MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	ATA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018502	AGA	2	6	56	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018502	TCT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018502	TAC	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018502	AGA	2	6	136	141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018502	TCT	3	9	171	179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018502	ACT	3	9	215	223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018502	TAA	2	6	250	255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018502	CCT	2	6	286	291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018502	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018502	ATC	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018502	AGT	2	6	591	596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018502	TTC	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018502	ACC	2	6	974	979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018502	AGA	2	6	1029	1034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018502	TCC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018502	AGC	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018502	GTG	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018502	ACT	2	6	1405	1410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018502	TCT	2	6	1569	1574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018502	TTG	2	6	1628	1633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018502	TTA	2	6	1635	1640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018502	ACA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018502	TTC	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018502	GGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018502	TTG	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018502	CCT	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018502	ATG	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018502	TTC	2	6	5838	5843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018502	ATC	2	6	6816	6821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018502	ATC	2	6	12486	12491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018502	TTG	2	6	12621	12626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018502	TTG	2	6	12636	12641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018502	TAT	2	6	12660	12665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018502	CAC	2	6	12734	12739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018502	GGA	2	6	12786	12791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018502	ATC	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018502	TGC	2	6	12969	12974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018502	TTA	2	6	13262	13267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018502	CTT	2	6	13323	13328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018502	TGC	2	6	13367	13372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018502	GAA	2	6	13504	13509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018502	GAT	2	6	13530	13535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018502	ATG	2	6	13585	13590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018502	TAA	2	6	13781	13786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018502	ACT	2	6	13863	13868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018502	ATA	2	6	13897	13902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018502	AGC	2	6	13953	13958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018502	CTG	3	9	14009	14017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018502	GCA	2	6	14110	14115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018502	TTG	2	6	14145	14150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018502	GAT	2	6	14151	14156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018502	CTT	2	6	14198	14203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018502	CTT	3	9	14279	14287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018502	CTT	2	6	14324	14329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018502	TCA	2	6	14357	14362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018502	CTT	2	6	14376	14381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018502	CTT	2	6	14408	14413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018502	CTG	2	6	14469	14474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018502	ACA	2	6	14605	14610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018502	CAG	2	6	14702	14707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018502	ATC	2	6	14727	14732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018502	ACC	2	6	14745	14750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018502	TAA	2	6	14753	14758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018502	CTT	2	6	14780	14785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018502	GCA	2	6	14803	14808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018502	TTG	2	6	14814	14819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018502	GAT	2	6	14859	14864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018502	AGC	2	6	14931	14936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018502	AGC	2	6	14949	14954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018502	AGC	2	6	15066	15071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018502	GTT	2	6	15104	15109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018502	CTT	2	6	15360	15365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018502	GCT	2	6	15385	15390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018502	AGG	2	6	15405	15410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018502	CAG	2	6	15511	15516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018502	AGC	2	6	15542	15547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018502	AGC	2	6	15800	15805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018502	CCA	2	6	15807	15812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018502	AGA	2	6	15815	15820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018502	GCA	2	6	15837	15842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018502	CTT	2	6	15891	15896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018502	AAG	2	6	15936	15941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018502	AAT	2	6	15960	15965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018502	TCC	2	6	16717	16722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018502	CTT	2	6	18809	18814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018502	CTT	2	6	18830	18835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018502	TCC	2	6	19812	19817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018502	TCC	2	6	20508	20513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018502	ACC	3	9	25243	25251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018502	GTT	2	6	25314	25319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018502	ATA	2	6	25320	25325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018502	TCC	3	9	25957	25965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018502	CAC	2	6	26405	26410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018502	TTG	2	6	26703	26708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018502	ATT	2	6	26751	26756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018502	CTC	2	6	27298	27303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018502	AAC	2	6	27367	27372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018502	CAG	2	6	27395	27400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018502	TCC	2	6	27707	27712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018502	GAA	2	6	28026	28031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018502	TCT	2	6	28038	28043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018502	TAC	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018502	GTA	2	6	28279	28284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018502	GTA	2	6	28326	28331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018502	ATC	2	6	28360	28365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018502	CAG	2	6	28378	28383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018502	AAT	2	6	28482	28487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018502	ATT	2	6	28884	28889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018502	TTC	2	6	28926	28931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018502	ATC	2	6	28938	28943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018502	TAT	2	6	28985	28990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018502	TAA	2	6	29063	29068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018502	TTG	2	6	29536	29541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018502	CAC	2	6	29573	29578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018502	TCC	2	6	30681	30686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018502	GCT	2	6	30784	30789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018502	TAA	2	6	31904	31909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018502	TCA	2	6	31968	31973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018502	TTC	2	6	33239	33244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018502	CTT	2	6	36465	36470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018502	TCC	2	6	36844	36849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018502	AAC	2	6	36862	36867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018502	TTC	2	6	36941	36946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018502	CAA	2	6	36967	36972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018502	AGG	2	6	37175	37180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018502	ATT	2	6	39024	39029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018502	ATT	2	6	39396	39401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018502	TTA	2	6	39407	39412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018502	TAA	2	6	39445	39450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018502	TAA	2	6	39950	39955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018502	TTC	2	6	39956	39961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018502	CTT	2	6	39970	39975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018502	TCC	2	6	40045	40050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018502	ATA	2	6	40060	40065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018502	AAT	2	6	40137	40142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018502	AGA	2	6	40158	40163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018502	ATT	2	6	40168	40173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018502	TTA	2	6	41560	41565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018502	ACT	2	6	41678	41683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018502	ACA	2	6	41802	41807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018502	AAC	2	6	41934	41939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018502	TAA	2	6	41958	41963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018502	TTA	2	6	41970	41975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018502	TAG	2	6	41976	41981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018502	TTC	2	6	42463	42468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018502	TTG	2	6	42502	42507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018502	ATC	2	6	42661	42666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018502	ATT	2	6	44021	44026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018502	TTA	2	6	44169	44174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018502	AGG	2	6	44176	44181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018502	TGG	2	6	44200	44205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018502	GCG	2	6	44211	44216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018502	GGA	2	6	44234	44239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018502	TTA	2	6	44246	44251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018502	TAT	2	6	44265	44270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018502	ATT	2	6	44276	44281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018502	GCT	2	6	44289	44294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018502	TTA	2	6	44358	44363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018502	AGT	2	6	44364	44369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018502	ATA	2	6	44474	44479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018502	GGT	2	6	44532	44537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018502	CCT	2	6	44726	44731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_018502	GAA	2	6	44745	44750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018502	GGA	2	6	44989	44994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018502	ATC	2	6	45041	45046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.