MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018492	GTTTA	2	10	492	501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018492	TTATG	2	10	529	538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018492	GACCT	2	10	1634	1643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018492	AGACA	2	10	1912	1921	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018492	CTTTC	2	10	3370	3379	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018492	TTTAA	2	10	4820	4829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018492	CGTAC	2	10	5004	5013	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018492	ATTAA	2	10	6477	6486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018492	ATTAT	2	10	11649	11658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018492	TTAGA	2	10	11659	11668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018492	TTTAA	2	10	11751	11760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018492	AGTTA	2	10	12134	12143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018492	ATTTT	2	10	14797	14806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018492	TTAAA	2	10	18184	18193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018492	ATTAG	2	10	19077	19086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018492	TTATT	2	10	19100	19109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018492	TAAAT	2	10	21012	21021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018492	TCTTG	2	10	21985	21994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018492	ATTCC	2	10	24471	24480	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018492	CCACT	2	10	35231	35240	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_018492	TTTTA	2	10	35518	35527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018492	TTTAG	2	10	37304	37313	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018492	CATTT	2	10	38679	38688	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018492	CATTG	2	10	51870	51879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018492	ATGAA	2	10	57752	57761	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018492	GGAAG	2	10	62021	62030	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018492	AAATA	2	10	67682	67691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018492	ATTTA	2	10	69526	69535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018492	GAATA	2	10	69973	69982	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018492	AGTTT	2	10	74802	74811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018492	TAATG	2	10	78578	78587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018492	TCTTT	2	10	82667	82676	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018492	AAATC	2	10	85242	85251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018492	ATTAA	2	10	85806	85815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018492	ATTTC	2	10	88990	88999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018492	AATAA	2	10	104796	104805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018492	CACAA	2	10	105644	105653	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018492	CCATT	2	10	110293	110302	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018492	CTTTC	2	10	118217	118226	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018492	ATTTT	2	10	130036	130045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018492	AATCA	2	10	136858	136867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018492	TTAAA	2	10	140825	140834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018492	AAAAT	2	10	140882	140891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018492	AGTAG	2	10	159394	159403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018492	TATCA	2	10	173653	173662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018492	ATTTT	2	10	174054	174063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018492	TATAA	2	10	175839	175848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018492	ATCAT	2	10	175957	175966	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018492	TCTTT	2	10	176576	176585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018492	GGTGA	2	10	176730	176739	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018492	AAAGA	2	10	177165	177174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018492	ATAGG	2	10	177586	177595	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018492	TATGA	2	10	181897	181906	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018492	AAAAT	2	10	184419	184428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018492	TTATT	2	10	184453	184462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018492	TGAAG	2	10	185044	185053	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018492	AATTT	2	10	194426	194435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018492	TCAAA	2	10	195647	195656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018492	TAAAA	2	10	196169	196178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018492	TTTCC	2	10	198999	199008	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018492	ACTTA	2	10	199959	199968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018492	AAAAT	2	10	217774	217783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018492	TTGTT	2	10	218401	218410	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.