MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 10457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018533	TAC	2	6	95412	95417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_018533	TCA	2	6	95429	95434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018533	TC	4	8	95476	95483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_018533	TTTC	2	8	95536	95543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_018533	AGT	2	6	95591	95596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018533	TGGCA	2	10	95615	95624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
507	NC_018533	TAA	2	6	95630	95635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018533	ATG	2	6	95709	95714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018533	GCA	2	6	95781	95786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018533	AGA	2	6	95795	95800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018533	AAGC	2	8	95828	95835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_018533	TGG	2	6	95863	95868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018533	TTC	2	6	95893	95898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018533	CTT	2	6	95941	95946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018533	TTA	2	6	95970	95975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018533	TTCT	2	8	96039	96046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_018533	ACA	2	6	96065	96070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018533	CTT	2	6	96118	96123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_018533	GGA	2	6	96160	96165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018533	CTT	2	6	96173	96178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018533	T	7	7	96194	96200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018533	ATC	2	6	96209	96214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_018533	AC	3	6	96236	96241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_018533	ATT	2	6	96500	96505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018533	A	7	7	96986	96992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018533	GA	3	6	97051	97056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018533	ATT	2	6	98180	98185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018533	CATT	2	8	98613	98620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_018533	T	7	7	98653	98659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018533	T	6	6	102220	102225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018533	ATT	2	6	102231	102236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018533	T	6	6	102271	102276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018533	CTT	2	6	102297	102302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018533	CT	3	6	102332	102337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_018533	ATC	2	6	102343	102348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_018533	T	7	7	102351	102357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018533	A	6	6	102363	102368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018533	T	7	7	102397	102403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018533	AG	3	6	102476	102481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018533	TC	3	6	106031	106036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_018533	TGTT	2	8	106038	106045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018533	AGA	2	6	106052	106057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018533	TCC	2	6	106076	106081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_018533	GTAT	2	8	106104	106111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018533	TC	3	6	106112	106117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_018533	C	7	7	106117	106123	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
547	NC_018533	A	7	7	106126	106132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018533	TTAA	2	8	106142	106149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018533	T	7	7	106177	106183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018533	AAT	2	6	106231	106236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018533	CAT	2	6	106237	106242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018533	GAA	2	6	106269	106274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018533	A	6	6	106283	106288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018533	GGA	2	6	106315	106320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018533	T	6	6	106368	106373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018533	A	6	6	106400	106405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018533	TAT	2	6	106495	106500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018533	ACCG	2	8	106501	106508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_018533	TTA	2	6	106517	106522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018533	TTC	2	6	106546	106551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_018533	AAT	2	6	106574	106579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018533	GAAA	2	8	106612	106619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018533	AG	3	6	106620	106625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018533	TTA	2	6	106638	106643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018533	TGG	2	6	106669	106674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018533	T	6	6	106686	106691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018533	TGA	2	6	106693	106698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018533	CCT	2	6	106704	106709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_018533	ATTG	2	8	106724	106731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018533	ATTG	2	8	106745	106752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018533	T	7	7	106818	106824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018533	GTTA	2	8	106835	106842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018533	AAAG	2	8	106985	106992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018533	ATG	2	6	107045	107050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018533	TGAT	2	8	107127	107134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018533	TGA	2	6	107172	107177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018533	TTTC	2	8	108490	108497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_018533	ATT	2	6	108516	108521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018533	GGT	2	6	117205	117210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018533	GTT	2	6	117227	117232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018533	TAA	3	9	117246	117254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018533	A	7	7	117329	117335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018533	ATAC	2	8	119094	119101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_018533	GAA	2	6	119175	119180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018533	GAC	2	6	119209	119214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_018533	ATTAA	2	10	121219	121228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018533	ATT	2	6	121305	121310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018533	TTC	2	6	121794	121799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018533	TTC	2	6	121829	121834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_018533	GCATG	2	10	121904	121913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
591	NC_018533	CCA	2	6	121945	121950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_018533	AGC	2	6	122007	122012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018533	A	7	7	122044	122050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018533	AAG	2	6	122087	122092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018533	AG	3	6	122103	122108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018533	TTA	2	6	122112	122117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018533	A	6	6	122140	122145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018533	TAT	2	6	122147	122152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018533	CA	3	6	122179	122184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_018533	ATGA	2	8	122242	122249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018533	ATT	2	6	122257	122262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018533	T	6	6	122261	122266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018533	TTA	2	6	122278	122283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018533	TTA	2	6	122291	122296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018533	TTG	2	6	122305	122310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018533	GCA	2	6	122314	122319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018533	T	7	7	122361	122367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018533	ATT	2	6	122420	122425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018533	AAT	2	6	122435	122440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018533	CTT	2	6	122443	122448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_018533	GC	3	6	122504	122509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_018533	CAG	2	6	122622	122627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_018533	GAT	2	6	122676	122681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018533	ATT	2	6	122733	122738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018533	AT	3	6	122753	122758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018533	GTTT	2	8	122783	122790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018533	CTT	2	6	122833	122838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_018533	CAA	2	6	122854	122859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_018533	CAT	2	6	122875	122880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_018533	GATG	2	8	122955	122962	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018533	TAC	2	6	122966	122971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_018533	GATT	2	8	122980	122987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018533	GAT	2	6	122992	122997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018533	CAA	2	6	123071	123076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_018533	GGA	2	6	123107	123112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018533	CTT	2	6	123172	123177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_018533	TAATA	2	10	123183	123192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018533	CTTAA	2	10	123246	123255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
629	NC_018533	AAT	2	6	123271	123276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018533	TTTG	2	8	123290	123297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018533	GCTT	2	8	126056	126063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
632	NC_018533	T	6	6	126088	126093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018533	ATTT	2	8	126094	126101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018533	TTA	2	6	126147	126152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018533	AT	3	6	126174	126179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018533	A	7	7	128592	128598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018533	TCA	2	6	129095	129100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_018533	TA	3	6	129106	129111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018533	ATT	2	6	129188	129193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018533	T	7	7	129192	129198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_018533	ATT	2	6	129762	129767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018533	ATC	2	6	129880	129885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_018533	AGA	2	6	130896	130901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_018533	T	8	8	132154	132161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_018533	GA	3	6	133216	133221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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