MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 10457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018533	GAG	2	6	181262	181267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018533	ATTT	2	8	181299	181306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018533	ATAA	2	8	181371	181378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018533	AAAT	2	8	181379	181386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018533	ATT	2	6	181409	181414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018533	T	7	7	181417	181423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018533	TAAAG	2	10	181462	181471	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018533	G	6	6	181499	181504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018533	ATT	2	6	181543	181548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018533	TAC	2	6	184411	184416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_018533	ATTT	2	8	184508	184515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018533	ATAA	2	8	184580	184587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018533	AAAT	2	8	184588	184595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018533	ATT	2	6	184618	184623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018533	T	7	7	184626	184632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018533	TAAAG	2	10	184671	184680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018533	G	7	7	184708	184714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018533	ATT	2	6	184752	184757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018533	ATT	2	6	188277	188282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018533	T	7	7	188281	188287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018533	AAG	2	6	188338	188343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018533	AG	3	6	188361	188366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018533	ACC	2	6	188560	188565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_018533	T	6	6	188618	188623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018533	GTT	2	6	188891	188896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018533	CAC	3	9	188949	188957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_018533	AGC	2	6	188965	188970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_018533	TCA	2	6	188982	188987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018533	AATAA	2	10	189114	189123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018533	T	6	6	189163	189168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018533	ATA	2	6	189269	189274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018533	TAA	2	6	189276	189281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018533	T	6	6	189387	189392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018533	ATC	2	6	189394	189399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_018533	AGA	2	6	189435	189440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018533	TGA	2	6	189444	189449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018533	ATA	2	6	189457	189462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018533	TAATT	2	10	189482	189491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018533	AGA	2	6	189522	189527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018533	T	7	7	189540	189546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018533	G	7	7	189551	189557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018533	A	6	6	189577	189582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018533	TACAA	2	10	189630	189639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_018533	AAT	2	6	189678	189683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018533	ACAG	2	8	189698	189705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_018533	A	8	8	189731	189738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018533	A	6	6	189842	189847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018533	T	7	7	189852	189858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018533	AAT	2	6	189915	189920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018533	GTC	2	6	189922	189927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018533	GTT	2	6	189966	189971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018533	CG	3	6	190033	190038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018533	AAG	2	6	190108	190113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018533	A	6	6	190127	190132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018533	T	6	6	190267	190272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_018533	GAT	2	6	190422	190427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018533	T	6	6	190457	190462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018533	AAT	2	6	190464	190469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018533	GAA	2	6	190589	190594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018533	ATGG	2	8	190596	190603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018533	ATGA	2	8	190611	190618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018533	A	7	7	190664	190670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018533	GA	4	8	190697	190704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018533	GA	3	6	190795	190800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018533	T	8	8	191638	191645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018533	T	6	6	191719	191724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018533	ATG	2	6	191729	191734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018533	AT	3	6	191752	191757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018533	GAA	2	6	191771	191776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018533	T	6	6	193989	193994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018533	TTC	2	6	195280	195285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_018533	T	6	6	195937	195942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018533	A	7	7	196024	196030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018533	ATC	2	6	196088	196093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_018533	TCT	2	6	196169	196174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_018533	CGAG	2	8	196218	196225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_018533	GGA	2	6	196242	196247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018533	ATT	2	6	196256	196261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018533	TAT	2	6	196273	196278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018533	A	6	6	196324	196329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018533	GCTC	2	8	196334	196341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_018533	TTC	2	6	196368	196373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_018533	AGG	2	6	196424	196429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_018533	TTTTA	2	10	196492	196501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018533	A	6	6	196522	196527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018533	TCA	2	6	196637	196642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018533	TGA	2	6	196675	196680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018533	ATT	2	6	196697	196702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018533	CTT	2	6	196797	196802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_018533	AAC	2	6	196807	196812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018533	TA	3	6	196899	196904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018533	TTA	2	6	196906	196911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_018533	TTC	2	6	196990	196995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_018533	GAA	2	6	197019	197024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018533	TGT	2	6	197036	197041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018533	T	6	6	200149	200154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018533	TAT	2	6	200169	200174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018533	TAAAAA	2	12	200802	200813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018533	ATT	2	6	200879	200884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018533	T	6	6	200904	200909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018533	TTTTG	2	10	200938	200947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018533	T	7	7	200956	200962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018533	CAC	2	6	200972	200977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_018533	ATA	2	6	200979	200984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018533	GA	3	6	200985	200990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018533	TA	3	6	201059	201064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018533	GTTT	2	8	201071	201078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018533	TAA	2	6	201079	201084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018533	TA	3	6	201091	201096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018533	AG	3	6	201121	201126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018533	TAC	2	6	201431	201436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_018533	ATG	2	6	202362	202367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018533	CAATAA	2	12	202373	202384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1118	NC_018533	T	7	7	204323	204329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018533	AGG	2	6	204343	204348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018533	T	7	7	204380	204386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018533	GGA	2	6	204402	204407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018533	AT	3	6	204450	204455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018533	A	6	6	204463	204468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018533	TA	3	6	204486	204491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018533	ATT	2	6	204509	204514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018533	CAT	2	6	204584	204589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_018533	TTG	2	6	204595	204600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018533	TAG	2	6	204626	204631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018533	ATT	2	6	204670	204675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018533	TAAT	2	8	204697	204704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018533	ATG	3	9	204707	204715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018533	A	6	6	204716	204721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018533	A	6	6	204727	204732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018533	CTTATA	2	12	204752	204763	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1135	NC_018533	GTG	2	6	204772	204777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018533	AT	3	6	204789	204794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_018533	CTT	2	6	204839	204844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_018533	AGAA	2	8	204947	204954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_018533	GAT	2	6	224641	224646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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