MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p05

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018511	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018511	A	7	7	60	66	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018511	TAAAA	2	10	67	76	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018511	A	6	6	212	217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018511	T	6	6	258	263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018511	TA	4	8	334	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018511	GAA	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018511	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018511	A	8	8	395	402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018511	AAT	3	9	409	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018511	ATAA	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018511	T	7	7	1577	1583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018511	AATT	2	8	1596	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018511	ATAC	2	8	1610	1617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018511	T	6	6	1675	1680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018511	AGA	3	9	1711	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018511	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018511	GAA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018511	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018511	ATA	2	6	1947	1952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018511	TTG	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018511	CTTTA	2	10	2029	2038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018511	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018511	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018511	A	6	6	2563	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018511	T	7	7	2596	2602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018511	T	7	7	2657	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018511	TA	4	8	3034	3041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018511	GAA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018511	AAT	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018511	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018511	A	8	8	3127	3134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018511	A	7	7	3144	3150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018511	A	8	8	3164	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018511	TC	3	6	3845	3850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018511	GGAA	2	8	3858	3865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018511	TA	3	6	3888	3893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018511	AT	3	6	3898	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018511	TTA	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018511	TA	3	6	3982	3987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018511	TGT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018511	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018511	CCA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018511	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018511	ATG	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018511	T	6	6	5907	5912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018511	T	6	6	5939	5944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018511	AT	3	6	5949	5954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018511	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018511	TAT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018511	ATTTT	2	10	6437	6446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018511	T	6	6	6443	6448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018511	TGA	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018511	TTTG	2	8	6588	6595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018511	TCA	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018511	GTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018511	ATG	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018511	TAT	2	6	7211	7216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018511	TTA	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.