MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 10457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018533	TTTG	2	8	283651	283658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018533	A	6	6	283683	283688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018533	TTA	2	6	283690	283695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018533	ATC	2	6	283699	283704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_018533	TCGA	2	8	283718	283725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_018533	AGC	2	6	283753	283758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_018533	T	6	6	283781	283786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018533	TAT	3	9	283829	283837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018533	AGG	2	6	283850	283855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018533	GGT	2	6	283893	283898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018533	TCTT	2	8	283936	283943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_018533	GAT	2	6	283958	283963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018533	TTC	2	6	283981	283986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_018533	GTG	2	6	284004	284009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018533	TTA	3	9	284294	284302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018533	GGA	2	6	284359	284364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018533	T	6	6	284367	284372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018533	ATT	2	6	284417	284422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_018533	TTC	2	6	284462	284467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_018533	CAA	2	6	284513	284518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_018533	GAA	2	6	284532	284537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018533	TCA	2	6	284540	284545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018533	TTA	2	6	284554	284559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018533	ATTG	2	8	284683	284690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018533	ATT	2	6	284751	284756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018533	TGT	2	6	284758	284763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018533	TGG	2	6	284787	284792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_018533	TTCT	2	8	284802	284809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_018533	ATT	2	6	284861	284866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018533	CTT	2	6	284868	284873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_018533	T	7	7	284895	284901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018533	ATT	2	6	284903	284908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018533	TTCA	2	8	284958	284965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_018533	GATT	2	8	285296	285303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018533	TCT	2	6	285307	285312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_018533	TTTA	2	8	285350	285357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018533	TTA	2	6	285359	285364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018533	TTG	2	6	285400	285405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018533	GGGT	2	8	285407	285414	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_018533	TTGG	2	8	285439	285446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_018533	CGTG	2	8	285469	285476	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_018533	TGC	2	6	285495	285500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018533	GAT	2	6	285557	285562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018533	T	6	6	285583	285588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018533	ATT	2	6	285624	285629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018533	CTTC	2	8	285641	285648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_018533	CTTC	2	8	285658	285665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_018533	CT	3	6	285703	285708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_018533	TAT	2	6	285716	285721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_018533	T	7	7	285725	285731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018533	GTT	2	6	285752	285757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018533	TTG	2	6	285766	285771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018533	A	6	6	285869	285874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018533	ATT	2	6	285878	285883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018533	AAG	2	6	285906	285911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018533	CTGGTG	2	12	285926	285937	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_018533	G	6	6	285937	285942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018533	AATCTG	2	12	285943	285954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1559	NC_018533	ATT	2	6	285992	285997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018533	T	6	6	286001	286006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_018533	ATCA	2	8	286018	286025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_018533	TAA	2	6	286040	286045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018533	TTA	2	6	286053	286058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018533	AGA	2	6	286067	286072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018533	T	6	6	286111	286116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018533	ATTA	2	8	286200	286207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_018533	CTGA	2	8	286231	286238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_018533	AG	4	8	286240	286247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018533	ACA	2	6	286267	286272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_018533	GTTT	2	8	286284	286291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018533	ATG	2	6	286338	286343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018533	ATT	2	6	286362	286367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018533	TGA	2	6	286374	286379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018533	GC	3	6	286412	286417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_018533	A	6	6	286442	286447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_018533	AAT	2	6	286452	286457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018533	TG	3	6	286493	286498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018533	TGA	2	6	286522	286527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018533	TTG	2	6	286540	286545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_018533	AGAT	2	8	286647	286654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018533	TCT	2	6	287217	287222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_018533	ATT	2	6	287249	287254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018533	TTA	2	6	287284	287289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_018533	TTG	2	6	287332	287337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_018533	T	6	6	287380	287385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_018533	ATG	2	6	288233	288238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_018533	TGT	2	6	289267	289272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018533	T	7	7	289272	289278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018533	TGC	2	6	289289	289294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_018533	GA	3	6	290464	290469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_018533	TAT	2	6	290488	290493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_018533	T	7	7	290493	290499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_018533	AC	3	6	290562	290567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_018533	ATT	2	6	290592	290597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_018533	TGG	2	6	290603	290608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018533	T	7	7	290641	290647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018533	T	6	6	290650	290655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018533	ATTT	2	8	290673	290680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018533	GAG	2	6	294049	294054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018533	T	6	6	294787	294792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_018533	CTTT	2	8	294842	294849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_018533	A	6	6	294898	294903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_018533	T	7	7	294935	294941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018533	TCA	2	6	294979	294984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_018533	TTA	2	6	295025	295030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018533	GTA	2	6	295037	295042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018533	ATTG	2	8	295049	295056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018533	CAT	2	6	295165	295170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_018533	GAT	2	6	295182	295187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018533	T	7	7	295206	295212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018533	T	6	6	295231	295236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018533	AG	3	6	295263	295268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_018533	TTG	2	6	295277	295282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018533	GAT	2	6	295309	295314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_018533	TTC	2	6	295373	295378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1622	NC_018533	T	6	6	296414	296419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_018533	T	6	6	297701	297706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018533	TTG	2	6	297717	297722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018533	ATT	2	6	297734	297739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018533	TATAAT	2	12	298671	298682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018533	T	8	8	298700	298707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018533	AG	3	6	300749	300754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018533	ATT	2	6	300756	300761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_018533	T	6	6	300804	300809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018533	TC	3	6	300812	300817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_018533	T	8	8	300819	300826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018533	T	6	6	300941	300946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_018533	TAA	2	6	301003	301008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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