATA	2	8	32634	32641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018687	AAAT	2	8	32668	32675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018687	AGTC	2	8	33076	33083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018687	AATA	2	8	35344	35351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018687	AATT	2	8	35358	35365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018687	TTTG	2	8	35511	35518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018687	CTTT	2	8	35920	35927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018687	TTAT	2	8	35973	35980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018687	AACC	2	8	36789	36796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018687	GAAA	2	8	36848	36855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018687	TCTT	2	8	36870	36877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018687	GAAA	2	8	37309	37316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018687	GCTT	2	8	38655	38662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018687	ACTA	2	8	38838	38845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018687	CTTG	2	8	38981	38988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018687	TGTA	2	8	39013	39020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018687	AATC	2	8	39145	39152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018687	GAAA	2	8	39580	39587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018687	ATTT	2	8	41619	41626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018687	TTTA	2	8	41711	41718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018687	GCCA	2	8	41965	41972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018687	GTTA	2	8	42194	42201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018687	TATT	2	8	42218	42225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018687	ATTG	2	8	42229	42236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018687	TGCA	2	8	42295	42302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018687	AAGT	2	8	42751	42758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018687	CTTC	2	8	42937	42944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018687	TATC	2	8	42979	42986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018687	AAAG	2	8	43537	43544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018687	GGAT	2	8	43670	43677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018687	GAAG	2	8	44167	44174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018687	CTTT	2	8	47450	47457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018687	TCGG	2	8	49310	49317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018687	ATAA	2	8	49325	49332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018687	ATTT	2	8	52349	52356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018687	AATA	2	8	52445	52452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018687	AAAT	2	8	54386	54393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018687	AAAG	2	8	54701	54708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018687	TCTT	2	8	54743	54750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018687	ATAA	2	8	55095	55102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018687	ATAA	2	8	55801	55808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018687	ATTA	2	8	55846	55853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018687	GTTT	2	8	55859	55866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018687	TCTT	2	8	55892	55899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018687	AAGA	2	8	56041	56048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018687	ATTG	2	8	56804	56811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018687	AAGA	2	8	56916	56923	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018687	CTTT	2	8	56958	56965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018687	TAAT	2	8	60340	60347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018687	TTAT	2	8	60593	60600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018687	AAGA	2	8	60751	60758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018687	TTAC	2	8	61222	61229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018687	TTAA	2	8	61389	61396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018687	TATT	2	8	61505	61512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018687	ATAA	2	8	65713	65720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018687	ATGT	2	8	65774	65781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018687	GTTT	2	8	65861	65868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018687	ATTC	2	8	66125	66132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018687	TACT	2	8	66221	66228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018687	TAAG	2	8	66240	66247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018687	ATTT	2	8	66328	66335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018687	GAAT	2	8	66884	66891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018687	ATTA	2	8	69289	69296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018687	TAGT	2	8	69303	69310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018687	TTAA	2	8	69374	69381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018687	TTCC	2	8	69479	69486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018687	AATA	2	8	69874	69881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018687	ATAA	2	8	70761	70768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018687	TTTC	2	8	70776	70783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018687	TTGT	2	8	71005	71012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018687	ACGA	2	8	71153	71160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018687	AAAG	2	8	73510	73517	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018687	ATCA	2	8	73941	73948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018687	AATC	2	8	78485	78492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018687	AAAT	2	8	80215	80222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018687	ACTA	2	8	80323	80330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018687	TAGT	2	8	80356	80363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018687	CATT	2	8	82384	82391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018687	TGAT	2	8	82453	82460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018687	TAAT	2	8	85819	85826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018687	TCTT	2	8	89967	89974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018687	GATG	2	8	94151	94158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018687	CTTT	2	8	94804	94811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018687	ATCT	2	8	94969	94976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018687	CATA	2	8	95533	95540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018687	TACT	2	8	95566	95573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018687	ATAA	2	8	97337	97344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018687	TAGA	2	8	100065	100072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018687	TTTC	2	8	101068	101075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018687	TAAA	2	8	101254	101261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018687	TTGG	2	8	101287	101294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018687	GAAT	2	8	101331	101338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018687	TATT	2	8	105437	105444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018687	TAGA	2	8	108533	108540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018687	ACAA	2	8	110630	110637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018687	