MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC8

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018684	A	6	6	154	159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018684	AT	3	6	175	180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018684	AAG	2	6	212	217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018684	GAA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018684	TC	3	6	607	612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018684	AT	3	6	636	641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018684	TA	3	6	643	648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018684	CTA	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018684	T	10	10	752	761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018684	T	6	6	817	822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018684	CCG	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018684	ATT	2	6	958	963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018684	AACG	2	8	1038	1045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018684	AAC	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018684	TA	3	6	1251	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018684	CAA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018684	TGAT	2	8	1355	1362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018684	CAA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018684	TAAAA	2	10	1394	1403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018684	A	7	7	1406	1412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018684	AT	3	6	1555	1560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018684	T	7	7	1606	1612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018684	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018684	TTAG	2	8	2976	2983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018684	TGAG	2	8	2995	3002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018684	CAA	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018684	ATT	2	6	3018	3023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018684	A	6	6	3030	3035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018684	GTA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018684	TAT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018684	TTAT	2	8	3114	3121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018684	TTG	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018684	GTTC	2	8	3173	3180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018684	TGA	2	6	3242	3247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018684	TGC	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018684	TGTT	2	8	3317	3324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018684	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018684	AAC	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018684	TAC	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018684	TA	3	6	3462	3467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018684	AT	3	6	3469	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018684	AG	3	6	3497	3502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018684	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018684	GGTA	2	8	3580	3587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018684	TA	3	6	3589	3594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018684	TTC	2	6	3797	3802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018684	CTT	2	6	3894	3899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018684	AT	3	6	3931	3936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018684	T	6	6	3952	3957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018684	AT	3	6	5393	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018684	TTAT	2	8	5409	5416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018684	AT	3	6	5415	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018684	A	7	7	5452	5458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018684	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018684	GTA	2	6	5497	5502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018684	AG	3	6	5535	5540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018684	AGCA	2	8	5542	5549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018684	AGG	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018684	ATT	2	6	5653	5658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018684	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018684	T	7	7	5681	5687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018684	ACA	2	6	5694	5699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018684	ATA	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018684	GCT	2	6	5742	5747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018684	AAG	2	6	5770	5775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018684	TAT	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018684	AGA	2	6	5825	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018684	TA	3	6	5833	5838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018684	GAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018684	A	6	6	5858	5863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018684	A	6	6	6410	6415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018684	GTT	2	6	6437	6442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018684	TA	3	6	6459	6464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018684	AT	3	6	6508	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018684	AAGA	2	8	6518	6525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018684	TGGT	2	8	6591	6598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.