MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	ATTAAT	2	12	6708	6719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018604	TATAAT	2	12	58014	58025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018604	TTGGTA	2	12	88340	88351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018604	TTTTTA	2	12	96567	96578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018604	TGATAG	2	12	111263	111274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018604	TAAAAC	2	12	126248	126259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018604	TTATGT	2	12	167855	167866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018604	ATTTTT	2	12	168359	168370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018604	AATTAA	2	12	177440	177451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018604	AGTTAA	2	12	177498	177509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018604	TATAAT	2	12	181212	181223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018604	ATAATT	2	12	189691	189702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018604	ATTTTA	2	12	196612	196623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018604	ATAAAA	2	12	223362	223373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018604	ACTATA	2	12	237391	237402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018604	ATAAAA	2	12	244526	244537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018604	ACAAAA	2	12	263095	263106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018604	AACAAA	2	12	265875	265886	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018604	ATATGT	2	12	292648	292659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018604	TTTCAT	2	12	296596	296607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018604	CAATAT	2	12	301471	301482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018604	AATTAA	2	12	302099	302110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018604	AGTTAA	2	12	302157	302168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018604	ACAATA	2	12	313587	313598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018604	TATATT	2	12	322021	322032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018604	TAAAAA	2	12	384876	384887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018604	ATTTTA	2	12	392557	392568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018604	TTTATA	2	12	407986	407997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018604	TGTTTT	2	12	409518	409529	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018604	TTTTAG	2	12	416878	416889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018604	ACCCTC	2	12	418319	418330	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018604	TATTTT	2	12	420828	420839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018604	ATTTTT	2	12	421373	421384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018604	TATTTT	2	12	443471	443482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018604	GTTTTA	2	12	450180	450191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018604	TAAAAA	2	12	496341	496352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018604	ATTATA	2	12	508162	508173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018604	AATTAA	2	12	529828	529839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018604	TAAAAA	2	12	535625	535636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018604	AATTAA	2	12	541889	541900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018604	AGTTAA	2	12	541947	541958	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018604	TAAAAC	2	12	548593	548604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018604	CGTATA	2	12	576877	576888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018604	TAAAGC	2	12	576999	577010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018604	TATCAA	2	12	588366	588377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018604	ATGCAA	2	12	603917	603928	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018604	TTTAAA	2	12	604010	604021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018604	ATTAAT	2	12	626059	626070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018604	CTTTTT	2	12	627594	627605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018604	TTAAAA	2	12	635263	635274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018604	ATATTT	2	12	635440	635451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018604	TGTATT	2	12	659295	659306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018604	ATGTTT	2	12	661061	661072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018604	ATAATT	2	12	664902	664913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018604	TAAAAA	2	12	724458	724469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018604	ATTTTA	2	12	737372	737383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018604	TTTTAA	2	12	744826	744837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018604	AAAACA	2	12	744935	744946	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018604	TATAGC	2	12	747692	747703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018604	TATAAA	2	12	781892	781903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018604	AAATTA	2	12	787345	787356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018604	AATTTA	2	12	787438	787449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018604	ATTTAA	2	12	796446	796457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018604	AGGTAA	2	12	829020	829031	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018604	TAAAAA	2	12	833397	833408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018604	TAAAAA	2	12	833459	833470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018604	AGAAAA	2	12	833478	833489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018604	TAAAAC	2	12	855529	855540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018604	ATTTAT	2	12	910618	910629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018604	AAATTA	2	12	929075	929086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018604	CATTAT	2	12	931032	931043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018604	TCTTAA	2	12	965056	965067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018604	TTAATT	2	12	965151	965162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018604	AGTGTA	2	12	1015195	1015206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018604	TTTTAT	2	12	1027801	1027812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018604	CTTTAT	2	12	1040256	1040267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018604	TAAAGT	2	12	1050401	1050412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018604	ATTTTT	2	12	