ACTT	2	8	110879	110886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018687	TAAA	2	8	111099	111106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018687	GAGG	2	8	111245	111252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018687	ATGC	2	8	111379	111386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018687	GATG	2	8	111703	111710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018687	ATTT	2	8	111767	111774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018687	ATTT	2	8	112182	112189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018687	AATA	2	8	112314	112321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018687	GAAT	2	8	112461	112468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018687	GATT	2	8	112512	112519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018687	TCAA	2	8	112530	112537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018687	ATAG	2	8	116351	116358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018687	ATTT	2	8	116628	116635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018687	GTCA	2	8	117360	117367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018687	TTCT	2	8	117864	117871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018687	AAAT	2	8	117882	117889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018687	CCAC	2	8	122027	122034	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_018687	TCTT	2	8	122115	122122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018687	CAAA	2	8	123704	123711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018687	ATTT	2	8	124877	124884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018687	AACA	2	8	124992	124999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018687	GTCT	2	8	127834	127841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018687	ATTG	2	8	127887	127894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018687	AACC	2	8	128219	128226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018687	ATCC	2	8	128302	128309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018687	TATG	2	8	128466	128473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018687	TTGG	2	8	129427	129434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018687	CACT	2	8	130972	130979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018687	CTTT	2	8	131286	131293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018687	TAAA	2	8	131920	131927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018687	AATT	2	8	132265	132272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018687	GTTT	2	8	132819	132826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018687	TATT	2	8	133817	133824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018687	CTTC	2	8	134041	134048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_018687	TATT	2	8	134548	134555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018687	CAAA	2	8	134889	134896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_018687	TGGA	2	8	136107	136114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018687	TACA	2	8	136136	136143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_018687	TAAT	2	8	136528	136535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018687	GTTG	2	8	136635	136642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018687	AATT	2	8	136668	136675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018687	CAAC	2	8	136679	136686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_018687	GTTG	2	8	136695	136702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018687	AATT	2	8	138553	138560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018687	TATT	2	8	138848	138855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018687	AATA	2	8	138895	138902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018687	TATC	2	8	139970	139977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_018687	CTGT	2	8	140833	140840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_018687	AAAG	2	8	141083	141090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018687	TAAA	2	8	141826	141833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018687	ATCT	2	8	144609	144616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_018687	AGAT	2	8	144722	144729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018687	CTTC	2	8	145425	145432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_018687	TAAA	2	8	147626	147633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018687	GACG	2	8	147649	147656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_018687	TGAT	2	8	149140	149147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018687	AGCA	2	8	152677	152684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
180	NC_018687	ATTA	2	8	152705	152712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018687	CTTA	2	8	153708	153715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_018687	AATC	2	8	154428	154435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_018687	ATCA	2	8	155519	155526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_018687	AAAG	2	8	155976	155983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018687	TTCT	2	8	156070	156077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_018687	AAAC	2	8	157000	157007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_018687	ACAT	2	8	158428	158435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_018687	TATT	2	8	159681	159688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018687	AATT	2	8	159725	159732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_018687	AATA	2	8	159758	159765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_018687	CTTT	2	8	160073	160080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_018687	CAAA	2	8	160125	160132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_018687	CAAA	2	8	162087	162094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_018687	TAAA	2	8	162254	162261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018687	TTTC	2	8	162967	162974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
196	NC_018687	AGAA	2	8	163078	163085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018687	AGGA	2	8	163116	163123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018687	AACG	2	8	164380	164387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_018687	TTAA	2	8	165830	165837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018687	GCTT	2	8	165892	165899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
201	NC_018687	ATAA	2	8	165930	165937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_018687	CAAG	2	8	166046	166053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
203	NC_018687	ACAT	2	8	167706	167713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
204	NC_018687	TTTA	2	8	167898	167905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_018687	GAAA	2	8	168314	168321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
206	NC_018687	TTTC	2	8	168330	168337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
207	NC_018687	TTTG	2	8	168364	168371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
208	NC_018687	TAGG	2	8	169909	169916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
209	NC_018687	CGTA	2	8	169977	169984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
210	NC_018687	TTGA	2	8	172356	172363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
211	NC_018687	GTCC	2	8	172452	172459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
212	NC_018687	AAGA	2	8	176523	176530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
213	NC_018687	GATT	2	8	182465	182472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.