MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	TCAA	2	8	2039	2046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018516	GCAA	2	8	2219	2226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018516	TTAT	2	8	2949	2956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018516	TACA	2	8	3980	3987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018516	GATA	2	8	7713	7720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018516	AATA	2	8	8527	8534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018516	ATTT	2	8	11887	11894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018516	TTAC	2	8	13783	13790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018516	ATTT	2	8	15546	15553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018516	ACTT	2	8	20857	20864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018516	TACC	2	8	21715	21722	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018516	TCTA	2	8	21749	21756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018516	GGTT	2	8	23159	23166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018516	GTTC	2	8	30780	30787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018516	TCTT	2	8	38562	38569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018516	GTTT	2	8	38940	38947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018516	AAGA	2	8	40475	40482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018516	GAAA	2	8	40553	40560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018516	CAAG	2	8	40716	40723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018516	TAGT	2	8	41117	41124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018516	CTAG	2	8	41215	41222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018516	TAAA	2	8	41864	41871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018516	GAGT	2	8	43241	43248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018516	TTTC	2	8	43376	43383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018516	AGGT	2	8	43474	43481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018516	GTAA	2	8	43501	43508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018516	TGTA	2	8	43690	43697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018516	TTCA	2	8	43877	43884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018516	CATA	2	8	44055	44062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018516	CATA	2	8	44182	44189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018516	ACTT	2	8	45398	45405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018516	ATTT	2	8	45489	45496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018516	ACTT	2	8	48807	48814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018516	TAGT	2	8	48819	48826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018516	CTTT	2	8	50089	50096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018516	TATG	2	8	51543	51550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018516	AGTA	2	8	52066	52073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018516	CTAC	2	8	53861	53868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018516	TTCT	2	8	54719	54726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018516	TGAG	2	8	62194	62201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018516	TACC	2	8	62277	62284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018516	TGTA	2	8	68492	68499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018516	GTTT	2	8	73315	73322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018516	GTTA	2	8	74708	74715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018516	TTTA	2	8	74736	74743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018516	TTGT	2	8	80346	80353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018516	ACAG	2	8	86250	86257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018516	TTTC	2	8	86417	86424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018516	TTTC	2	8	90388	90395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018516	TTAT	2	8	91573	91580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018516	CCCT	2	8	111635	111642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018516	GTTA	2	8	111765	111772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018516	ATTT	2	8	111899	111906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018516	TTTA	2	8	115234	115241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018516	TAGA	2	8	115303	115310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018516	TCTT	2	8	119634	119641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018516	TACT	2	8	120019	120026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018516	TTTA	2	8	120642	120649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018516	TAAA	2	8	122063	122070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018516	CTTT	2	8	124121	124128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018516	ACTT	2	8	124131	124138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018516	TATT	2	8	124401	124408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018516	TTTA	2	8	124443	124450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018516	GTTT	2	8	130138	130145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018516	TAAC	2	8	133747	133754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018516	ATTT	2	8	135886	135893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018516	AAAG	2	8	137263	137270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018516	AGTT	2	8	138907	138914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018516	TAAA	2	8	138929	138936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018516	AGAA	2	8	142300	142307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018516	ACAG	2	8	147237	147244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018516	TACC	2	8	147394	147401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018516	TTTC	2	8	147421	147428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018516	AAAC	2	8	147596	147603	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018516	TTAA	2	8	148150	148157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018516	AAAG	2	8	148286	148293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018516	TAAC	2	8	150289	150296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018516	TGAA	2	8	150309	150316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018516	GTTT	2	8	154413	154420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018516	TTCC	2	8	159958	159965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018516	CTTA	2	8	161750	161757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018516	CTTT	2	8	163533	163540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018516	TACC	2	8	165515	165522	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018516	CTTT	2	8	165962	165969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018516	TTTC	2	8	166022	166029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018516	TTTG	2	8	166165	166172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018516	TACT	2	8	174505	174512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018516	AAAT	2	8	180818	180825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018516	ATAA	2	8	180980	180987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018516	TATC	2	8	182586	182593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018516	TGTT	2	8	183333	183340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018516	TACC	2	8	185713	185720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018516	AAAC	2	8	185736	185743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018516	TTAT	2	8	185752	185759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018516	AAAC	2	8	188265	188272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018516	AGAA	2	8	189863	189870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018516	TACA	2	8	191039	191046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018516	TATT	2	8	191561	191568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018516	ATTT	2	8	191606	191613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018516	