MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a chromosome 2

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018672	TTCCTC	2	12	9978	9989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018672	GATGCC	2	12	30020	30031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018672	ATTTTT	2	12	76684	76695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018672	GAGCGC	2	12	80727	80738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018672	AAGGCG	2	12	121454	121465	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018672	ATTGGA	2	12	138722	138733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018672	TTTCGC	2	12	188622	188633	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018672	GCTACC	2	12	194714	194725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018672	GACGAA	2	12	195670	195681	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018672	CACGAC	2	12	203864	203875	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018672	TGTCCC	2	12	215837	215848	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018672	ACGGCC	3	18	270824	270841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018672	GCGCTC	2	12	320824	320835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018672	ACGCGA	2	12	321045	321056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018672	TCCCCA	2	12	323084	323095	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018672	TCGCGC	2	12	490714	490725	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018672	GCGCTG	2	12	501886	501897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018672	CTGCCT	2	12	519339	519350	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018672	GCCGTC	2	12	547178	547189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018672	CCCGAG	2	12	576405	576416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018672	CGACAT	2	12	576682	576693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018672	GTGCGC	2	12	603920	603931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018672	GAGCCA	2	12	670387	670398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018672	GACGCG	2	12	807520	807531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018672	TGCGGG	2	12	851223	851234	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018672	GGCGCG	2	12	853113	853124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018672	TGTCGC	2	12	870584	870595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018672	TGGACC	2	12	884197	884208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018672	TAGCAA	2	12	915216	915227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018672	GCTGGC	2	12	954765	954776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018672	GTCTGT	2	12	965978	965989	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018672	TTTATT	2	12	970625	970636	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018672	GGGGGC	2	12	1017288	1017299	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018672	TTTCAT	2	12	1018368	1018379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018672	CCCGAT	2	12	1032777	1032788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018672	GCCGCG	2	12	1067284	1067295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018672	CGTCGG	2	12	1095081	1095092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018672	TTTTCA	2	12	1105577	1105588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018672	TGCGCG	2	12	1177847	1177858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018672	CCGCCC	2	12	1206867	1206878	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_018672	CGGCTT	2	12	1214447	1214458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018672	GCTTCC	2	12	1215133	1215144	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018672	GCCGTT	2	12	1236582	1236593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018672	CACGCG	2	12	1241105	1241116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018672	GGCGCG	2	12	1253044	1253055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018672	GCTTCG	2	12	1279112	1279123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018672	GGAAAC	2	12	1314425	1314436	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018672	CGCCAG	2	12	1324812	1324823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018672	GCTGTC	7	42	1339926	1339967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018672	GGCTGA	27	162	1339968	1340129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018672	CTTCAC	2	12	1345159	1345170	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018672	GACCGC	2	12	1368855	1368866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018672	CTATCG	2	12	1368892	1368903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018672	CCGCTA	2	12	1369047	1369058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018672	CGCGCA	2	12	1382140	1382151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018672	CGCAAA	2	12	1389155	1389166	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018672	GTCGCG	2	12	1401123	1401134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018672	CGGCTC	2	12	1402805	1402816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018672	CTGTTT	2	12	1477344	1477355	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018672	TACGCG	2	12	1539210	1539221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018672	CGCCGG	2	12	1543791	1543802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018672	CCTGTT	2	12	1549529	1549540	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018672	CACCTC	2	12	1581530	1581541	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018672	GTCGTG	2	12	1647012	1647023	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018672	TGCAGT	2	12	1690741	1690752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018672	CAGCAC	2	12	1705083	1705094	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018672	GCGTGC	2	12	1747575	1747586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018672	ACGATG	2	12	1757041	1757052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018672	TGGCGT	2	12	1776233	1776244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018672	GAAGGT	2	12	1801331	1801342	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018672	GCAAAG	2	12	1881629	1881640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018672	TCACGC	2	12	1885568	1885579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018672	CGCGGG	2	12	1894397	1894408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018672	CGGTCG	2	12	1961440	1961451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018672	TGCGAA	2	12	2052076	2052087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018672	CGTTCT	2	12	2132899	2132910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018672	GCGCCG	2	12	2163224	2163235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018672	CCGCGT	2	12	2170535	2170546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018672	GTGGAA	2	12	2194707	2194718	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018672	GCCAAT	2	12	2203057	2203068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018672	CAAGCG	2	12	2215834	2215845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018672	GCAATG	2	12	2231467	2231478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018672	TTGACG	2	12	2243088	2243099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018672	AACGCG	2	12	2315516	2315527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018672	TGCGGC	2	12	2368621	2368632	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018672	CAAGCA	2	12	2368654	2368665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018672	GCATCG	2	12	2378550	2378561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018672	GCTCAC	2	12	2391907	2391918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018672	ACCGCG	2	12	2401930	2401941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018672	GGGAAG	2	12	2503518	2503529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018672	CTCGCG	2	12	2509775	2509786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018672	TCGATG	2	12	2617312	2617323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018672	GCCGAG	2	12	2617467	2617478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018672	TTTCAC	2	12	2618829	2618840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018672	CAACGA	2	12	2618882	2618893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018672	AGAATA	2	12	2648990	2649001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018672	CCGGGG	2	12	2704569	2704580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.