1070507	1070518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018604	ACCTTT	2	12	1072895	1072906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018604	AATTAA	2	12	1074239	1074250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018604	AGTTAA	2	12	1074297	1074308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018604	ATTAAA	2	12	1079120	1079131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018604	TATAAA	2	12	1080651	1080662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018604	TTTTAA	2	12	1092683	1092694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018604	ATTTTT	2	12	1139003	1139014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018604	ATAAAA	2	12	1140182	1140193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018604	TAATTT	2	12	1175120	1175131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018604	TTTATT	2	12	1188076	1188087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018604	AATATT	2	12	1199528	1199539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018604	TTTTTA	2	12	1233537	1233548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018604	ATAGAT	2	12	1244657	1244668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018604	AATGAT	2	12	1284887	1284898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018604	AATTAA	2	12	1298372	1298383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018604	AGTTAA	2	12	1298430	1298441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018604	AAAACA	2	12	1354419	1354430	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018604	ATATTT	2	12	1369660	1369671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018604	TGTTTA	2	12	1384763	1384774	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018604	AATTAT	2	12	1388433	1388444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018604	TAAAAA	2	12	1427448	1427459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018604	TTTTCT	2	12	1434427	1434438	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018604	TTTTTA	2	12	1434508	1434519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018604	ATTAAA	2	12	1441173	1441184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018604	AATTAT	2	12	1451582	1451593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018604	TATTAA	2	12	1453481	1453492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018604	TTATTT	2	12	1504952	1504963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018604	TTTAAA	2	12	1505126	1505137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018604	ACAAAA	2	12	1514130	1514141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018604	TAGATT	2	12	1565488	1565499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018604	AATATA	2	12	1591396	1591407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018604	TGTTTT	2	12	1635073	1635084	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018604	TCTTAA	2	12	1638914	1638925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018604	TTAATT	2	12	1639009	1639020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018604	TAATAT	2	12	1643358	1643369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018604	TATTTT	2	12	1665298	1665309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018604	TAAATA	2	12	1672886	1672897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018604	AATTAA	2	12	1715534	1715545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018604	AGTAAT	2	12	1716876	1716887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018604	CTAATA	2	12	1766846	1766857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018604	TTATAT	2	12	1767959	1767970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018604	AGGCGA	2	12	1795680	1795691	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018604	ATTTTA	2	12	1837831	1837842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018604	AATTAA	2	12	1843525	1843536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018604	AGTTAA	2	12	1843583	1843594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018604	ATTTAA	2	12	1857827	1857838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018604	GCCCCC	2	12	1868137	1868148	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
126	NC_018604	ATCATA	2	12	1868269	1868280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018604	AAAATT	2	12	1868288	1868299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018604	ATTTTA	2	12	1898088	1898099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018604	TTTTAT	2	12	1908262	1908273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018604	TTAATT	2	12	1982811	1982822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018604	AATTAT	2	12	1987139	1987150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018604	ATTTAT	2	12	1990319	1990330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018604	TAAATA	2	12	1990383	1990394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018604	TTTAAT	2	12	2037102	2037113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018604	TTTTAA	2	12	2037423	2037434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018604	ACTTTT	2	12	2108058	2108069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_018604	ATTATA	2	12	2119851	2119862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018604	TGTTTT	2	12	2121065	2121076	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018604	ATAATT	2	12	2136699	2136710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018604	TTTTAA	2	12	2136771	2136782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018604	AAATAT	2	12	2138209	2138220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_018604	AAAACA	2	12	2143808	2143819	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_018604	TACATA	2	12	2174332	2174343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018604	ATTTGA	2	12	2180440	2180451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018604	ATAAAA	2	12	2244044	2244055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018604	CTAATA	2	12	2251860	2251871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_018604	TCTTAA	2	12	2256130	2256141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_018604	TTAATT	2	12	2256225	2256236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018604	TTTTAT	2	12	2263730	2263741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018604	GGTATT	2	12	2296933	2296944	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018604	TTTATA	2	12	2326110	2326121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018604	TAAAAA	2	12	2339149	2339160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018604	ATAAAA	2	12	2343780	2343791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.