MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 7185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017999	CGGC	2	8	2164415	2164422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_017999	CTG	2	6	2164458	2164463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017999	CCA	2	6	2164526	2164531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_017999	GCAA	2	8	2164541	2164548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_017999	CGG	2	6	2164570	2164575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017999	ATC	2	6	2164617	2164622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_017999	CA	4	8	2164634	2164641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_017999	CAG	2	6	2164684	2164689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_017999	ACC	2	6	2164743	2164748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_017999	CCCA	2	8	2164766	2164773	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7011	NC_017999	CCA	2	6	2164776	2164781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_017999	CAC	2	6	2164868	2164873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7013	NC_017999	CGCAC	2	10	2164881	2164890	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7014	NC_017999	CA	3	6	2164969	2164974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_017999	CCA	2	6	2164979	2164984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_017999	AGG	2	6	2165011	2165016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017999	TGC	2	6	2165126	2165131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_017999	GT	3	6	2165155	2165160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017999	TCCGA	2	10	2165244	2165253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7020	NC_017999	ATG	2	6	2165350	2165355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017999	TCC	2	6	2165376	2165381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_017999	CGG	2	6	2165392	2165397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_017999	CCA	2	6	2165412	2165417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_017999	CACGA	2	10	2165477	2165486	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7025	NC_017999	GAC	3	9	2165490	2165498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7027	NC_017999	CGT	2	6	2165545	2165550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7030	NC_017999	CTC	2	6	2165794	2165799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_017999	TTC	2	6	2165841	2165846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_017999	GCCC	2	8	2165906	2165913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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7035	NC_017999	GCT	2	6	2166032	2166037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7037	NC_017999	CTG	2	6	2166182	2166187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7039	NC_017999	ACC	2	6	2166370	2166375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7040	NC_017999	GGTC	2	8	2166408	2166415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7042	NC_017999	CAAG	2	8	2166449	2166456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7047	NC_017999	AAG	2	6	2166596	2166601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017999	A	6	6	2166694	2166699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_017999	GTA	2	6	2166700	2166705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7052	NC_017999	GAA	2	6	2166763	2166768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017999	ACA	3	9	2166860	2166868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_017999	ACGG	2	8	2166988	2166995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_017999	CACC	2	8	2167004	2167011	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7056	NC_017999	GCCA	2	8	2167840	2167847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_017999	CGGC	2	8	2167851	2167858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_017999	CGG	2	6	2167955	2167960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_017999	GGA	2	6	2169317	2169322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017999	TCG	2	6	2169378	2169383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_017999	GAAA	2	8	2169464	2169471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017999	AAC	2	6	2170059	2170064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_017999	ATGCCG	2	12	2170080	2170091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_017999	GCTC	2	8	2172956	2172963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7066	NC_017999	GC	3	6	2173052	2173057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7068	NC_017999	GA	3	6	2173094	2173099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_017999	GA	4	8	2173103	2173110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017999	AGA	3	9	2173108	2173116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_017999	CGTTC	2	10	2179834	2179843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7082	NC_017999	GC	3	6	2179850	2179855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7107	NC_017999	AAAAG	2	10	2195070	2195079	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017999	AG	3	6	2195117	2195122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_017999	AGGC	2	8	2196335	2196342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7110	NC_017999	ATC	2	6	2196384	2196389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017999	T	6	6	2196422	2196427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_017999	CT	3	6	2196446	2196451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_017999	TAC	2	6	2196465	2196470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_017999	CG	3	6	2196499	2196504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7117	NC_017999	CTCCCC	2	12	2196614	2196625	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7118	NC_017999	TCCTC	2	10	2196629	2196638	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7119	NC_017999	GC	3	6	2196656	2196661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7120	NC_017999	ACG	2	6	2196666	2196671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7124	NC_017999	GAC	2	6	2198004	2198009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_017999	G	8	8	2198139	2198146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017999	AG	3	6	2198148	2198153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_017999	TAGGA	2	10	2198174	2198183	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017999	CATCCC	2	12	2200660	2200671	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_017999	CAT	2	6	2200723	2200728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7131	NC_017999	CTA	3	9	2200770	2200778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7163	NC_017999	GGC	2	6	2217313	2217318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7164	NC_017999	TG	3	6	2217328	2217333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7165	NC_017999	A	7	7	2219706	2219712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7166	NC_017999	AAC	2	6	2219715	2219720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7167	NC_017999	GT	3	6	2219800	2219805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7168	NC_017999	AAT	2	6	2219875	2219880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7175	NC_017999	GGC	2	6	2222711	2222716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7176	NC_017999	CCGAT	2	10	2222766	2222775	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7177	NC_017999	TTC	2	6	2223413	2223418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7178	NC_017999	GT	3	6	2223430	2223435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7179	NC_017999	AGC	2	6	2223450	2223455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7180	NC_017999	ACA	2	6	2223535	2223540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7181	NC_017999	AT	3	6	2223577	2223582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7182	NC_017999	TGT	4	12	2223585	2223596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7183	NC_017999	TTA	2	6	2223599	2223604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7184	NC_017999	CA	3	6	2223641	2223646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7185	NC_017999	AGG	2	6	2223654	2223659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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