MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 10457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018533	ATT	2	6	481260	481265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_018533	A	6	6	481315	481320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018533	GTT	2	6	481324	481329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_018533	ATG	2	6	481367	481372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_018533	A	6	6	481373	481378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_018533	GCT	2	6	481430	481435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_018533	AAG	2	6	481472	481477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_018533	GTT	2	6	481502	481507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_018533	TG	3	6	481524	481529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_018533	A	6	6	481562	481567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_018533	T	8	8	482326	482333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_018533	TC	3	6	482344	482349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_018533	TA	4	8	483717	483724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_018533	CAT	2	6	483759	483764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_018533	TGA	2	6	483851	483856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_018533	TACCA	2	10	483864	483873	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3017	NC_018533	A	6	6	483879	483884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_018533	CAT	2	6	483893	483898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_018533	T	7	7	483898	483904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_018533	AG	3	6	484780	484785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_018533	GTG	2	6	484796	484801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_018533	ATG	2	6	484829	484834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_018533	GAA	2	6	484838	484843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_018533	A	6	6	484851	484856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_018533	CAA	2	6	484867	484872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_018533	GGT	2	6	484873	484878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_018533	A	6	6	484908	484913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_018533	AAG	2	6	484924	484929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_018533	GAG	2	6	484943	484948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_018533	ATT	2	6	484950	484955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018533	GAG	2	6	484961	484966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_018533	A	6	6	484978	484983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018533	AAAAG	2	10	485017	485026	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_018533	CAAT	2	8	485090	485097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_018533	TTG	3	9	485154	485162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018533	TCT	2	6	485164	485169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_018533	GTA	2	6	485184	485189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_018533	GAA	2	6	488037	488042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_018533	TAA	2	6	488063	488068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_018533	TAA	2	6	490479	490484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_018533	AAC	2	6	491886	491891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_018533	T	8	8	491894	491901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018533	GAAG	2	8	491921	491928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018533	T	6	6	494898	494903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018533	ATT	2	6	494990	494995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_018533	T	6	6	495034	495039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_018533	T	8	8	495061	495068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_018533	T	6	6	495117	495122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_018533	T	6	6	495130	495135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_018533	GTA	2	6	495145	495150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_018533	TAT	2	6	495157	495162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_018533	TAA	2	6	495207	495212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018533	ATTT	2	8	495265	495272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_018533	GTAT	2	8	495281	495288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_018533	TAT	2	6	495340	495345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_018533	TTCA	2	8	495348	495355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_018533	T	6	6	495372	495377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_018533	ATG	2	6	495388	495393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_018533	ATT	2	6	495396	495401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_018533	ATC	2	6	495403	495408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_018533	TAA	2	6	495429	495434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_018533	T	6	6	495580	495585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_018533	T	7	7	495658	495664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_018533	ATG	2	6	495677	495682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_018533	TTAT	2	8	495684	495691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018533	TAA	2	6	495734	495739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018533	TAA	2	6	495747	495752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_018533	CAT	2	6	495774	495779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_018533	GAG	2	6	495808	495813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_018533	T	6	6	495851	495856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018533	A	6	6	495859	495864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_018533	T	6	6	496816	496821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_018533	AT	3	6	496825	496830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_018533	ATT	2	6	496838	496843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_018533	T	8	8	496845	496852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_018533	TCG	2	6	496867	496872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_018533	T	6	6	496879	496884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_018533	ATC	2	6	496926	496931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_018533	CTT	2	6	496938	496943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_018533	TCA	2	6	496958	496963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_018533	AG	3	6	496971	496976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018533	CTT	2	6	496982	496987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_018533	ATT	2	6	496988	496993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_018533	ATTCC	2	10	497002	497011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3085	NC_018533	AG	3	6	497091	497096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_018533	T	8	8	497108	497115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_018533	A	7	7	497151	497157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_018533	TCTG	2	8	497192	497199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_018533	TGG	2	6	497225	497230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018533	TAC	2	6	497271	497276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_018533	AGG	2	6	497291	497296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_018533	ACA	2	6	497319	497324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_018533	GAT	2	6	497329	497334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018533	A	6	6	497347	497352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018533	CAG	2	6	497440	497445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_018533	GCA	2	6	497455	497460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_018533	GTT	2	6	497499	497504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_018533	CATG	2	8	497548	497555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_018533	AACG	2	8	497638	497645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_018533	AAT	2	6	500039	500044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018533	T	7	7	500123	500129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018533	TTTTAC	2	12	500141	500152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3103	NC_018533	ATT	2	6	500253	500258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018533	AT	3	6	500276	500281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018533	T	6	6	500295	500300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018533	T	6	6	502937	502942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018533	ATGA	2	8	502963	502970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_018533	ATG	2	6	503905	503910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_018533	A	6	6	504018	504023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_018533	GAA	2	6	504024	504029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_018533	GGT	2	6	504063	504068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_018533	GAA	2	6	504079	504084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_018533	TCA	3	9	504121	504129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_018533	CTT	2	6	504179	504184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_018533	TAA	2	6	504252	504257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018533	ATA	2	6	504275	504280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018533	GAA	2	6	504300	504305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018533	CAT	2	6	504327	504332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_018533	TTGCT	2	10	504366	504375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3120	NC_018533	T	6	6	504388	504393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018533	CTTA	2	8	504404	504411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_018533	GAAAA	2	10	504567	504576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018533	A	6	6	504612	504617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018533	CTTAA	2	10	504773	504782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3125	NC_018533	ATT	3	9	504808	504816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018533	CCT	2	6	506949	506954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_018533	TAGC	2	8	507046	507053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_018533	T	6	6	507074	507079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_018533	AT	3	6	509987	509992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_018533	ATT	2	6	509997	510002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_018533	ATA	2	6	510032	510037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_018533	C	6	6	510058	510063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3133	NC_018533	A	6	6	510089	510094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_018533	ATA	2	6	510112	510117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_018533	TAT	2	6	510122	510127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_018533	TTA	2	6	510146	510151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_018533	T	6	6	510229	510234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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