MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 1013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017999	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017999	AGGA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017999	TGGC	2	8	12366	12373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017999	GCCG	2	8	15163	15170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017999	CGGC	2	8	16525	16532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017999	TGGC	2	8	16725	16732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017999	GTTT	2	8	16826	16833	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017999	GTCA	2	8	17184	17191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017999	GCCA	2	8	17545	17552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017999	CTTA	2	8	18222	18229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017999	GCTG	2	8	29222	29229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017999	ATCT	2	8	29393	29400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017999	TAGA	2	8	29511	29518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017999	GAAA	2	8	30921	30928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017999	GAAA	2	8	31557	31564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017999	CATG	2	8	34606	34613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017999	CTGC	2	8	34614	34621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017999	TTCC	2	8	35128	35135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017999	GTCA	2	8	35467	35474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017999	CCCG	2	8	36664	36671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017999	GCCT	2	8	38069	38076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017999	GCCG	2	8	38201	38208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017999	CTCA	2	8	46080	46087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017999	TGAT	2	8	46286	46293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017999	GCTG	2	8	54496	54503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017999	ATCT	2	8	54574	54581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017999	TAGA	2	8	54692	54699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017999	TGCT	2	8	56007	56014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017999	CGGC	2	8	57295	57302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017999	GAGG	2	8	58021	58028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017999	CAGA	2	8	62124	62131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017999	ATTG	2	8	63164	63171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017999	TCTG	2	8	63360	63367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017999	CAGA	2	8	68109	68116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017999	CGGC	2	8	68764	68771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017999	CGCC	2	8	69326	69333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017999	CTAT	2	8	69877	69884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017999	TGAT	2	8	83541	83548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017999	ACCG	2	8	84935	84942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017999	GCCT	2	8	85718	85725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017999	GTCG	2	8	85757	85764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017999	AAGT	2	8	85871	85878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017999	GAAT	2	8	88796	88803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017999	GCGT	2	8	89026	89033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017999	GCGG	2	8	90036	90043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017999	GCCT	2	8	90060	90067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017999	CGGC	2	8	91258	91265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017999	TGCG	2	8	95028	95035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017999	GCTG	2	8	98296	98303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017999	CGGC	2	8	110947	110954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017999	GCCG	2	8	118958	118965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017999	GCCG	2	8	118986	118993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017999	CCCG	2	8	119009	119016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017999	CGCC	2	8	121305	121312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017999	CATG	2	8	121380	121387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017999	TCTA	2	8	124480	124487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017999	AGAT	2	8	124598	124605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017999	CTGT	2	8	128931	128938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017999	TGGC	2	8	134015	134022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017999	TACC	2	8	137010	137017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017999	CGGA	2	8	137669	137676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017999	GGCG	2	8	137775	137782	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017999	GCCG	2	8	138063	138070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017999	CGGG	2	8	138118	138125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017999	CCAC	2	8	138162	138169	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017999	TGGT	2	8	138365	138372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017999	GCCG	2	8	138544	138551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017999	GCAA	2	8	138787	138794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017999	GACG	2	8	138827	138834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017999	CGCC	2	8	139660	139667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_017999	GGTA	2	8	141216	141223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017999	ATTC	2	8	141224	141231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017999	CGAA	2	8	143485	143492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017999	GACG	2	8	143620	143627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017999	GATG	2	8	148926	148933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017999	GCTC	2	8	151116	151123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017999	GTGG	2	8	153551	153558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017999	CAAT	2	8	154660	154667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017999	TAAA	2	8	154792	154799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017999	CCGG	2	8	156354	156361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017999	GTCG	2	8	157477	157484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017999	CCGG	2	8	163901	163908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017999	TGTC	2	8	164014	164021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017999	GGTG	2	8	164525	164532	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017999	AGCG	2	8	166056	166063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017999	GGAG	2	8	167179	167186	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017999	GTCG	2	8	167193	167200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017999	GACT	2	8	167203	167210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017999	ATCT	2	8	176451	176458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017999	AGAT	2	8	176570	176577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017999	GGGT	2	8	176806	176813	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017999	GTTG	2	8	177469	177476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017999	TGGA	2	8	183071	183078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017999	GGCG	2	8	185499	185506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017999	GCGG	2	8	186680	186687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017999	CCGC	2	8	186738	186745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017999	GTTC	2	8	187006	187013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017999	GGAA	2	8	192688	192695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017999	AGAA	2	8	194596	194603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017999	CGGC	2	8	195167	195174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017999	GTCC	2	8	195454	195461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017999	CATC	2	8	197152	197159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017999	CGTG	2	8	198558	198565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017999	CGAT	2	8	200333	200340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017999	CGGT	2	8	201811	201818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017999	GGCC	2	8	201831	201838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017999	GCGT	2	8	204460	204467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017999	CAGC	2	8	204485	204492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017999	GTAA	2	8	204547	204554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017999	CGTG	2	8	208588	208595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017999	CTGG	2	8	209002	209009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017999	GGCC	2	8	209076	209083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017999	CTGA	2	8	215266	215273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017999	AAGC	2	8	217749	217756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017999	GTTC	2	8	220065	220072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017999	CAAT	2	8	220176	220183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017999	GCCG	3	12	222603	222614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017999	AGAC	2	8	222634	222641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017999	GCCG	2	8	223340	223347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017999	GGAG	2	8	225632	225639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017999	CGGC	2	8	225743	225750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017999	TAGA	2	8	225786	225793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017999	CGGG	2	8	226945	226952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017999	GCCA	2	8	227985	227992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017999	TCGG	2	8	228064	228071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017999	ATCT	2	8	228145	228152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017999	AGAT	2	8	228253	228260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017999	CGGG	2	8	228752	228759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017999	GAGC	2	8	228856	228863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017999	TACA	2	8	228918	228925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017999	AGTG	2	8	229390	229397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017999	TCGT	2	8	231092	231099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017999	TTGG	2	8	232362	232369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017999	CCGT	2	8	234405	234412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017999	GACT	2	8	236999	237006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017999	CAGC	2	8	237813	237820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017999	GTTG	2	8	237838	237845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017999	CCGT	2	8	242533	242540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017999	GCCG	2	8	242553	242560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017999	GCGA	2	8	242561	242568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017999	ATCT	2	8	242723	242730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017999	AGAT	2	8	242842	242849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017999	GAAT	2	8	245961	245968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017999	GATG	2	8	248817	248824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017999	TCAT	2	8	248883	248890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017999	GTAT	2	8	249725	249732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017999	CGCA	2	8	250944	250951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017999	AGAA	2	8	251110	251117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017999	CAGC	2	8	252372	252379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017999	CCGC	2	8	252394	252401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_017999	TGAC	2	8	252425	252432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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