MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	GAA	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018685	CTT	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018685	TAC	3	9	3868	3876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018685	AGT	3	9	4726	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018685	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018685	CTT	2	6	4874	4879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018685	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018685	AAT	2	6	6511	6516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018685	CCT	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018685	AGT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018685	AGG	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018685	ATT	2	6	10243	10248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018685	CAT	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018685	ACA	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018685	GGT	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018685	GAA	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018685	AAT	2	6	10484	10489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018685	ATG	2	6	10518	10523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018685	TCC	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018685	TAA	2	6	11179	11184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018685	TAA	2	6	11220	11225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018685	AAC	2	6	11249	11254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018685	CCT	2	6	13596	13601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018685	ATT	2	6	13606	13611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018685	ATT	2	6	13710	13715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018685	GGA	2	6	16357	16362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018685	GCC	3	9	16385	16393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018685	CAC	2	6	16579	16584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018685	ATA	2	6	16613	16618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018685	ATA	2	6	16665	16670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018685	ATC	3	9	16679	16687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018685	GTT	2	6	16732	16737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018685	ATG	2	6	16745	16750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018685	GAG	3	9	16785	16793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018685	AAT	2	6	16966	16971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018685	TAA	2	6	17183	17188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018685	TTC	2	6	17274	17279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018685	TAG	2	6	17328	17333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018685	TGT	2	6	17337	17342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018685	ATA	2	6	17380	17385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018685	ATT	2	6	17465	17470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018685	TTC	2	6	18555	18560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018685	AAC	2	6	18669	18674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018685	TTC	2	6	18730	18735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018685	TAA	2	6	18781	18786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018685	TAA	2	6	18874	18879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018685	TTA	2	6	20567	20572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018685	TCC	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018685	CTA	2	6	21358	21363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018685	AAT	2	6	21398	21403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018685	AAT	2	6	21472	21477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018685	ACT	2	6	21523	21528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018685	CTT	2	6	21562	21567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018685	AGG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018685	GAA	2	6	25395	25400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018685	GAT	2	6	29417	29422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018685	AGT	2	6	29435	29440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018685	ATC	2	6	29482	29487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018685	CAA	2	6	29888	29893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018685	TAC	2	6	34971	34976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018685	GGA	2	6	39308	39313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018685	GGA	2	6	41035	41040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018685	ATT	2	6	41294	41299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018685	TAT	3	9	41515	41523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018685	ATC	2	6	41605	41610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018685	AGA	2	6	42876	42881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018685	TGA	2	6	42930	42935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018685	TAT	2	6	43168	43173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018685	TCC	2	6	43361	43366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018685	TAT	2	6	43477	43482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018685	AAT	2	6	43495	43500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018685	GAA	2	6	43543	43548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018685	TAG	2	6	43560	43565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018685	ATT	2	6	45059	45064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018685	ATT	2	6	45098	45103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018685	TAT	2	6	45112	45117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018685	ATT	2	6	45161	45166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018685	ATA	3	9	45182	45190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018685	ATT	2	6	45857	45862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018685	TAA	2	6	47536	47541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018685	AAT	2	6	47598	47603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018685	ATA	2	6	47644	47649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018685	AGA	2	6	47678	47683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018685	ATT	2	6	47814	47819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018685	TGA	2	6	48581	48586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018685	GAG	2	6	48617	48622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018685	GTT	2	6	48722	48727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018685	AGG	2	6	48885	48890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018685	TAT	2	6	49866	49871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018685	GAC	2	6	50693	50698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018685	TAA	2	6	50747	50752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018685	TAA	2	6	50847	50852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018685	TAA	2	6	50854	50859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018685	TCT	2	6	50885	50890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018685	ATT	2	6	51923	51928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018685	ACA	2	6	52363	52368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018685	ACA	2	6	52604	52609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018685	GTT	2	6	52627	52632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018685	TCC	2	6	53509	53514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018685	ATT	2	6	53547	53552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018685	TCC	2	6	53662	53667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018685	GTT	2	6	53836	53841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018685	TCC	2	6	54720	54725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018685	ATT	2	6	54899	54904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018685	GTA	2	6	55012	55017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018685	TCC	2	6	55956	55961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018685	ATA	2	6	55992	55997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018685	TTC	2	6	57491	57496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018685	ATT	2	6	57722	57727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018685	TGT	2	6	57804	57809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018685	GAA	2	6	57819	57824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018685	TTC	2	6	58458	58463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018685	TTC	2	6	58555	58560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018685	ATT	2	6	58735	58740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018685	AAT	2	6	58867	58872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018685	TTA	2	6	58949	58954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018685	GAG	2	6	58979	58984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018685	TTA	2	6	62747	62752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018685	TTA	2	6	62796	62801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018685	TGT	2	6	62810	62815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018685	ATG	2	6	62823	62828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018685	AAG	2	6	63062	63067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018685	TAA	2	6	63142	63147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018685	AAT	2	6	63186	63191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018685	ACA	2	6	63201	63206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018685	GAT	2	6	63230	63235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018685	TAA	2	6	64767	64772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018685	ATA	2	6	64788	64793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018685	TTA	2	6	64804	64809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018685	AAT	2	6	64878	64883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018685	CTT	2	6	64917	64922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018685	TTG	2	6	64986	64991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018685	ATT	2	6	65770	65775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018685	AAC	2	6	65793	65798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018685	TTA	2	6	65823	65828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018685	ATC	2	6	65866	65871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018685	AAT	2	6	65946	65951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018685	TCA	2	6	65974	65979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018685	TAT	2	6	65984	65989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018685	AGC	2	6	66047	66052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018685	TGA	2	6	66129	66134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018685	TCC	2	6	66167	66172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.