TAAA	2	8	191703	191710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018516	AAGG	2	8	191766	191773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018516	CCTT	2	8	191785	191792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018516	TTTG	2	8	191889	191896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018516	TCTT	2	8	192643	192650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018516	TGTA	2	8	192766	192773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018516	CCAA	2	8	192799	192806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018516	AAAC	2	8	193931	193938	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018516	GTTT	2	8	193959	193966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018516	TCTG	2	8	194503	194510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018516	TACA	2	8	198560	198567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018516	TTTG	2	8	199687	199694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018516	TCTT	2	8	206684	206691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018516	TAAA	2	8	206693	206700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018516	CATT	2	8	206921	206928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018516	TTAC	2	8	208000	208007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018516	AGTT	2	8	208074	208081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018516	TCCT	2	8	210888	210895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018516	TATT	2	8	214614	214621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018516	CTGA	2	8	216015	216022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018516	TTAC	2	8	223796	223803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018516	ATGA	3	12	225081	225092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018516	TTGA	2	8	225099	225106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018516	ACTG	2	8	227272	227279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018516	ACAT	2	8	229959	229966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018516	TACC	2	8	230047	230054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018516	GATA	2	8	230242	230249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018516	AGTT	2	8	230484	230491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018516	GATA	2	8	231314	231321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018516	TCAT	2	8	232591	232598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018516	TGTT	2	8	232693	232700	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018516	ATTT	2	8	232729	232736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018516	TTTA	2	8	232745	232752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018516	TTAT	2	8	236562	236569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018516	TTAT	2	8	236572	236579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018516	CCAA	2	8	236958	236965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018516	CTTT	2	8	240584	240591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018516	TATT	2	8	240603	240610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018516	AAAG	2	8	241614	241621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018516	AAAG	2	8	242905	242912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018516	TAAA	2	8	243678	243685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018516	TACC	2	8	243697	243704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018516	ACTT	2	8	246785	246792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018516	AAAG	2	8	246959	246966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018516	TACC	2	8	252151	252158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018516	TTAT	2	8	254209	254216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018516	TATT	2	8	254377	254384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018516	TATT	2	8	257755	257762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018516	TTAT	2	8	257771	257778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018516	CCTA	2	8	257840	257847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018516	TATC	2	8	260654	260661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018516	TGTA	2	8	260712	260719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018516	TCGT	2	8	260761	260768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_018516	TAAA	2	8	260800	260807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018516	TTTA	2	8	261172	261179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018516	ACTT	2	8	265613	265620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018516	TATT	2	8	266050	266057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018516	CTTT	2	8	268733	268740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_018516	AAAC	2	8	279836	279843	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_018516	TCCT	2	8	282505	282512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_018516	TATC	2	8	284825	284832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_018516	ACAG	2	8	284958	284965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_018516	CTAT	2	8	285029	285036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_018516	CAAT	2	8	293171	293178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_018516	TATC	2	8	293382	293389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_018516	CTAT	2	8	293506	293513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_018516	AAAC	2	8	294925	294932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_018516	ATCC	2	8	296333	296340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_018516	TCTT	2	8	299777	299784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_018516	ACCT	2	8	300166	300173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_018516	TTAG	2	8	315779	315786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018516	GGTT	2	8	317416	317423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018516	GGTT	2	8	317519	317526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018516	TAAA	2	8	320975	320982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018516	AAAG	2	8	321399	321406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018516	TACC	2	8	324023	324030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_018516	ATTT	2	8	325548	325555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018516	ATTT	2	8	325839	325846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018516	TTTC	2	8	330091	330098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_018516	TTTC	2	8	330162	330169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_018516	TTCT	2	8	330701	330708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_018516	CAAA	2	8	330820	330827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_018516	TTTC	2	8	333635	333642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_018516	TGTT	2	8	335992	335999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018516	CTAA	2	8	336125	336132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_018516	CTAC	2	8	336192	336199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_018516	TTAT	2	8	336433	336440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018516	TTAT	2	8	336538	336545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018516	GTTC	2	8	336906	336913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_018516	ACCA	2	8	337769	337776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_018516	ACTT	2	8	338381	338388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_018516	AAAG	2	8	339011	339018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018516	AAAG	2	8	341423	341430	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018516	TTTG	2	8	341874	341881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018516	TATG	2	8	342295	342302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018516	GTTT	2	8	345499	345506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018516	TCTA	2	8	346322	346329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
197	NC_018516	TTAC	2	8	347533	347540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.