MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	TTG	2	6	37	42	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018509	CAG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018509	ACC	2	6	227	232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018509	CTT	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018509	ATT	2	6	497	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018509	CTC	2	6	693	698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018509	TCC	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018509	TCC	2	6	6735	6740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018509	TCC	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018509	CAT	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018509	ACT	2	6	8255	8260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018509	CTC	2	6	8939	8944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018509	TAT	2	6	8948	8953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018509	CAC	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018509	CAG	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018509	GTA	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018509	CAA	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018509	CTG	2	6	9174	9179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018509	ACC	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018509	TAC	2	6	9288	9293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018509	ATT	2	6	9308	9313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018509	CCA	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018509	TGC	2	6	9607	9612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018509	ACC	2	6	9640	9645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018509	CTG	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018509	CTT	2	6	9683	9688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018509	GTT	2	6	9760	9765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018509	CCA	2	6	9794	9799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018509	ATT	2	6	9857	9862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018509	ACC	2	6	9898	9903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018509	ACA	2	6	10052	10057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018509	TAC	2	6	10092	10097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018509	TTG	2	6	10164	10169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018509	TAG	2	6	10277	10282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018509	AGA	2	6	10309	10314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018509	GCA	2	6	10415	10420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018509	TAA	2	6	10440	10445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018509	GTA	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018509	AGC	3	9	10588	10596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018509	TGA	2	6	10672	10677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018509	TGC	2	6	10759	10764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018509	TGG	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018509	TAG	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018509	GAA	2	6	10904	10909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018509	CAT	2	6	11041	11046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018509	CAT	2	6	11115	11120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018509	CTT	2	6	11177	11182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018509	TAA	2	6	11267	11272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018509	ACT	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018509	ACC	2	6	11311	11316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018509	TGT	2	6	11380	11385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018509	ACT	2	6	11386	11391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018509	CCA	2	6	11399	11404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018509	TGC	2	6	11446	11451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018509	AGC	2	6	11521	11526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018509	AGT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018509	ACC	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018509	AAT	2	6	11580	11585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018509	CTC	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018509	CTT	2	6	18038	18043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018509	ACT	2	6	18076	18081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018509	CAC	2	6	28924	28929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018509	TTA	2	6	28969	28974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018509	ACT	2	6	29014	29019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018509	CAC	2	6	32327	32332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018509	TCC	2	6	39166	39171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018509	TCC	2	6	43130	43135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018509	GTA	2	6	50590	50595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018509	TAA	2	6	57916	57921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018509	CGC	2	6	57950	57955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018509	CAC	2	6	64456	64461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018509	TAA	2	6	65054	65059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018509	AGG	2	6	65064	65069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018509	ATA	2	6	65072	65077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018509	CCT	2	6	65080	65085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018509	TCC	2	6	65536	65541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018509	GTT	2	6	66928	66933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018509	CCT	2	6	67548	67553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018509	TCA	2	6	67596	67601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018509	TGT	2	6	69346	69351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018509	CGA	2	6	69362	69367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018509	AAT	2	6	74078	74083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018509	AAG	2	6	74121	74126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018509	TCC	2	6	75289	75294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018509	CCT	2	6	76745	76750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018509	TCC	2	6	81650	81655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018509	GAC	2	6	81669	81674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018509	ACC	2	6	86954	86959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018509	CCT	2	6	87823	87828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018509	TCC	2	6	88134	88139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018509	CCT	2	6	88526	88531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018509	TCA	2	6	88594	88599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018509	AAG	2	6	88636	88641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018509	GTC	2	6	88645	88650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018509	CTT	2	6	88682	88687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018509	TTG	2	6	88698	88703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018509	GGT	2	6	88745	88750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018509	TGG	2	6	88767	88772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018509	CTA	2	6	88791	88796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018509	ACT	2	6	88869	88874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018509	ACA	2	6	88881	88886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018509	AAC	2	6	88932	88937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018509	ACA	2	6	88954	88959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018509	ATT	2	6	93964	93969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018509	TTC	2	6	95465	95470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018509	GAA	2	6	95502	95507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018509	TAG	2	6	95642	95647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018509	TAA	2	6	95790	95795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018509	TAC	2	6	95835	95840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018509	CTT	2	6	97297	97302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018509	ACA	2	6	97325	97330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018509	AAC	2	6	97337	97342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018509	CTT	2	6	97762	97767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018509	ACG	2	6	99357	99362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018509	TCA	2	6	99434	99439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018509	GAT	2	6	99883	99888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018509	GAA	2	6	100021	100026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018509	GCG	2	6	100030	100035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018509	GGA	2	6	100145	100150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018509	GGA	2	6	100413	100418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018509	ACC	2	6	101026	101031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018509	TGG	3	9	101091	101099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018509	GTG	2	6	101170	101175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018509	GTA	2	6	101428	101433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018509	AAC	2	6	101723	101728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018509	GCT	2	6	101839	101844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018509	TTA	2	6	101858	101863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018509	CAT	2	6	101917	101922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018509	ATG	2	6	101953	101958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018509	AGG	2	6	101962	101967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018509	AGG	2	6	102206	102211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018509	TTG	2	6	103071	103076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018509	TGT	2	6	103077	103082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018509	CTT	2	6	103118	103123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018509	AGG	2	6	103155	103160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018509	GAA	2	6	103689	103694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018509	AGG	2	6	103822	103827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018509	GAG	2	6	104270	104275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018509	TTA	2	6	104747	104752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018509	GTT	2	6	104800	104805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_018509	ATC	2	6	232191	232196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_018509	AAG	2	6	232406	232411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NC_018509	ACA	2	6	232429	232434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_018509	GCC	2	6	232483	232488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_018509	TAA	2	6	232568	232573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_018509	TCC	2	6	232610	232615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_018509	TAA	2	6	232645	232650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_018509	ACA	2	6	232665	232670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_018509	TTA	2	6	233598	233603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_018509	CAA	2	6	233723	233728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_018509	TAT	2	6	233996	234001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_018509	TCA	2	6	235368	235373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_018509	TAA	2	6	235384	235389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.