MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a chromosome 2

Total Repeats: 8442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018672	CGA	2	6	507294	507299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_018672	GTA	2	6	507343	507348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018672	AAAGA	2	10	507361	507370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018672	CGA	2	6	507410	507415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_018672	AGA	2	6	507496	507501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018672	GGC	2	6	507535	507540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_018672	GCC	2	6	507550	507555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_018672	GCT	2	6	507558	507563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_018672	GCT	2	6	508263	508268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_018672	GGC	2	6	508283	508288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_018672	GGTC	2	8	508297	508304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_018672	TC	3	6	508412	508417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_018672	A	7	7	508435	508441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018672	A	6	6	508451	508456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018672	CACG	2	8	508549	508556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_018672	TTA	2	6	508618	508623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018672	TGTT	2	8	509259	509266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018672	CCG	2	6	509279	509284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_018672	TTGA	2	8	509961	509968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018672	TGA	2	6	510009	510014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018672	CGC	2	6	510057	510062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_018672	AGCA	2	8	510096	510103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_018672	TTCG	2	8	510117	510124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_018672	CG	3	6	510123	510128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_018672	TGCG	2	8	510130	510137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_018672	A	7	7	510146	510152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018672	GAAC	2	8	510237	510244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_018672	TGA	2	6	512839	512844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018672	CG	3	6	514316	514321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_018672	TTGG	2	8	515675	515682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_018672	TGCAT	2	10	515696	515705	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1532	NC_018672	ATT	2	6	515859	515864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018672	TC	3	6	515883	515888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_018672	GTC	2	6	515946	515951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_018672	AAGC	2	8	515986	515993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_018672	ACG	2	6	516014	516019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_018672	CAC	2	6	516873	516878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_018672	AGA	2	6	516926	516931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018672	TCC	3	9	517736	517744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_018672	GCA	2	6	517769	517774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_018672	TCG	2	6	517800	517805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_018672	CCG	2	6	517812	517817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_018672	CGG	2	6	517828	517833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_018672	TCG	2	6	517858	517863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_018672	CTGCCT	2	12	519339	519350	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_018672	GTTC	2	8	519373	519380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_018672	CA	3	6	519424	519429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_018672	GCC	2	6	519470	519475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_018672	GCC	2	6	519532	519537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_018672	GCA	2	6	519792	519797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_018672	AAG	2	6	520596	520601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018672	ATA	2	6	521834	521839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018672	GAA	2	6	521894	521899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018672	GCC	2	6	524162	524167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_018672	CGCGC	2	10	524206	524215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1556	NC_018672	CCG	2	6	524219	524224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_018672	TTC	2	6	524260	524265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_018672	TCGC	2	8	524278	524285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_018672	ATG	2	6	524300	524305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018672	G	6	6	524307	524312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_018672	AC	3	6	524681	524686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_018672	CG	3	6	524696	524701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_018672	CG	3	6	524787	524792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_018672	AGCG	2	8	524860	524867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_018672	CGCC	2	8	524874	524881	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1566	NC_018672	CG	4	8	524909	524916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_018672	GAAA	2	8	524965	524972	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018672	ATG	2	6	525386	525391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018672	CG	3	6	525408	525413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_018672	CACG	2	8	525416	525423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_018672	TTA	2	6	525427	525432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018672	GC	3	6	525461	525466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_018672	AT	3	6	525490	525495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018672	GCG	2	6	525508	525513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_018672	GAA	3	9	528272	528280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_018672	GGC	2	6	528287	528292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_018672	GCC	2	6	528309	528314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_018672	ACG	2	6	528323	528328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_018672	CG	3	6	528355	528360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_018672	GCC	2	6	528414	528419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_018672	CGCA	2	8	528459	528466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_018672	CTCG	2	8	528473	528480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_018672	CGG	2	6	529439	529444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_018672	CGCA	2	8	529449	529456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_018672	GTC	2	6	529475	529480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_018672	CTTTT	2	10	529486	529495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_018672	GCT	2	6	529496	529501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_018672	CGG	2	6	530797	530802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018672	A	6	6	530807	530812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018672	CG	3	6	531440	531445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_018672	TGA	2	6	531451	531456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018672	CG	3	6	531470	531475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_018672	CG	3	6	531488	531493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_018672	CG	3	6	531532	531537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_018672	TTC	2	6	531560	531565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_018672	GCC	2	6	532650	532655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_018672	T	6	6	533076	533081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_018672	CATG	2	8	534721	534728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_018672	GC	3	6	536577	536582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_018672	CTC	2	6	537252	537257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_018672	GCG	2	6	537279	537284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_018672	