MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	ATAA	2	8	3723	3730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018685	TAAA	2	8	6062	6069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018685	ATTT	2	8	10198	10205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018685	ACGA	2	8	10300	10307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018685	TACA	2	8	13670	13677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018685	TTAC	2	8	15144	15151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018685	ACAA	2	8	16169	16176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018685	TATG	2	8	16493	16500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018685	TAGA	2	8	16647	16654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018685	AAAT	2	8	17012	17019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018685	ATTT	2	8	17228	17235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018685	AGGT	2	8	18691	18698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018685	TTTC	2	8	18932	18939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018685	AGGG	2	8	24055	24062	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018685	GATA	2	8	29494	29501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018685	GGGA	2	8	29817	29824	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018685	AGGA	2	8	31268	31275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018685	GAAA	2	8	39299	39306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018685	TTTG	2	8	41567	41574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018685	TTTC	2	8	41701	41708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018685	GAAA	2	8	43076	43083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018685	AAAT	2	8	43090	43097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018685	TTTG	2	8	43525	43532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018685	TTTC	2	8	45784	45791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018685	TTGT	2	8	47542	47549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018685	TGTT	2	8	47791	47798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018685	AAGG	2	8	47870	47877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018685	CAAT	2	8	48437	48444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018685	ATTT	2	8	50219	50226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018685	AAAG	2	8	50683	50690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018685	CAAA	2	8	50863	50870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018685	AAAG	2	8	50927	50934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018685	ACTC	2	8	50938	50945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018685	AAAC	2	8	54879	54886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018685	ATGT	2	8	55033	55040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018685	ATGA	2	8	58523	58530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018685	AAAC	2	8	58715	58722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018685	TGAT	2	8	62893	62900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018685	TACA	2	8	63017	63024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018685	ATTC	2	8	63156	63163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018685	TTTC	2	8	63171	63178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018685	AACT	2	8	63243	63250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018685	CAAA	2	8	64927	64934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018685	TTAT	2	8	66273	66280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018685	CTTT	2	8	66290	66297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018685	TTAA	2	8	66605	66612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018685	TAAA	2	8	67071	67078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018685	AAGA	2	8	70853	70860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018685	TTAT	2	8	70998	71005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018685	TTTC	2	8	71127	71134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018685	GAAT	2	8	71389	71396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018685	TTTA	2	8	75122	75129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018685	ATTA	2	8	75249	75256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018685	AACA	2	8	75958	75965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018685	GAAG	2	8	76286	76293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018685	AGTT	2	8	76911	76918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018685	CATC	2	8	79859	79866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018685	GATG	2	8	81497	81504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018685	AACA	2	8	81855	81862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018685	TATT	2	8	86072	86079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018685	ATTA	2	8	86217	86224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018685	AAAT	2	8	86245	86252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018685	AAAT	2	8	86957	86964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018685	TATT	2	8	87199	87206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018685	TATT	2	8	89812	89819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018685	AAGG	2	8	89882	89889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018685	ATAA	2	8	90876	90883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018685	ATTT	2	8	93545	93552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018685	TATT	2	8	93568	93575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018685	ATTT	2	8	94700	94707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018685	TTTA	2	8	94782	94789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.