MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis QB928 chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018520	TTTCCC	2	12	3136	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018520	ATAAAT	2	12	45538	45549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018520	AAGTAA	2	12	155006	155017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018520	CTGTTT	2	12	238559	238570	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018520	AGGAAA	2	12	249921	249932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018520	GTTTTT	2	12	283787	283798	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018520	AAATGA	2	12	308228	308239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018520	TTCATT	2	12	338235	338246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018520	TATTGA	2	12	340153	340164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018520	TTTTTA	2	12	369714	369725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018520	ATTTTT	2	12	376533	376544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018520	ATGATA	2	12	432286	432297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018520	TTTTTA	2	12	449574	449585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018520	TCGGCA	2	12	518043	518054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018520	GATGTG	2	12	524400	524411	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018520	GAAACA	2	12	524435	524446	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018520	ATTTTT	2	12	529070	529081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018520	TAGCTG	2	12	532969	532980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018520	TGTTTT	2	12	561084	561095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018520	ATAAAT	2	12	578148	578159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018520	CATTTT	2	12	638049	638060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018520	TTTTGA	2	12	676871	676882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018520	CTTTCT	2	12	686412	686423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018520	TCTCCT	2	12	708084	708095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018520	TATTCA	2	12	765921	765932	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018520	ACATAT	2	12	767423	767434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018520	TACTTT	2	12	833846	833857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018520	CAATGG	2	12	885278	885289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018520	ATTTAA	2	12	889422	889433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018520	GAACAA	2	12	923288	923299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018520	GTGTTT	2	12	932472	932483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018520	CTTTTT	2	12	933660	933671	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018520	GCGGAA	2	12	941664	941675	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018520	TAAAAA	2	12	969163	969174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018520	CTTTTT	2	12	988052	988063	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018520	AATGAA	2	12	998317	998328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018520	CAAAAG	2	12	1026816	1026827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018520	ACAGAG	2	12	1028363	1028374	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018520	TCTTTT	2	12	1053230	1053241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018520	GAAAAA	2	12	1073346	1073357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018520	TTTCTT	2	12	1074288	1074299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018520	GAATTT	2	12	1082543	1082554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018520	CGGACC	2	12	1132660	1132671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018520	TTTAAG	2	12	1193662	1193673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018520	GGTTAA	2	12	1208459	1208470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018520	CTGAAG	2	12	1215355	1215366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018520	GAAAAA	2	12	1228846	1228857	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018520	AAAAAG	2	12	1232203	1232214	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018520	TTTGCA	2	12	1237856	1237867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018520	TATACT	2	12	1250070	1250081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018520	GTTAAC	2	12	1279903	1279914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018520	AAATCA	2	12	1314577	1314588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018520	AATTCA	2	12	1365445	1365456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018520	ATGAAA	2	12	1406537	1406548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018520	ATTTGA	2	12	1423232	1423243	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018520	TACATA	2	12	1423542	1423553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018520	ATAATT	2	12	1430719	1430730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018520	AAAGGA	2	12	1441248	1441259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018520	ATCATT	2	12	1463039	1463050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018520	ATCATT	2	12	1466473	1466484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018520	TTTGCT	2	12	1474961	1474972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018520	CTTTTT	2	12	1555512	1555523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018520	AATATG	2	12	1702317	1702328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018520	TCCTTC	2	12	1721077	1721088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018520	AACATG	2	12	1763167	1763178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018520	AAAGCA	2	12	1820556	1820567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018520	CGGAAC	2	12	1822553	1822564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018520	TTATGA	2	12	1840811	1840822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018520	CATCAC	2	12	1875659	1875670	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018520	TGAAAT	2	12	1896731	1896742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018520	TTTTAA	2	12	1912621	1912632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018520	AATTTC	2	12	1921973	1921984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018520	CAGGAG	2	12	1972536	1972547	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018520	TGCGGC	2	12	1974018	1974029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018520	AAGAGA	2	12	1982100	1982111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018520	TGCTTC	2	12	1988481	1988492	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018520	ATCATT	2	12	2013155	2013166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018520	GAAAAA	2	12	2035239	2035250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018520	GTATAA	2	12	2036547	2036558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018520	TAAAAT	2	12	2038110	2038121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018520	ATTTTC	2	12	2041077	2041088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018520	TAATGC	2	12	2049397	2049408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018520	TTGCCG	2	12	2140661	2140672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018520	AAACGT	2	12	2141586	2141597	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018520	TTGTTT	2	12	2143078	2143089	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018520	TTTAGA	2	12	2147033	2147044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018520	ATTTAA	2	12	2166444	2166455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018520	TTTATT	2	12	2170301	2170312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018520	TAATTT	2	12	2182260	2182271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018520	TGGTCT	2	12	2183511	2183522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018520	ATTTTC	2	12	2201437	2201448	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018520	ACAAAT	2	12	2201781	2201792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018520	TTTTTA	2	12	2219804	2219815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018520	TAATGA	2	12	2253106	2253117	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018520	GAAAAT	2	12	2259301	2259312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018520	TTATGT	2	12	2285930	2285941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018520	TTATTT	2	12	2287912	2287923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018520	GAAAAC	2	12	2360800	2360811	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018520	ATCTTC	2	12	2412472	2412483	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018520	TTTCGA	2	12	2424540	2424551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018520	CTTTTC	2	12	2505217	2505228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018520	TTCTAA	2	12	2579431	2579442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018520	TTTTTC	2	12	2595566	2595577	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018520	TCGCTT	2	12	2597460	2597471	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018520	ACTTTT	2	12	2597981	2597992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018520	TGACTT	2	12	2605497	2605508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018520	CCGAAA	2	12	2609542	2609553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018520	TCCTGC	2	12	2609683	2609694	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018520	GGATAT	2	12	2610305	2610316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018520	TTGCAG	2	12	2618424	2618435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018520	CATCCC	2	12	2632267	2632278	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018520	ACAGAC	2	12	2632391	2632402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018520	AAAGAA	2	12	2638388	2638399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018520	TTACAT	2	12	2645680	2645691	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018520	GATTTT	2	12	2746151	2746162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018520	GTTCAC	2	12	2749415	2749426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018520	CAAAAA	2	12	2789151	2789162	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018520	GCCGGA	2	12	2796734	2796745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018520	CCCTCT	2	12	2839541	2839552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018520	CTCTTT	2	12	2887098	2887109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018520	TTTAAG	2	12	2913888	2913899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018520	TATTCA	2	12	2914533	2914544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018520	CTTATC	2	12	2976637	2976648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018520	CATTAT	2	12	2986078	2986089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018520	TAAAAA	2	12	2993005	2993016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018520	AAAAGA	2	12	3019796	3019807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018520	CTTATA	2	12	3103166	3103177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018520	ATTATC	2	12	3223826	3223837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018520	CGCTGA	2	12	3244256	3244267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018520	GAAAAA	2	12	3292366	3292377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018520	AAAAAC	2	12	3372532	3372543	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018520	CAAAAA	2	12	3422721	3422732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018520	GAAGTT	2	12	3424181	3424192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018520	CTCAGT	2	12	3441213	3441224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.