MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TTA	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018686	TTA	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018686	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018686	TAA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018686	TAA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018686	AGG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018686	ATA	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018686	AAC	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018686	TAA	2	6	11515	11520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018686	TAA	2	6	19046	19051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018686	AAC	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018686	AAC	2	6	22556	22561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018686	CAT	2	6	22655	22660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018686	GTG	2	6	22787	22792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018686	GTG	2	6	24996	25001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018686	TGG	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018686	AAG	2	6	27783	27788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018686	CAC	2	6	27819	27824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018686	AGG	2	6	27921	27926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018686	GTG	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018686	ATG	2	6	29470	29475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018686	ATT	2	6	29553	29558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018686	AGG	2	6	31086	31091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018686	TAA	2	6	35519	35524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018686	TAA	3	9	36534	36542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018686	AAT	2	6	37059	37064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018686	TAT	2	6	37075	37080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018686	GGA	2	6	37733	37738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018686	TTA	2	6	38824	38829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018686	ATA	2	6	38841	38846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018686	TAG	2	6	38875	38880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018686	GTA	2	6	38942	38947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018686	TTC	2	6	38983	38988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018686	GAA	2	6	39013	39018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018686	ATA	2	6	39639	39644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018686	ATT	2	6	39649	39654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018686	GAT	2	6	39716	39721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018686	ATT	2	6	39748	39753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018686	GTA	2	6	42886	42891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018686	GCA	2	6	42930	42935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018686	GAA	2	6	42970	42975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018686	CTT	2	6	43452	43457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018686	AGG	2	6	43541	43546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018686	ACA	2	6	44120	44125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018686	GAA	2	6	44271	44276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018686	ATT	2	6	44330	44335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018686	AGG	2	6	44434	44439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018686	TAT	2	6	45399	45404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018686	ATA	2	6	45467	45472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018686	ACA	2	6	45479	45484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018686	GAG	2	6	45608	45613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018686	GAT	2	6	45628	45633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018686	TAG	2	6	45755	45760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018686	ATT	3	9	46605	46613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018686	TTA	2	6	46631	46636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018686	TCA	2	6	47328	47333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018686	GTA	2	6	47337	47342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018686	TAT	2	6	47531	47536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018686	TAT	2	6	47566	47571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018686	TGT	2	6	47596	47601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018686	TTA	2	6	47897	47902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018686	TCT	2	6	48196	48201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018686	GTT	2	6	48251	48256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018686	TCC	2	6	50603	50608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018686	AAT	2	6	50642	50647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018686	AAC	2	6	51293	51298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018686	ATT	2	6	51323	51328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018686	ATT	2	6	51402	51407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018686	ATT	2	6	51510	51515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018686	TAA	2	6	51524	51529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018686	ATA	2	6	51540	51545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018686	AAG	2	6	51751	51756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018686	ATA	2	6	51758	51763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018686	GTG	2	6	51837	51842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018686	TAA	2	6	52772	52777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018686	GAA	2	6	54015	54020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018686	TAT	2	6	54119	54124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018686	TAA	2	6	54252	54257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018686	TAC	2	6	54280	54285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018686	TCT	2	6	54325	54330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018686	AGC	2	6	55445	55450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018686	TAT	2	6	55451	55456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018686	TAA	2	6	55473	55478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018686	TAT	2	6	55479	55484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018686	AAC	2	6	55566	55571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018686	GAG	2	6	55614	55619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018686	ATA	2	6	56443	56448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018686	CTT	2	6	56475	56480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018686	GAT	2	6	58471	58476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018686	TCC	2	6	58513	58518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018686	TTA	2	6	58541	58546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018686	TAT	2	6	58749	58754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018686	TCG	2	6	58888	58893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018686	TAG	2	6	58925	58930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018686	CTT	2	6	58952	58957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018686	ATA	2	6	59003	59008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018686	AAC	2	6	59337	59342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018686	TAT	2	6	60112	60117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018686	TCG	2	6	60163	60168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018686	ATT	2	6	60185	60190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018686	AGG	2	6	60215	60220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018686	TAA	2	6	60969	60974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018686	TAA	2	6	61005	61010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018686	AGA	2	6	61207	61212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018686	AAG	2	6	63146	63151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018686	ATA	2	6	63986	63991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018686	GTA	2	6	64486	64491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018686	TAG	2	6	64954	64959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018686	CTT	2	6	65048	65053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018686	ATA	2	6	65093	65098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018686	TCC	2	6	65177	65182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018686	ATA	2	6	65200	65205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018686	TTC	2	6	65234	65239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018686	TCC	2	6	65257	65262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018686	TAG	2	6	65331	65336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018686	TAT	2	6	65410	65415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018686	CTT	2	6	67022	67027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018686	TAC	2	6	67038	67043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018686	AGA	2	6	67108	67113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018686	CTG	2	6	67121	67126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018686	TAT	2	6	67254	67259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018686	AGA	2	6	67300	67305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018686	ACA	2	6	67360	67365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018686	ATA	2	6	67395	67400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018686	GCT	2	6	67476	67481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018686	CTT	2	6	67543	67548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018686	TTA	2	6	67663	67668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018686	CTT	2	6	67707	67712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018686	TAC	2	6	69515	69520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018686	ACT	2	6	69529	69534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018686	TTA	2	6	70389	70394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018686	ATT	2	6	70421	70426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018686	TAT	2	6	70479	70484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018686	TTG	2	6	72076	72081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018686	TTA	2	6	72083	72088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018686	TTA	2	6	72323	72328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018686	ACT	2	6	72344	72349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018686	TGA	2	6	72452	72457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018686	AAT	2	6	72479	72484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018686	ATT	2	6	72550	72555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018686	CTT	2	6	72573	72578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018686	TTC	2	6	72587	72592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.