GCA	2	6	538529	538534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_018672	ACAA	2	8	538551	538558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_018672	TC	3	6	538653	538658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_018672	A	6	6	538663	538668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_018672	GAC	2	6	538715	538720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_018672	ACAG	2	8	538825	538832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_018672	CA	3	6	538851	538856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_018672	GCC	2	6	539575	539580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_018672	TCT	2	6	539813	539818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_018672	TGT	2	6	539819	539824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018672	CGG	2	6	539825	539830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_018672	GCAC	2	8	539865	539872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_018672	GAAA	2	8	539904	539911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018672	GC	5	10	539945	539954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_018672	A	6	6	539959	539964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018672	GCT	2	6	540034	540039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_018672	GC	3	6	540097	540102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_018672	GCGT	2	8	541184	541191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_018672	AGA	2	6	541688	541693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_018672	AC	3	6	541719	541724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_018672	CAT	2	6	541735	541740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_018672	CGC	2	6	541749	541754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_018672	TG	3	6	541803	541808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_018672	CGA	2	6	541834	541839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_018672	AGC	2	6	544253	544258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_018672	GTC	2	6	545774	545779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_018672	TTGC	2	8	545800	545807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_018672	GAA	2	6	545818	545823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018672	GCG	2	6	545831	545836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_018672	CTT	2	6	545916	545921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_018672	ATG	2	6	545960	545965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018672	CG	3	6	546049	546054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_018672	CG	3	6	546160	546165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_018672	ATG	2	6	546222	546227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_018672	CGA	2	6	546365	546370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1909	NC_018672	GCA	2	6	631455	631460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_018672	TGC	2	6	631468	631473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_018672	CGC	2	6	631820	631825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1912	NC_018672	GC	3	6	631865	631870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1913	NC_018672	CAT	2	6	631904	631909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_018672	CGC	2	6	631943	631948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1915	NC_018672	GCG	2	6	631986	631991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1916	NC_018672	CAA	2	6	631998	632003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1917	NC_018672	GA	3	6	633145	633150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_018672	GAA	2	6	633165	633170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_018672	CGA	2	6	633180	633185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1921	NC_018672	CCA	2	6	633195	633200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1922	NC_018672	GAC	2	6	633201	633206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_018672	CGC	2	6	633214	633219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1924	NC_018672	CG	4	8	633222	633229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1925	NC_018672	CG	3	6	633236	633241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1926	NC_018672	GCA	2	6	634244	634249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1927	NC_018672	GCG	2	6	634260	634265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1928	NC_018672	CG	3	6	634264	634269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1929	NC_018672	CG	3	6	634282	634287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1931	NC_018672	CG	3	6	639311	639316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1932	NC_018672	TGC	2	6	639319	639324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1933	NC_018672	CCG	2	6	639342	639347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1934	NC_018672	ACGGC	2	10	641305	641314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1935	NC_018672	CAT	2	6	641389	641394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1936	NC_018672	GC	3	6	641431	641436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1937	NC_018672	CTC	2	6	641487	641492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1938	NC_018672	CTG	2	6	641505	641510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1939	NC_018672	AAT	2	6	641512	641517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1940	NC_018672	CGGC	2	8	641528	641535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1941	NC_018672	GCCA	2	8	641542	641549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1942	NC_018672	CTG	2	6	641558	641563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_018672	CGCC	2	8	642440	642447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1944	NC_018672	GCG	2	6	642534	642539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1945	NC_018672	CCG	2	6	642541	642546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1946	NC_018672	GAG	2	6	642552	642557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_018672	T	7	7	645356	645362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_018672	CG	3	6	645368	645373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1949	NC_018672	CG	3	6	645385	645390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1950	NC_018672	GT	3	6	645770	645775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_018672	CAG	2	6	645779	645784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1952	NC_018672	AGG	2	6	645798	645803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_018672	GCG	2	6	646879	646884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1954	NC_018672	AGCA	2	8	646921	646928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1955	NC_018672	GC	3	6	646946	646951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1956	NC_018672	TGC	2	6	646971	646976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1957	NC_018672	CG	3	6	646987	646992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1958	NC_018672	GCC	2	6	646996	647001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1959	NC_018672	GCA	2	6	647073	647078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1961	NC_018672	TCC	2	6	648253	648258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1963	NC_018672	CGGCG	2	10	650293	650302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1965	NC_018672	GCG	2	6	651812	651817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1972	NC_018672	TCG	2	6	655130	655135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1979	NC_018672	CG	3	6	655431	655436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1980	NC_018672	CGCC	2	8	656152	656159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1981	NC_018672	ACC	2	6	660554	660559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1985	NC_018672	GCGCC	2	10	660700	660709	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1986	NC_018672	CGCC	2	8	660714	660721	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1987	NC_018672	GCC	2	6	660733	660738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1990	NC_018672	CGG	3	9	665599	665607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1992	NC_018672	GCG	2	6	665875	665880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1994	NC_018672	TC	4	8	665900	665907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2000	NC_018672	TAA	2	6	667516	667521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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